178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3484 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3484  potassium-transporting ATPase subunit C  100 
 
 
183 aa  357  5e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.744488  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4159  potassium-transporting ATPase subunit C  87.43 
 
 
185 aa  317  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411007  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1709  potassium-transporting ATPase subunit C  87.43 
 
 
185 aa  317  5e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3731  potassium-transporting ATPase subunit C  87.29 
 
 
183 aa  298  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0724088  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2244  potassium-transporting ATPase, C subunit  69.61 
 
 
190 aa  253  8e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.081737  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2049  potassium-transporting ATPase subunit C  69.06 
 
 
204 aa  248  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0553231  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4031  potassium-transporting ATPase subunit C  73.48 
 
 
181 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134737  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43370  potassium-transporting ATPase subunit C  65.36 
 
 
183 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320886  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3638  potassium-transporting ATPase subunit C  64.84 
 
 
183 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3778  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.66 
 
 
190 aa  160  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.962819  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6750  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.92 
 
 
189 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.726202  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0235  potassium-transporting ATPase subunit C  47.5 
 
 
201 aa  156  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.738564  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0180  potassium-transporting ATPase subunit C  48.22 
 
 
201 aa  154  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.923955 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2824  potassium-transporting ATPase subunit C  47.26 
 
 
200 aa  154  7e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0206  potassium-transporting ATPase subunit C  47 
 
 
201 aa  153  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0196  potassium-transporting ATPase subunit C  47 
 
 
201 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.054482  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5838  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.89 
 
 
189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.217383  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4647  potassium-transporting ATPase subunit C  48.24 
 
 
206 aa  151  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0718  potassium-transporting ATPase subunit C  50.54 
 
 
190 aa  148  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.818737 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3237  potassium-transporting ATPase subunit C  48.74 
 
 
201 aa  148  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433479  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3411  potassium-transporting ATPase subunit C  45.69 
 
 
201 aa  148  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0743  potassium-transporting ATPase subunit C  50 
 
 
190 aa  147  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2940  potassium-transporting ATPase, C subunit  50 
 
 
190 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0357  potassium-transporting ATPase, C subunit  52.17 
 
 
220 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.029609 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2960  potassium-transporting ATPase subunit C  50 
 
 
190 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2992  potassium-transporting ATPase subunit C  44.5 
 
 
205 aa  145  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.575111  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0789  potassium-transporting ATPase subunit C  49.46 
 
 
190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0951  potassium-transporting ATPase subunit C  46.5 
 
 
201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1128  potassium-transporting ATPase, C subunit  46.77 
 
 
191 aa  144  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0722  potassium-transporting ATPase subunit C  48.92 
 
 
190 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00653  potassium-transporting ATPase subunit C  48.92 
 
 
190 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00644  hypothetical protein  48.92 
 
 
190 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0862  potassium-transporting ATPase subunit C  48.37 
 
 
194 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0826  potassium-transporting ATPase subunit C  48.37 
 
 
194 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0159409 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0765  potassium-transporting ATPase subunit C  48.37 
 
 
194 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0752  potassium-transporting ATPase subunit C  48.37 
 
 
194 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.369229  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0812  potassium-transporting ATPase subunit C  48.37 
 
 
194 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112771  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2278  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.42 
 
 
193 aa  142  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1246  potassium-transporting ATPase subunit C  46.24 
 
 
189 aa  142  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2234  K+-transporting ATPase, C subunit  50.59 
 
 
206 aa  140  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1887  potassium-transporting ATPase, C subunit  50.59 
 
 
206 aa  140  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.201201 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4240  potassium-transporting ATPase, C subunit  47.57 
 
 
196 aa  140  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0832  potassium-transporting ATPase, C subunit  44.44 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0040  potassium-transporting ATPase subunit C  46.74 
 
 
203 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1208  potassium-transporting ATPase subunit C  48.13 
 
 
191 aa  139  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3384  potassium-transporting ATPase subunit C  45.7 
 
 
204 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2435  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  41.85 
 
 
189 aa  137  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324583  normal  0.873018 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2929  potassium-transporting ATPase, C subunit  47.59 
 
 
191 aa  137  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.531992  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1960  potassium-transporting ATPase subunit C  43.82 
 
 
191 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.449884 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1933  potassium-transporting ATPase subunit C  43.82 
 
 
191 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0664  potassium-transporting ATPase subunit C  44.67 
 
 
201 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1085  potassium-transporting ATPase subunit C  45.21 
 
 
191 aa  134  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6336  potassium-transporting ATPase subunit C  44.44 
 
 
201 aa  134  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  0.0440126 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1466  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.9 
 
 
196 aa  134  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101256  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0204  potassium-transporting ATPase subunit C  41.71 
 
 
214 aa  133  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3846  potassium-transporting ATPase subunit C  43.01 
 
 
202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1481  potassium-transporting ATPase, C subunit  46.47 
 
 
205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04385  potassium-transporting ATPase subunit C  49.73 
 
 
220 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.748158  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2482  potassium-transporting ATPase, C subunit  42.31 
 
 
189 aa  131  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0992  potassium-transporting ATPase subunit C  45.21 
 
 
193 aa  131  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2473  K+-transporting ATPase, C subunit  48.24 
 
 
207 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.469372  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2100  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.24 
 
 
207 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4993  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.94 
 
 
193 aa  130  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0289  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.89 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.238341 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1310  potassium-transporting ATPase subunit C  42.63 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.116474 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1668  potassium-transporting ATPase subunit C  43.09 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3591  potassium-transporting ATPase subunit C  43.55 
 
 
207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.018979  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0656  potassium-transporting ATPase subunit C  39.89 
 
 
193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1157  potassium-transporting ATPase  50.27 
 
 
193 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3269  potassium-transporting ATPase subunit C  43.01 
 
 
207 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.24892  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2606  potassium-transporting ATPase, C subunit  40.98 
 
 
190 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2309  potassium-transporting ATPase subunit C  44.68 
 
 
193 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1225  potassium-transporting ATPase, C subunit  38.8 
 
 
189 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3580  potassium-transporting ATPase subunit C  46.77 
 
 
228 aa  128  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3250  potassium-transporting ATPase subunit C  43.16 
 
 
192 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1157  potassium-transporting ATPase subunit C  46.77 
 
 
216 aa  128  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.484246  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5613  potassium-transporting ATPase subunit C  43.62 
 
 
193 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0011063  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0799  potassium-transporting ATPase subunit C  39.89 
 
 
193 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1104  potassium-transporting ATPase subunit C  46.28 
 
 
200 aa  127  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.58934  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4548  potassium-transporting ATPase subunit C  45.5 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0811  potassium-transporting ATPase subunit C  40 
 
 
193 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.700672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0649  potassium-transporting ATPase subunit C  40 
 
 
193 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0648  potassium-transporting ATPase subunit C  39.46 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.109219  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1023  potassium-transporting ATPase subunit C  44.15 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1674  potassium-transporting ATPase subunit C  44.15 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2324  potassium-transporting ATPase subunit C  43.62 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0817  potassium-transporting ATPase subunit C  40 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.75663e-53 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2286  potassium-transporting ATPase subunit C  44.15 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0896  potassium-transporting ATPase subunit C  40 
 
 
193 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.217239  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2055  potassium-transporting ATPase subunit C  43.68 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.792846 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0705  potassium-transporting ATPase subunit C  40 
 
 
193 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0741  potassium-transporting ATPase subunit C  40 
 
 
193 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367102  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11049  potassium-transporting ATPase subunit C  42.63 
 
 
189 aa  124  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1887  Potassium-transporting ATPase  45.05 
 
 
218 aa  124  9e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1192  potassium-transporting ATPase subunit C  42.86 
 
 
199 aa  123  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3780  potassium-transporting ATPase, C subunit  44.55 
 
 
227 aa  123  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2291  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  45.95 
 
 
206 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0738481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0065  potassium-transporting ATPase, C subunit  40.96 
 
 
202 aa  122  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4532  potassium-transporting ATPase subunit C  38.8 
 
 
193 aa  122  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.366461  normal  0.330435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1098  potassium-transporting ATPase, C subunit  43.32 
 
 
197 aa  121  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>