178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1216 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1216  potassium-transporting ATPase, C subunit  100 
 
 		 194 aa  386  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.551367  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1128  potassium-transporting ATPase, C subunit  64.4 
 
 		 191 aa  241  7e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2929  potassium-transporting ATPase, C subunit  64.4 
 
 		 191 aa  236  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.531992  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1246  potassium-transporting ATPase subunit C  57.53 
 
 		 189 aa  205  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00653  potassium-transporting ATPase subunit C  55.08 
 
 		 190 aa  191  8e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00644  hypothetical protein  55.08 
 
 		 190 aa  191  8e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0722  potassium-transporting ATPase subunit C  54.55 
 
 		 190 aa  190  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0862  potassium-transporting ATPase subunit C  55.32 
 
 		 194 aa  188  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0826  potassium-transporting ATPase subunit C  55.32 
 
 		 194 aa  187  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0159409 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0765  potassium-transporting ATPase subunit C  55.32 
 
 		 194 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0752  potassium-transporting ATPase subunit C  55.32 
 
 		 194 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.369229  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0812  potassium-transporting ATPase subunit C  55.32 
 
 		 194 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0789  potassium-transporting ATPase subunit C  54.01 
 
 		 190 aa  186  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2940  potassium-transporting ATPase, C subunit  53.48 
 
 		 190 aa  184  9e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2960  potassium-transporting ATPase subunit C  53.48 
 
 		 190 aa  184  9e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1157  potassium-transporting ATPase subunit C  57.14 
 
 		 216 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.484246  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3580  potassium-transporting ATPase subunit C  57.14 
 
 		 228 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1104  potassium-transporting ATPase subunit C  57.45 
 
 		 200 aa  182  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.58934  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0743  potassium-transporting ATPase subunit C  52.94 
 
 		 190 aa  182  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0718  potassium-transporting ATPase subunit C  53.48 
 
 		 190 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.818737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0040  potassium-transporting ATPase subunit C  53.01 
 
 		 203 aa  173  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1668  potassium-transporting ATPase subunit C  51.37 
 
 		 189 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1208  potassium-transporting ATPase subunit C  48.95 
 
 		 191 aa  169  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3237  potassium-transporting ATPase subunit C  47.5 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6072  K+-transporting ATPase C subunit  47.57 
 
 		 191 aa  167  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2606  potassium-transporting ATPase, C subunit  47.34 
 
 		 190 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3778  potassium-transporting ATPase, C subunit  45.7 
 
 		 190 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.962819  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4993  potassium-transporting ATPase, C subunit  51.91 
 
 		 193 aa  165  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5613  potassium-transporting ATPase subunit C  49.73 
 
 		 193 aa  165  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0011063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3269  potassium-transporting ATPase subunit C  50.82 
 
 		 207 aa  164  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.24892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2324  potassium-transporting ATPase subunit C  50.27 
 
 		 193 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3591  potassium-transporting ATPase subunit C  50.27 
 
 		 207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.018979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1310  potassium-transporting ATPase subunit C  48.37 
 
 		 192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.116474 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1023  potassium-transporting ATPase subunit C  50.27 
 
 		 193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3602  potassium-transporting ATPase, C subunit  54.34 
 
 		 196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2291  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  51.91 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0738481  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2278  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.94 
 
 		 193 aa  162  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2382  potassium-transporting ATPase  48.4 
 
 		 233 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2309  potassium-transporting ATPase subunit C  49.18 
 
 		 193 aa  161  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3493  hypothetical protein  53.45 
 
 		 180 aa  160  8.000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2992  potassium-transporting ATPase subunit C  47.29 
 
 		 205 aa  160  9e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.575111  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2215  potassium-transporting ATPase subunit C  51.08 
 
 		 190 aa  159  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482183  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0055  potassium-transporting ATPase, C subunit  47.85 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0357  potassium-transporting ATPase, C subunit  51.35 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.029609 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1873  potassium-transporting ATPase, C subunit  46.52 
 
 		 191 aa  159  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2505  K+ transporting ATPase C chain  53.49 
 
 		 191 aa  159  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0992  potassium-transporting ATPase subunit C  49.18 
 
 		 193 aa  159  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1085  potassium-transporting ATPase subunit C  49.73 
 
 		 191 aa  158  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1674  potassium-transporting ATPase subunit C  48.63 
 
 		 193 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2286  potassium-transporting ATPase subunit C  48.63 
 
 		 193 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104465  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1098  potassium-transporting ATPase, C subunit  46.19 
 
 		 197 aa  158  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3250  potassium-transporting ATPase subunit C  47.83 
 
 		 192 aa  157  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1225  potassium-transporting ATPase, C subunit  42.86 
 
 		 189 aa  157  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2049  potassium-transporting ATPase subunit C  48.69 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0553231  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2824  potassium-transporting ATPase subunit C  45.36 
 
 		 200 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1874  potassium-transporting ATPase subunit C  52.66 
 
 		 193 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1395  potassium-transporting ATPase subunit C  52.66 
 
 		 193 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.297713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1085  potassium-transporting ATPase subunit C  52.66 
 
 		 193 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.165884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0782  potassium-transporting ATPase subunit C  52.66 
 
 		 193 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.489303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1243  potassium-transporting ATPase subunit C  52.66 
 
 		 193 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1251  potassium-transporting ATPase subunit C  52.66 
 
 		 193 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.521244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0368  potassium-transporting ATPase subunit C  52.66 
 
 		 193 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0196  potassium-transporting ATPase subunit C  46.7 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.054482  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2202  potassium-transporting ATPase subunit C  51.79 
 
 		 193 aa  155  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29676  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3411  potassium-transporting ATPase subunit C  44 
 
 		 201 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3384  potassium-transporting ATPase subunit C  47.25 
 
 		 204 aa  154  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0664  potassium-transporting ATPase subunit C  45.73 
 
 		 201 aa  154  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5838  potassium-transporting ATPase, C subunit  43.62 
 
 		 189 aa  154  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.217383  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2244  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.95 
 
 		 190 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.081737  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6750  potassium-transporting ATPase, C subunit  44.68 
 
 		 189 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.726202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1157  potassium-transporting ATPase  50.79 
 
 		 193 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0206  potassium-transporting ATPase subunit C  45.23 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0235  potassium-transporting ATPase subunit C  46.19 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.738564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4647  potassium-transporting ATPase subunit C  44 
 
 		 206 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2055  potassium-transporting ATPase subunit C  46.77 
 
 		 193 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.792846 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2482  potassium-transporting ATPase, C subunit  45.7 
 
 		 189 aa  149  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0512  potassium-transporting ATPase, C subunit  41.58 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00499959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2435  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  43.68 
 
 		 189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324583  normal  0.873018 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3638  potassium-transporting ATPase subunit C  51.79 
 
 		 183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1887  Potassium-transporting ATPase  46.45 
 
 		 218 aa  145  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11049  potassium-transporting ATPase subunit C  44.44 
 
 		 189 aa  145  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1481  potassium-transporting ATPase, C subunit  49.13 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0951  potassium-transporting ATPase subunit C  44.67 
 
 		 201 aa  142  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0180  potassium-transporting ATPase subunit C  45.64 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.923955 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2234  K+-transporting ATPase, C subunit  48.54 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1887  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.54 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.201201 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43370  potassium-transporting ATPase subunit C  50 
 
 		 183 aa  141  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4159  potassium-transporting ATPase subunit C  47.57 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1709  potassium-transporting ATPase subunit C  47.57 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0894  potassium-transporting ATPase, A subunit  48.8 
 
 		 811 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00635984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3484  potassium-transporting ATPase subunit C  45.95 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.744488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6336  potassium-transporting ATPase subunit C  41.49 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  0.0440126 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2575  potassium-transporting ATPase, C subunit  44.58 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3228  potassium-transporting ATPase, C subunit  43.55 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3080  potassium-transporting ATPase, C subunit  44.44 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2473  K+-transporting ATPase, C subunit  47.34 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.469372  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2100  potassium-transporting ATPase, C subunit  47.34 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4240  potassium-transporting ATPase, C subunit  43.01 
 
 		 196 aa  134  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1192  potassium-transporting ATPase subunit C  42.49 
 
 		 199 aa  134  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3971  potassium-transporting ATPase subunit C  43.46 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0485598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>