178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2244 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2244  potassium-transporting ATPase, C subunit  100 
 
 		 190 aa  370  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.081737  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2049  potassium-transporting ATPase subunit C  93.16 
 
 		 204 aa  351  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0553231  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4159  potassium-transporting ATPase subunit C  71.82 
 
 		 185 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1709  potassium-transporting ATPase subunit C  71.82 
 
 		 185 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3484  potassium-transporting ATPase subunit C  69.61 
 
 		 183 aa  253  8e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.744488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4031  potassium-transporting ATPase subunit C  74.03 
 
 		 181 aa  250  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134737  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3731  potassium-transporting ATPase subunit C  72.38 
 
 		 183 aa  238  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0724088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3638  potassium-transporting ATPase subunit C  66.85 
 
 		 183 aa  222  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43370  potassium-transporting ATPase subunit C  65.19 
 
 		 183 aa  218  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1128  potassium-transporting ATPase, C subunit  51.32 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1246  potassium-transporting ATPase subunit C  51.6 
 
 		 189 aa  164  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2929  potassium-transporting ATPase, C subunit  51.7 
 
 		 191 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.531992  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3411  potassium-transporting ATPase subunit C  45.59 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0196  potassium-transporting ATPase subunit C  47.24 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.054482  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3778  potassium-transporting ATPase, C subunit  46.52 
 
 		 190 aa  155  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.962819  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2992  potassium-transporting ATPase subunit C  46.27 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.575111  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2278  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.44 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2824  potassium-transporting ATPase subunit C  46.73 
 
 		 200 aa  151  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0357  potassium-transporting ATPase, C subunit  51.35 
 
 		 220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.029609 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6750  potassium-transporting ATPase, C subunit  49.46 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.726202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0040  potassium-transporting ATPase subunit C  46.56 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5838  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.39 
 
 		 189 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.217383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0180  potassium-transporting ATPase subunit C  47.24 
 
 		 201 aa  148  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.923955 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1668  potassium-transporting ATPase subunit C  45.74 
 
 		 189 aa  148  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0235  potassium-transporting ATPase subunit C  45.73 
 
 		 201 aa  147  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.738564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4240  potassium-transporting ATPase, C subunit  50.27 
 
 		 196 aa  147  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3384  potassium-transporting ATPase subunit C  47.59 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0765  potassium-transporting ATPase subunit C  47.85 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1208  potassium-transporting ATPase subunit C  46.24 
 
 		 191 aa  146  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0826  potassium-transporting ATPase subunit C  47.85 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0159409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0752  potassium-transporting ATPase subunit C  47.85 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.369229  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0862  potassium-transporting ATPase subunit C  47.85 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0812  potassium-transporting ATPase subunit C  47.85 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0722  potassium-transporting ATPase subunit C  48.92 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00653  potassium-transporting ATPase subunit C  48.92 
 
 		 190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00644  hypothetical protein  48.92 
 
 		 190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0743  potassium-transporting ATPase subunit C  48.94 
 
 		 190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2940  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.94 
 
 		 190 aa  144  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2960  potassium-transporting ATPase subunit C  48.94 
 
 		 190 aa  144  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3237  potassium-transporting ATPase subunit C  45.96 
 
 		 201 aa  145  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0718  potassium-transporting ATPase subunit C  48.94 
 
 		 190 aa  144  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.818737 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0206  potassium-transporting ATPase subunit C  45.73 
 
 		 201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0789  potassium-transporting ATPase subunit C  48.39 
 
 		 190 aa  142  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1310  potassium-transporting ATPase subunit C  44.21 
 
 		 192 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.116474 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3580  potassium-transporting ATPase subunit C  51.6 
 
 		 228 aa  141  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1157  potassium-transporting ATPase subunit C  51.6 
 
 		 216 aa  141  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.484246  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1104  potassium-transporting ATPase subunit C  51.6 
 
 		 200 aa  141  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.58934  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4647  potassium-transporting ATPase subunit C  44.22 
 
 		 206 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1085  potassium-transporting ATPase subunit C  45.26 
 
 		 191 aa  140  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4993  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.42 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1157  potassium-transporting ATPase  52.63 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0799  potassium-transporting ATPase subunit C  41.4 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0656  potassium-transporting ATPase subunit C  41.4 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1481  potassium-transporting ATPase, C subunit  47.13 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2309  potassium-transporting ATPase subunit C  45.21 
 
 		 193 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3591  potassium-transporting ATPase subunit C  45.99 
 
 		 207 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.018979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3269  potassium-transporting ATPase subunit C  45.45 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.24892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1674  potassium-transporting ATPase subunit C  45.21 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0289  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.39 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238341 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2286  potassium-transporting ATPase subunit C  45.21 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104465  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0951  potassium-transporting ATPase subunit C  44.72 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2482  potassium-transporting ATPase, C subunit  43.48 
 
 		 189 aa  135  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0664  potassium-transporting ATPase subunit C  45.23 
 
 		 201 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0648  potassium-transporting ATPase subunit C  38.3 
 
 		 193 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.109219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2435  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  42.78 
 
 		 189 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324583  normal  0.873018 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1960  potassium-transporting ATPase subunit C  44.09 
 
 		 191 aa  134  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.449884 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1933  potassium-transporting ATPase subunit C  44.09 
 
 		 191 aa  134  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3602  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.42 
 
 		 196 aa  134  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2291  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  45.95 
 
 		 206 aa  134  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0738481  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3846  potassium-transporting ATPase subunit C  43.78 
 
 		 202 aa  134  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0992  potassium-transporting ATPase subunit C  43.62 
 
 		 193 aa  134  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0811  potassium-transporting ATPase subunit C  38.83 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.700672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0896  potassium-transporting ATPase subunit C  38.83 
 
 		 193 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.217239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4532  potassium-transporting ATPase subunit C  38.17 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.366461  normal  0.330435 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5613  potassium-transporting ATPase subunit C  43.09 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0011063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3250  potassium-transporting ATPase subunit C  43.16 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6072  K+-transporting ATPase C subunit  45.16 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0817  potassium-transporting ATPase subunit C  38.3 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.75663e-53 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0065  potassium-transporting ATPase, C subunit  39.69 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0832  potassium-transporting ATPase, C subunit  43.33 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0705  potassium-transporting ATPase subunit C  38.3 
 
 		 193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0741  potassium-transporting ATPase subunit C  38.3 
 
 		 193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367102  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1225  potassium-transporting ATPase, C subunit  39.13 
 
 		 189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2324  potassium-transporting ATPase subunit C  42.55 
 
 		 193 aa  131  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0649  potassium-transporting ATPase subunit C  37.77 
 
 		 193 aa  131  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2606  potassium-transporting ATPase, C subunit  41.53 
 
 		 190 aa  131  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04385  potassium-transporting ATPase subunit C  47.25 
 
 		 220 aa  130  7.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.748158  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1023  potassium-transporting ATPase subunit C  43.09 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0055  potassium-transporting ATPase, C subunit  43.48 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1887  Potassium-transporting ATPase  42.35 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3493  hypothetical protein  44.58 
 
 		 180 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2234  K+-transporting ATPase, C subunit  45.03 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1887  potassium-transporting ATPase, C subunit  45.03 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.201201 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1466  potassium-transporting ATPase, C subunit  46.11 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1098  potassium-transporting ATPase, C subunit  42.25 
 
 		 197 aa  127  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0204  potassium-transporting ATPase subunit C  39.02 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3228  potassium-transporting ATPase, C subunit  41.3 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2215  potassium-transporting ATPase subunit C  46.32 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482183  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3971  potassium-transporting ATPase subunit C  40.66 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0485598  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1216  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.95 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.551367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>