178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0235 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0235  potassium-transporting ATPase subunit C  100 
 
 		 201 aa  387  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.738564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0180  potassium-transporting ATPase subunit C  94.53 
 
 		 201 aa  350  8.999999999999999e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.923955 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0206  potassium-transporting ATPase subunit C  82.59 
 
 		 201 aa  337  8e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0951  potassium-transporting ATPase subunit C  80.6 
 
 		 201 aa  323  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0196  potassium-transporting ATPase subunit C  79.6 
 
 		 201 aa  319  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.054482  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2824  potassium-transporting ATPase subunit C  70.5 
 
 		 200 aa  286  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3237  potassium-transporting ATPase subunit C  73.47 
 
 		 201 aa  280  7.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2992  potassium-transporting ATPase subunit C  69.85 
 
 		 205 aa  280  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.575111  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4647  potassium-transporting ATPase subunit C  69.7 
 
 		 206 aa  279  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6336  potassium-transporting ATPase subunit C  70.74 
 
 		 201 aa  274  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  0.0440126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3411  potassium-transporting ATPase subunit C  67.16 
 
 		 201 aa  268  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0664  potassium-transporting ATPase subunit C  70.15 
 
 		 201 aa  265  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4548  potassium-transporting ATPase subunit C  71.81 
 
 		 199 aa  254  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5838  potassium-transporting ATPase, C subunit  61.73 
 
 		 189 aa  237  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.217383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6750  potassium-transporting ATPase, C subunit  63.27 
 
 		 189 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.726202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3778  potassium-transporting ATPase, C subunit  61.93 
 
 		 190 aa  229  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.962819  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1023  potassium-transporting ATPase subunit C  56.57 
 
 		 193 aa  205  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4993  potassium-transporting ATPase, C subunit  58.08 
 
 		 193 aa  202  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1085  potassium-transporting ATPase subunit C  54.46 
 
 		 191 aa  201  5e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5613  potassium-transporting ATPase subunit C  54.04 
 
 		 193 aa  198  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0011063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2309  potassium-transporting ATPase subunit C  54.55 
 
 		 193 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0992  potassium-transporting ATPase subunit C  53.54 
 
 		 193 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2324  potassium-transporting ATPase subunit C  54.55 
 
 		 193 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1310  potassium-transporting ATPase subunit C  51.5 
 
 		 192 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.116474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3250  potassium-transporting ATPase subunit C  51.49 
 
 		 192 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3602  potassium-transporting ATPase, C subunit  59.5 
 
 		 196 aa  193  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1674  potassium-transporting ATPase subunit C  53.54 
 
 		 193 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2286  potassium-transporting ATPase subunit C  53.54 
 
 		 193 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104465  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3269  potassium-transporting ATPase subunit C  53.57 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.24892  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3384  potassium-transporting ATPase subunit C  54.59 
 
 		 204 aa  191  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0512  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.98 
 
 		 193 aa  188  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00499959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3591  potassium-transporting ATPase subunit C  52.55 
 
 		 207 aa  188  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.018979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1481  potassium-transporting ATPase, C subunit  56.67 
 
 		 205 aa  188  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0894  potassium-transporting ATPase, A subunit  52.24 
 
 		 811 aa  188  5.999999999999999e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00635984 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1874  potassium-transporting ATPase subunit C  56.06 
 
 		 193 aa  187  7e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1395  potassium-transporting ATPase subunit C  56.06 
 
 		 193 aa  187  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.297713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1085  potassium-transporting ATPase subunit C  56.06 
 
 		 193 aa  187  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.165884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0782  potassium-transporting ATPase subunit C  56.06 
 
 		 193 aa  187  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.489303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1243  potassium-transporting ATPase subunit C  56.06 
 
 		 193 aa  187  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1251  potassium-transporting ATPase subunit C  56.06 
 
 		 193 aa  187  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.521244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0368  potassium-transporting ATPase subunit C  56.06 
 
 		 193 aa  187  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1873  potassium-transporting ATPase, C subunit  54.04 
 
 		 191 aa  186  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6072  K+-transporting ATPase C subunit  50 
 
 		 191 aa  185  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4240  potassium-transporting ATPase, C subunit  51.27 
 
 		 196 aa  182  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2202  potassium-transporting ATPase subunit C  54.04 
 
 		 193 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29676  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5924  potassium-transporting ATPase, C subunit  56.06 
 
 		 244 aa  181  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2278  potassium-transporting ATPase, C subunit  51.5 
 
 		 193 aa  180  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2215  potassium-transporting ATPase subunit C  52.5 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482183  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2291  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  52.06 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0738481  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2382  potassium-transporting ATPase  51.79 
 
 		 233 aa  179  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1668  potassium-transporting ATPase subunit C  47.98 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0040  potassium-transporting ATPase subunit C  52.04 
 
 		 203 aa  177  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0357  potassium-transporting ATPase, C subunit  53.57 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.029609 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2055  potassium-transporting ATPase subunit C  49 
 
 		 193 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.792846 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2505  K+ transporting ATPase C chain  55.87 
 
 		 191 aa  175  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1157  potassium-transporting ATPase  54.77 
 
 		 193 aa  174  9e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2435  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  47.74 
 
 		 189 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324583  normal  0.873018 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2851  potassium-transporting ATPase, C subunit  53.3 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.221351  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1466  potassium-transporting ATPase, C subunit  51.02 
 
 		 196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5360  potassium-transporting ATPase subunit C  56.63 
 
 		 189 aa  171  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.985584  normal  0.054926 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2575  potassium-transporting ATPase, C subunit  54.44 
 
 		 197 aa  169  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1887  potassium-transporting ATPase, C subunit  50 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.201201 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2234  K+-transporting ATPase, C subunit  50 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2482  potassium-transporting ATPase, C subunit  47.98 
 
 		 189 aa  165  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2089  potassium-transporting ATPase, C subunit  51.34 
 
 		 195 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0649  potassium-transporting ATPase subunit C  45.05 
 
 		 193 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0799  potassium-transporting ATPase subunit C  46 
 
 		 193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2473  K+-transporting ATPase, C subunit  50.75 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.469372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0896  potassium-transporting ATPase subunit C  45.5 
 
 		 193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.217239  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2100  potassium-transporting ATPase, C subunit  50.75 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0811  potassium-transporting ATPase subunit C  45.5 
 
 		 193 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.700672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0817  potassium-transporting ATPase subunit C  45 
 
 		 193 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.75663e-53 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11049  potassium-transporting ATPase subunit C  49.27 
 
 		 189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4159  potassium-transporting ATPase subunit C  50 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1709  potassium-transporting ATPase subunit C  50 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0705  potassium-transporting ATPase subunit C  45 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0741  potassium-transporting ATPase subunit C  45 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367102  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0648  potassium-transporting ATPase subunit C  44.5 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.109219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2606  potassium-transporting ATPase, C subunit  45.37 
 
 		 190 aa  159  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2925  potassium-transporting ATPase, C subunit  54.08 
 
 		 185 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0656  potassium-transporting ATPase subunit C  45 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1246  potassium-transporting ATPase subunit C  47.24 
 
 		 189 aa  159  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0055  potassium-transporting ATPase, C subunit  44.56 
 
 		 185 aa  158  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1128  potassium-transporting ATPase, C subunit  43.94 
 
 		 191 aa  157  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1098  potassium-transporting ATPase, C subunit  44.95 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3484  potassium-transporting ATPase subunit C  47.5 
 
 		 183 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.744488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0862  potassium-transporting ATPase subunit C  46.43 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0826  potassium-transporting ATPase subunit C  46.43 
 
 		 194 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0159409 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1225  potassium-transporting ATPase, C subunit  43.5 
 
 		 189 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0812  potassium-transporting ATPase subunit C  46.43 
 
 		 194 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0752  potassium-transporting ATPase subunit C  46.43 
 
 		 194 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.369229  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0765  potassium-transporting ATPase subunit C  46.43 
 
 		 194 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2049  potassium-transporting ATPase subunit C  46.23 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0553231  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1267  potassium-transporting P-type ATPase C chain, kdpC  53.06 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4532  potassium-transporting ATPase subunit C  44 
 
 		 193 aa  152  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.366461  normal  0.330435 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0743  potassium-transporting ATPase subunit C  45.92 
 
 		 190 aa  152  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0626  potassium-transporting ATPase subunit C  42.78 
 
 		 192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130795  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0718  potassium-transporting ATPase subunit C  45.92 
 
 		 190 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.818737 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3490  potassium-transporting ATPase, C subunit  51.26 
 
 		 199 aa  152  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0438867  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2960  potassium-transporting ATPase subunit C  45.92 
 
 		 190 aa  151  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>