178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2992 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2992  potassium-transporting ATPase subunit C  100 
 
 
205 aa  408  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.575111  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4647  potassium-transporting ATPase subunit C  76.47 
 
 
206 aa  316  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0196  potassium-transporting ATPase subunit C  70.35 
 
 
201 aa  288  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.054482  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3411  potassium-transporting ATPase subunit C  72.36 
 
 
201 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0206  potassium-transporting ATPase subunit C  71.86 
 
 
201 aa  287  6e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3237  potassium-transporting ATPase subunit C  71.57 
 
 
201 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433479  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0235  potassium-transporting ATPase subunit C  69.85 
 
 
201 aa  280  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.738564  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2824  potassium-transporting ATPase subunit C  67.51 
 
 
200 aa  275  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0951  potassium-transporting ATPase subunit C  67.34 
 
 
201 aa  271  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6336  potassium-transporting ATPase subunit C  70.21 
 
 
201 aa  271  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  0.0440126 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0664  potassium-transporting ATPase subunit C  71.94 
 
 
201 aa  267  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4548  potassium-transporting ATPase subunit C  72.87 
 
 
199 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0180  potassium-transporting ATPase subunit C  68.84 
 
 
201 aa  256  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.923955 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5838  potassium-transporting ATPase, C subunit  64.8 
 
 
189 aa  248  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.217383  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6750  potassium-transporting ATPase, C subunit  65.31 
 
 
189 aa  244  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.726202  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3778  potassium-transporting ATPase, C subunit  57.29 
 
 
190 aa  224  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.962819  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4993  potassium-transporting ATPase, C subunit  56.16 
 
 
193 aa  210  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2309  potassium-transporting ATPase subunit C  56.57 
 
 
193 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5613  potassium-transporting ATPase subunit C  56.06 
 
 
193 aa  201  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0011063  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1023  potassium-transporting ATPase subunit C  56.06 
 
 
193 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1310  potassium-transporting ATPase subunit C  54.5 
 
 
192 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.116474 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0992  potassium-transporting ATPase subunit C  53.54 
 
 
193 aa  199  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1085  potassium-transporting ATPase subunit C  52.24 
 
 
191 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1674  potassium-transporting ATPase subunit C  55.56 
 
 
193 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2286  potassium-transporting ATPase subunit C  55.56 
 
 
193 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104465  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2382  potassium-transporting ATPase  55.61 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858368  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2324  potassium-transporting ATPase subunit C  55.05 
 
 
193 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1873  potassium-transporting ATPase, C subunit  54.55 
 
 
191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6072  K+-transporting ATPase C subunit  51.24 
 
 
191 aa  195  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3250  potassium-transporting ATPase subunit C  53.5 
 
 
192 aa  194  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3384  potassium-transporting ATPase subunit C  52.04 
 
 
204 aa  189  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1874  potassium-transporting ATPase subunit C  55.56 
 
 
193 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1395  potassium-transporting ATPase subunit C  55.56 
 
 
193 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.297713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1085  potassium-transporting ATPase subunit C  55.56 
 
 
193 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.165884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0782  potassium-transporting ATPase subunit C  55.56 
 
 
193 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.489303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1243  potassium-transporting ATPase subunit C  55.56 
 
 
193 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1251  potassium-transporting ATPase subunit C  55.56 
 
 
193 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.521244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0368  potassium-transporting ATPase subunit C  55.56 
 
 
193 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1466  potassium-transporting ATPase, C subunit  54.08 
 
 
196 aa  187  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101256  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2278  potassium-transporting ATPase, C subunit  51.5 
 
 
193 aa  186  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2291  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  53.73 
 
 
206 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0738481  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2055  potassium-transporting ATPase subunit C  51.26 
 
 
193 aa  185  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.792846 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2215  potassium-transporting ATPase subunit C  54.5 
 
 
190 aa  184  8e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482183  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3269  potassium-transporting ATPase subunit C  51.53 
 
 
207 aa  184  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.24892  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0512  potassium-transporting ATPase, C subunit  47.45 
 
 
193 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00499959  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4240  potassium-transporting ATPase, C subunit  50.24 
 
 
196 aa  183  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0357  potassium-transporting ATPase, C subunit  52.82 
 
 
220 aa  182  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.029609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11049  potassium-transporting ATPase subunit C  50.75 
 
 
189 aa  182  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3602  potassium-transporting ATPase, C subunit  55.5 
 
 
196 aa  181  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1668  potassium-transporting ATPase subunit C  48.99 
 
 
189 aa  181  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0040  potassium-transporting ATPase subunit C  51.53 
 
 
203 aa  181  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3591  potassium-transporting ATPase subunit C  50.51 
 
 
207 aa  181  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.018979  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1225  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.24 
 
 
189 aa  181  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0894  potassium-transporting ATPase, A subunit  51.76 
 
 
811 aa  181  6e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00635984 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2202  potassium-transporting ATPase subunit C  55.05 
 
 
193 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29676  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1481  potassium-transporting ATPase, C subunit  50.27 
 
 
205 aa  179  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0055  potassium-transporting ATPase, C subunit  49.48 
 
 
185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5924  potassium-transporting ATPase, C subunit  53.5 
 
 
244 aa  177  9e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2482  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.48 
 
 
189 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1157  potassium-transporting ATPase  54.77 
 
 
193 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2435  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  48.74 
 
 
189 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324583  normal  0.873018 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1246  potassium-transporting ATPase subunit C  49.75 
 
 
189 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2606  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.47 
 
 
190 aa  174  8e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2505  K+ transporting ATPase C chain  55.31 
 
 
191 aa  174  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1887  potassium-transporting ATPase, C subunit  49.49 
 
 
206 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.201201 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5360  potassium-transporting ATPase subunit C  55.1 
 
 
189 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.985584  normal  0.054926 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2234  K+-transporting ATPase, C subunit  49.49 
 
 
206 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1128  potassium-transporting ATPase, C subunit  49.49 
 
 
191 aa  171  5.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1098  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.99 
 
 
197 aa  171  7.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0862  potassium-transporting ATPase subunit C  48.98 
 
 
194 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2473  K+-transporting ATPase, C subunit  49.02 
 
 
207 aa  169  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.469372  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2100  potassium-transporting ATPase, C subunit  49.02 
 
 
207 aa  169  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0826  potassium-transporting ATPase subunit C  48.47 
 
 
194 aa  167  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0159409 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0812  potassium-transporting ATPase subunit C  48.47 
 
 
194 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112771  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0718  potassium-transporting ATPase subunit C  48.98 
 
 
190 aa  166  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.818737 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0752  potassium-transporting ATPase subunit C  48.47 
 
 
194 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.369229  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0765  potassium-transporting ATPase subunit C  48.47 
 
 
194 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2940  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.98 
 
 
190 aa  165  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2960  potassium-transporting ATPase subunit C  48.98 
 
 
190 aa  165  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0789  potassium-transporting ATPase subunit C  47.74 
 
 
190 aa  165  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1960  potassium-transporting ATPase subunit C  48.74 
 
 
191 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.449884 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1933  potassium-transporting ATPase subunit C  48.74 
 
 
191 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0743  potassium-transporting ATPase subunit C  48.47 
 
 
190 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2851  potassium-transporting ATPase, C subunit  52.75 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.221351  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2089  potassium-transporting ATPase, C subunit  49.21 
 
 
195 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00653  potassium-transporting ATPase subunit C  47.24 
 
 
190 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00644  hypothetical protein  47.24 
 
 
190 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0722  potassium-transporting ATPase subunit C  46.73 
 
 
190 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0705  potassium-transporting ATPase subunit C  45.45 
 
 
193 aa  161  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0649  potassium-transporting ATPase subunit C  45.45 
 
 
193 aa  161  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0741  potassium-transporting ATPase subunit C  45.45 
 
 
193 aa  161  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0817  potassium-transporting ATPase subunit C  45.45 
 
 
193 aa  161  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.75663e-53 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2575  potassium-transporting ATPase, C subunit  51.4 
 
 
197 aa  161  7e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0648  potassium-transporting ATPase subunit C  45.45 
 
 
193 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.109219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0896  potassium-transporting ATPase subunit C  45.45 
 
 
193 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.217239  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3490  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.73 
 
 
199 aa  160  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0438867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0799  potassium-transporting ATPase subunit C  44.95 
 
 
193 aa  159  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0811  potassium-transporting ATPase subunit C  44.95 
 
 
193 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.700672  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1212  potassium-transporting ATPase subunit C  44.95 
 
 
198 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.152456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0656  potassium-transporting ATPase subunit C  44.95 
 
 
193 aa  159  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>