178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1212 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1212  potassium-transporting ATPase subunit C  100 
 
 
198 aa  400  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.152456  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2844  potassium-transporting ATPase subunit C  52.82 
 
 
204 aa  215  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1679  Potassium-transporting ATPase  46.94 
 
 
218 aa  178  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2278  potassium-transporting ATPase, C subunit  43.59 
 
 
193 aa  170  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5613  potassium-transporting ATPase subunit C  45.83 
 
 
193 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0011063  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2324  potassium-transporting ATPase subunit C  45.31 
 
 
193 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3250  potassium-transporting ATPase subunit C  43.22 
 
 
192 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1310  potassium-transporting ATPase subunit C  43.59 
 
 
192 aa  165  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.116474 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2309  potassium-transporting ATPase subunit C  44.79 
 
 
193 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1674  potassium-transporting ATPase subunit C  44.79 
 
 
193 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2286  potassium-transporting ATPase subunit C  44.79 
 
 
193 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104465  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2215  potassium-transporting ATPase subunit C  46.88 
 
 
190 aa  161  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482183  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2055  potassium-transporting ATPase subunit C  43.5 
 
 
193 aa  161  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.792846 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2992  potassium-transporting ATPase subunit C  44.95 
 
 
205 aa  159  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.575111  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2202  potassium-transporting ATPase subunit C  44.79 
 
 
193 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29676  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1668  potassium-transporting ATPase subunit C  44.62 
 
 
189 aa  159  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3384  potassium-transporting ATPase subunit C  41.05 
 
 
204 aa  158  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3269  potassium-transporting ATPase subunit C  41.36 
 
 
207 aa  157  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.24892  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3591  potassium-transporting ATPase subunit C  41.36 
 
 
207 aa  157  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.018979  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1873  potassium-transporting ATPase, C subunit  41.97 
 
 
191 aa  157  7e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2824  potassium-transporting ATPase subunit C  42.05 
 
 
200 aa  157  8e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0040  potassium-transporting ATPase subunit C  41.12 
 
 
203 aa  157  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0196  potassium-transporting ATPase subunit C  43.94 
 
 
201 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.054482  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0664  potassium-transporting ATPase subunit C  43.84 
 
 
201 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11049  potassium-transporting ATPase subunit C  43.32 
 
 
189 aa  154  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1085  potassium-transporting ATPase subunit C  40.93 
 
 
191 aa  154  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0992  potassium-transporting ATPase subunit C  41.97 
 
 
193 aa  154  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1246  potassium-transporting ATPase subunit C  41.03 
 
 
189 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0357  potassium-transporting ATPase, C subunit  38.69 
 
 
220 aa  153  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.029609 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0206  potassium-transporting ATPase subunit C  41.87 
 
 
201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2482  potassium-transporting ATPase, C subunit  42.42 
 
 
189 aa  152  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1023  potassium-transporting ATPase subunit C  42.05 
 
 
193 aa  152  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2291  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  38.97 
 
 
206 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0738481  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4647  potassium-transporting ATPase subunit C  41.41 
 
 
206 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3602  potassium-transporting ATPase, C subunit  41.97 
 
 
196 aa  149  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4993  potassium-transporting ATPase, C subunit  39.27 
 
 
193 aa  148  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0512  potassium-transporting ATPase, C subunit  40.96 
 
 
193 aa  148  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00499959  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2485  potassium-transporting ATPase subunit C  43.65 
 
 
185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0061  potassium-transporting ATPase subunit C  43.65 
 
 
185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0063  potassium-transporting ATPase subunit C  43.65 
 
 
185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1874  potassium-transporting ATPase subunit C  41.03 
 
 
193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1395  potassium-transporting ATPase subunit C  41.03 
 
 
193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.297713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1085  potassium-transporting ATPase subunit C  41.03 
 
 
193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.165884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0782  potassium-transporting ATPase subunit C  41.03 
 
 
193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.489303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1243  potassium-transporting ATPase subunit C  41.03 
 
 
193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1251  potassium-transporting ATPase subunit C  41.03 
 
 
193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.521244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0368  potassium-transporting ATPase subunit C  41.03 
 
 
193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6336  potassium-transporting ATPase subunit C  40.53 
 
 
201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  0.0440126 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3237  potassium-transporting ATPase subunit C  39.39 
 
 
201 aa  145  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433479  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0235  potassium-transporting ATPase subunit C  41.03 
 
 
201 aa  145  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.738564  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2505  K+ transporting ATPase C chain  43.18 
 
 
191 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4532  potassium-transporting ATPase subunit C  40.2 
 
 
193 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.366461  normal  0.330435 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2435  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  42.78 
 
 
189 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324583  normal  0.873018 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5838  potassium-transporting ATPase, C subunit  39.39 
 
 
189 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.217383  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3493  hypothetical protein  42.62 
 
 
180 aa  143  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1225  potassium-transporting ATPase, C subunit  41.41 
 
 
189 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1192  potassium-transporting ATPase subunit C  42.13 
 
 
199 aa  142  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6750  potassium-transporting ATPase, C subunit  40.1 
 
 
189 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.726202  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3778  potassium-transporting ATPase, C subunit  40.93 
 
 
190 aa  141  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.962819  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0723  potassium-transporting ATPase, C subunit  39.58 
 
 
194 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1481  potassium-transporting ATPase, C subunit  43.43 
 
 
205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2606  potassium-transporting ATPase, C subunit  42.27 
 
 
190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0896  potassium-transporting ATPase subunit C  39.2 
 
 
193 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.217239  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0811  potassium-transporting ATPase subunit C  39.7 
 
 
193 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.700672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0705  potassium-transporting ATPase subunit C  39.2 
 
 
193 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0741  potassium-transporting ATPase subunit C  39.2 
 
 
193 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0799  potassium-transporting ATPase subunit C  39.7 
 
 
193 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3411  potassium-transporting ATPase subunit C  38.31 
 
 
201 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0817  potassium-transporting ATPase subunit C  39.2 
 
 
193 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.75663e-53 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1887  potassium-transporting ATPase, C subunit  40.33 
 
 
206 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.201201 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0649  potassium-transporting ATPase subunit C  39.29 
 
 
193 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2234  K+-transporting ATPase, C subunit  40.33 
 
 
206 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3228  potassium-transporting ATPase, C subunit  41.41 
 
 
189 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0180  potassium-transporting ATPase subunit C  39.18 
 
 
201 aa  136  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.923955 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0055  potassium-transporting ATPase, C subunit  37.17 
 
 
185 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1128  potassium-transporting ATPase, C subunit  39.49 
 
 
191 aa  136  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0951  potassium-transporting ATPase subunit C  37.31 
 
 
201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0656  potassium-transporting ATPase subunit C  38.19 
 
 
193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2575  potassium-transporting ATPase, C subunit  40.45 
 
 
197 aa  135  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1887  Potassium-transporting ATPase  38.14 
 
 
218 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0648  potassium-transporting ATPase subunit C  38.69 
 
 
193 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.109219  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1960  potassium-transporting ATPase subunit C  42.78 
 
 
191 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.449884 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1933  potassium-transporting ATPase subunit C  42.78 
 
 
191 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0894  potassium-transporting ATPase, A subunit  41 
 
 
811 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00635984 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1098  potassium-transporting ATPase, C subunit  41.24 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0626  potassium-transporting ATPase subunit C  40.45 
 
 
192 aa  132  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130795  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0065  potassium-transporting ATPase, C subunit  38.95 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1157  potassium-transporting ATPase subunit C  38.86 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.484246  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1104  potassium-transporting ATPase subunit C  39.9 
 
 
200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.58934  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3580  potassium-transporting ATPase subunit C  39.9 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4548  potassium-transporting ATPase subunit C  40.53 
 
 
199 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1157  potassium-transporting ATPase  40.41 
 
 
193 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2851  potassium-transporting ATPase, C subunit  45 
 
 
209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.221351  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1208  potassium-transporting ATPase subunit C  34.18 
 
 
191 aa  127  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2929  potassium-transporting ATPase, C subunit  38.34 
 
 
191 aa  127  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.531992  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3971  potassium-transporting ATPase subunit C  39.15 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0485598  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2382  potassium-transporting ATPase  35.71 
 
 
233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858368  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0893  potassium-transporting ATPase, C subunit  40.94 
 
 
203 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4240  potassium-transporting ATPase, C subunit  38.22 
 
 
196 aa  124  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0862  potassium-transporting ATPase subunit C  35.42 
 
 
194 aa  124  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>