178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3384 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc3384  potassium-transporting ATPase subunit C  100 
 
 
204 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3269  potassium-transporting ATPase subunit C  81.16 
 
 
207 aa  333  7.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.24892  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3591  potassium-transporting ATPase subunit C  80.68 
 
 
207 aa  330  6e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.018979  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0040  potassium-transporting ATPase subunit C  65.84 
 
 
203 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2291  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  66.33 
 
 
206 aa  252  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0738481  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1085  potassium-transporting ATPase subunit C  66.67 
 
 
191 aa  237  8e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2278  potassium-transporting ATPase, C subunit  63.1 
 
 
193 aa  237  9e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0357  potassium-transporting ATPase, C subunit  63.87 
 
 
220 aa  234  9e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.029609 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4993  potassium-transporting ATPase, C subunit  65.03 
 
 
193 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0992  potassium-transporting ATPase subunit C  65.03 
 
 
193 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1023  potassium-transporting ATPase subunit C  63.93 
 
 
193 aa  228  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5613  potassium-transporting ATPase subunit C  63.93 
 
 
193 aa  228  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0011063  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1674  potassium-transporting ATPase subunit C  64.48 
 
 
193 aa  227  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2309  potassium-transporting ATPase subunit C  63.93 
 
 
193 aa  227  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2324  potassium-transporting ATPase subunit C  63.39 
 
 
193 aa  227  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2286  potassium-transporting ATPase subunit C  64.48 
 
 
193 aa  227  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104465  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1310  potassium-transporting ATPase subunit C  60.43 
 
 
192 aa  226  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.116474 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1668  potassium-transporting ATPase subunit C  59.56 
 
 
189 aa  226  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3602  potassium-transporting ATPase, C subunit  65.78 
 
 
196 aa  224  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3250  potassium-transporting ATPase subunit C  59.89 
 
 
192 aa  222  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1874  potassium-transporting ATPase subunit C  66.67 
 
 
193 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1395  potassium-transporting ATPase subunit C  66.67 
 
 
193 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.297713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1085  potassium-transporting ATPase subunit C  66.67 
 
 
193 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.165884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0782  potassium-transporting ATPase subunit C  66.67 
 
 
193 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.489303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1243  potassium-transporting ATPase subunit C  66.67 
 
 
193 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1251  potassium-transporting ATPase subunit C  66.67 
 
 
193 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.521244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0368  potassium-transporting ATPase subunit C  66.67 
 
 
193 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2202  potassium-transporting ATPase subunit C  64.07 
 
 
193 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29676  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2055  potassium-transporting ATPase subunit C  59.89 
 
 
193 aa  209  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.792846 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1887  potassium-transporting ATPase, C subunit  62.13 
 
 
206 aa  206  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.201201 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2234  K+-transporting ATPase, C subunit  62.13 
 
 
206 aa  206  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0894  potassium-transporting ATPase, A subunit  60 
 
 
811 aa  204  8e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00635984 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2215  potassium-transporting ATPase subunit C  59.68 
 
 
190 aa  201  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482183  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2505  K+ transporting ATPase C chain  61.75 
 
 
191 aa  199  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1246  potassium-transporting ATPase subunit C  53.76 
 
 
189 aa  195  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1873  potassium-transporting ATPase, C subunit  54.95 
 
 
191 aa  194  9e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2473  K+-transporting ATPase, C subunit  59.65 
 
 
207 aa  193  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.469372  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2824  potassium-transporting ATPase subunit C  52.82 
 
 
200 aa  193  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2100  potassium-transporting ATPase, C subunit  59.65 
 
 
207 aa  193  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4647  potassium-transporting ATPase subunit C  51.78 
 
 
206 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0235  potassium-transporting ATPase subunit C  54.59 
 
 
201 aa  191  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.738564  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0893  potassium-transporting ATPase, C subunit  57.95 
 
 
203 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2992  potassium-transporting ATPase subunit C  52.04 
 
 
205 aa  189  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.575111  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0206  potassium-transporting ATPase subunit C  52.55 
 
 
201 aa  188  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3237  potassium-transporting ATPase subunit C  53.37 
 
 
201 aa  186  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433479  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0196  potassium-transporting ATPase subunit C  52.04 
 
 
201 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.054482  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1128  potassium-transporting ATPase, C subunit  53.23 
 
 
191 aa  185  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0180  potassium-transporting ATPase subunit C  52.55 
 
 
201 aa  184  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.923955 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1208  potassium-transporting ATPase subunit C  50.27 
 
 
191 aa  181  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6336  potassium-transporting ATPase subunit C  51.08 
 
 
201 aa  181  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  0.0440126 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0826  potassium-transporting ATPase subunit C  51.61 
 
 
194 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0159409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0752  potassium-transporting ATPase subunit C  51.61 
 
 
194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.369229  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0765  potassium-transporting ATPase subunit C  51.61 
 
 
194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0951  potassium-transporting ATPase subunit C  50.51 
 
 
201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3778  potassium-transporting ATPase, C subunit  53.3 
 
 
190 aa  178  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.962819  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0812  potassium-transporting ATPase subunit C  51.08 
 
 
194 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112771  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0862  potassium-transporting ATPase subunit C  51.08 
 
 
194 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3411  potassium-transporting ATPase subunit C  51.81 
 
 
201 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1157  potassium-transporting ATPase subunit C  50.25 
 
 
216 aa  175  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.484246  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3580  potassium-transporting ATPase subunit C  50.25 
 
 
228 aa  175  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2929  potassium-transporting ATPase, C subunit  55.49 
 
 
191 aa  175  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.531992  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5838  potassium-transporting ATPase, C subunit  52.2 
 
 
189 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.217383  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0789  potassium-transporting ATPase subunit C  52.15 
 
 
190 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0718  potassium-transporting ATPase subunit C  52.69 
 
 
190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.818737 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2940  potassium-transporting ATPase, C subunit  52.69 
 
 
190 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2960  potassium-transporting ATPase subunit C  52.69 
 
 
190 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0743  potassium-transporting ATPase subunit C  52.15 
 
 
190 aa  171  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2435  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  50 
 
 
189 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324583  normal  0.873018 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0722  potassium-transporting ATPase subunit C  51.61 
 
 
190 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00653  potassium-transporting ATPase subunit C  51.61 
 
 
190 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00644  hypothetical protein  51.61 
 
 
190 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2482  potassium-transporting ATPase, C subunit  51.61 
 
 
189 aa  168  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1104  potassium-transporting ATPase subunit C  52.2 
 
 
200 aa  168  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.58934  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6750  potassium-transporting ATPase, C subunit  52.2 
 
 
189 aa  167  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.726202  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2575  potassium-transporting ATPase, C subunit  53.89 
 
 
197 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1225  potassium-transporting ATPase, C subunit  49.46 
 
 
189 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2606  potassium-transporting ATPase, C subunit  49.73 
 
 
190 aa  165  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0664  potassium-transporting ATPase subunit C  51.67 
 
 
201 aa  164  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4548  potassium-transporting ATPase subunit C  51.08 
 
 
199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1157  potassium-transporting ATPase  53.8 
 
 
193 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3228  potassium-transporting ATPase, C subunit  46.77 
 
 
189 aa  159  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1212  potassium-transporting ATPase subunit C  41.05 
 
 
198 aa  158  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.152456  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0512  potassium-transporting ATPase, C subunit  45.7 
 
 
193 aa  157  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00499959  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1481  potassium-transporting ATPase, C subunit  51.19 
 
 
205 aa  157  7e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2049  potassium-transporting ATPase subunit C  46.57 
 
 
204 aa  157  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0553231  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1098  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.35 
 
 
197 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6072  K+-transporting ATPase C subunit  49.46 
 
 
191 aa  156  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5924  potassium-transporting ATPase, C subunit  50.25 
 
 
244 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0799  potassium-transporting ATPase subunit C  42.71 
 
 
193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11049  potassium-transporting ATPase subunit C  46.2 
 
 
189 aa  152  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0055  potassium-transporting ATPase, C subunit  44.86 
 
 
185 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3080  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.11 
 
 
199 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1466  potassium-transporting ATPase, C subunit  49.72 
 
 
196 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101256  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0705  potassium-transporting ATPase subunit C  41.8 
 
 
193 aa  148  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0741  potassium-transporting ATPase subunit C  41.8 
 
 
193 aa  148  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367102  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3246  potassium-transporting ATPase, C subunit  46.91 
 
 
198 aa  148  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0811  potassium-transporting ATPase subunit C  41.75 
 
 
193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.700672  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5360  potassium-transporting ATPase subunit C  49.45 
 
 
189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.985584  normal  0.054926 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0649  potassium-transporting ATPase subunit C  41.27 
 
 
193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0648  potassium-transporting ATPase subunit C  40.62 
 
 
193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.109219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>