178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2435 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2435  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  100 
 
 
189 aa  384  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324583  normal  0.873018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1225  potassium-transporting ATPase, C subunit  73.4 
 
 
189 aa  301  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2482  potassium-transporting ATPase, C subunit  73.02 
 
 
189 aa  298  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2606  potassium-transporting ATPase, C subunit  69.19 
 
 
190 aa  276  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3228  potassium-transporting ATPase, C subunit  64.71 
 
 
189 aa  261  4e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2824  potassium-transporting ATPase subunit C  54.36 
 
 
200 aa  201  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2324  potassium-transporting ATPase subunit C  55.43 
 
 
193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1085  potassium-transporting ATPase subunit C  52.94 
 
 
191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1674  potassium-transporting ATPase subunit C  54.35 
 
 
193 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2286  potassium-transporting ATPase subunit C  54.35 
 
 
193 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104465  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6750  potassium-transporting ATPase, C subunit  54.59 
 
 
189 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.726202  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2309  potassium-transporting ATPase subunit C  54.35 
 
 
193 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5613  potassium-transporting ATPase subunit C  53.8 
 
 
193 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0011063  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0992  potassium-transporting ATPase subunit C  53.8 
 
 
193 aa  191  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3237  potassium-transporting ATPase subunit C  51 
 
 
201 aa  191  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433479  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2215  potassium-transporting ATPase subunit C  54.5 
 
 
190 aa  191  8e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482183  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1023  potassium-transporting ATPase subunit C  54.89 
 
 
193 aa  188  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1873  potassium-transporting ATPase, C subunit  53.72 
 
 
191 aa  187  5e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0040  potassium-transporting ATPase subunit C  52.15 
 
 
203 aa  187  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1668  potassium-transporting ATPase subunit C  53.26 
 
 
189 aa  187  9e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2202  potassium-transporting ATPase subunit C  54.89 
 
 
193 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29676  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2278  potassium-transporting ATPase, C subunit  51.61 
 
 
193 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1874  potassium-transporting ATPase subunit C  55.43 
 
 
193 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1395  potassium-transporting ATPase subunit C  55.43 
 
 
193 aa  184  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.297713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1085  potassium-transporting ATPase subunit C  55.43 
 
 
193 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.165884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0782  potassium-transporting ATPase subunit C  55.43 
 
 
193 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.489303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1243  potassium-transporting ATPase subunit C  55.43 
 
 
193 aa  184  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1251  potassium-transporting ATPase subunit C  55.43 
 
 
193 aa  184  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.521244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0368  potassium-transporting ATPase subunit C  55.43 
 
 
193 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3778  potassium-transporting ATPase, C subunit  50.54 
 
 
190 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.962819  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1310  potassium-transporting ATPase subunit C  51.06 
 
 
192 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.116474 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4993  potassium-transporting ATPase, C subunit  51.08 
 
 
193 aa  181  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3602  potassium-transporting ATPase, C subunit  53.16 
 
 
196 aa  180  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0357  potassium-transporting ATPase, C subunit  49.46 
 
 
220 aa  178  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.029609 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5838  potassium-transporting ATPase, C subunit  50.27 
 
 
189 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.217383  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0664  potassium-transporting ATPase subunit C  52.04 
 
 
201 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2992  potassium-transporting ATPase subunit C  48.74 
 
 
205 aa  176  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.575111  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0951  potassium-transporting ATPase subunit C  49.25 
 
 
201 aa  175  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2291  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  48.37 
 
 
206 aa  174  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0738481  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3250  potassium-transporting ATPase subunit C  49.47 
 
 
192 aa  174  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6072  K+-transporting ATPase C subunit  49.73 
 
 
191 aa  174  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0235  potassium-transporting ATPase subunit C  47.74 
 
 
201 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.738564  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0206  potassium-transporting ATPase subunit C  48.74 
 
 
201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4647  potassium-transporting ATPase subunit C  47.98 
 
 
206 aa  171  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3384  potassium-transporting ATPase subunit C  50 
 
 
204 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3269  potassium-transporting ATPase subunit C  50.54 
 
 
207 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.24892  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0512  potassium-transporting ATPase, C subunit  46.99 
 
 
193 aa  169  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00499959  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2089  potassium-transporting ATPase, C subunit  51.14 
 
 
195 aa  169  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11049  potassium-transporting ATPase subunit C  50.27 
 
 
189 aa  169  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3411  potassium-transporting ATPase subunit C  46.5 
 
 
201 aa  168  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3591  potassium-transporting ATPase subunit C  49.46 
 
 
207 aa  168  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.018979  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0180  potassium-transporting ATPase subunit C  46.73 
 
 
201 aa  168  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.923955 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2505  K+ transporting ATPase C chain  54.82 
 
 
191 aa  168  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0894  potassium-transporting ATPase, A subunit  51.61 
 
 
811 aa  166  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00635984 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4548  potassium-transporting ATPase subunit C  50.26 
 
 
199 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0196  potassium-transporting ATPase subunit C  45.23 
 
 
201 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.054482  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1098  potassium-transporting ATPase, C subunit  49.2 
 
 
197 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1128  potassium-transporting ATPase, C subunit  46.32 
 
 
191 aa  162  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0055  potassium-transporting ATPase, C subunit  47.57 
 
 
185 aa  162  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04385  potassium-transporting ATPase subunit C  49.17 
 
 
220 aa  161  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.748158  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6336  potassium-transporting ATPase subunit C  48.15 
 
 
201 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  0.0440126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2055  potassium-transporting ATPase subunit C  48.11 
 
 
193 aa  159  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.792846 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1887  Potassium-transporting ATPase  47.06 
 
 
218 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1208  potassium-transporting ATPase subunit C  43.85 
 
 
191 aa  157  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1157  potassium-transporting ATPase  49.74 
 
 
193 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0789  potassium-transporting ATPase subunit C  44.74 
 
 
190 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2234  K+-transporting ATPase, C subunit  49.2 
 
 
206 aa  155  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3493  hypothetical protein  48.57 
 
 
180 aa  155  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1887  potassium-transporting ATPase, C subunit  49.2 
 
 
206 aa  155  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.201201 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4240  potassium-transporting ATPase, C subunit  44.86 
 
 
196 aa  154  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5360  potassium-transporting ATPase subunit C  49.73 
 
 
189 aa  154  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.985584  normal  0.054926 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0799  potassium-transporting ATPase subunit C  44.39 
 
 
193 aa  154  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0065  potassium-transporting ATPase, C subunit  46.07 
 
 
202 aa  154  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0718  potassium-transporting ATPase subunit C  44.21 
 
 
190 aa  153  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.818737 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0743  potassium-transporting ATPase subunit C  44.21 
 
 
190 aa  153  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4532  potassium-transporting ATPase subunit C  42.78 
 
 
193 aa  152  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.366461  normal  0.330435 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0722  potassium-transporting ATPase subunit C  45.79 
 
 
190 aa  152  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1481  potassium-transporting ATPase, C subunit  49.12 
 
 
205 aa  151  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00653  potassium-transporting ATPase subunit C  46.32 
 
 
190 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00644  hypothetical protein  46.32 
 
 
190 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0896  potassium-transporting ATPase subunit C  43.32 
 
 
193 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.217239  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2575  potassium-transporting ATPase, C subunit  50.29 
 
 
197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0649  potassium-transporting ATPase subunit C  42.86 
 
 
193 aa  151  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1246  potassium-transporting ATPase subunit C  42.86 
 
 
189 aa  151  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0648  potassium-transporting ATPase subunit C  42.78 
 
 
193 aa  150  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.109219  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3714  K+-transporting ATPase subunit C  46.86 
 
 
220 aa  150  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389695  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2940  potassium-transporting ATPase, C subunit  43.68 
 
 
190 aa  150  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0811  potassium-transporting ATPase subunit C  42.78 
 
 
193 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.700672  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2960  potassium-transporting ATPase subunit C  43.68 
 
 
190 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0656  potassium-transporting ATPase subunit C  42.78 
 
 
193 aa  150  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0705  potassium-transporting ATPase subunit C  42.78 
 
 
193 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0741  potassium-transporting ATPase subunit C  42.78 
 
 
193 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0817  potassium-transporting ATPase subunit C  42.78 
 
 
193 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.75663e-53 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27040  K+-transporting ATPase, C subunit  47.95 
 
 
222 aa  149  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1933  potassium-transporting ATPase subunit C  43.16 
 
 
191 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1960  potassium-transporting ATPase subunit C  43.16 
 
 
191 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.449884 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0812  potassium-transporting ATPase subunit C  44.74 
 
 
194 aa  148  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112771  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2929  potassium-transporting ATPase, C subunit  46.32 
 
 
191 aa  148  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.531992  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0826  potassium-transporting ATPase subunit C  43.92 
 
 
194 aa  148  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0159409 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0862  potassium-transporting ATPase subunit C  43.92 
 
 
194 aa  148  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>