178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0602 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0602  K transporting ATPase KdpC subunit  100 
 
 
302 aa  593  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3285  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  66.55 
 
 
298 aa  367  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00212969  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1438  K transporting ATPase KdpC subunit  59.93 
 
 
309 aa  339  4e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5031  K transporting ATPase KdpC subunit  61.9 
 
 
288 aa  333  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4761  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  62.76 
 
 
285 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203467  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0435  K+-transporting ATPase c chain-like protein  63.05 
 
 
290 aa  311  7.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4228  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  59.73 
 
 
289 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4294  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  59.73 
 
 
289 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4606  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  59.73 
 
 
289 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6789  potassium-transporting ATPase, C subunit  50 
 
 
216 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.160019 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0204  potassium-transporting ATPase subunit C  32.19 
 
 
214 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27040  K+-transporting ATPase, C subunit  59.3 
 
 
222 aa  94.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1512  potassium-transporting ATPase, C subunit  54.07 
 
 
203 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1873  potassium-transporting ATPase, C subunit  54.26 
 
 
191 aa  90.9  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0512  potassium-transporting ATPase, C subunit  53.75 
 
 
193 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00499959  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1018  potassium-transporting ATPase, C subunit  53.33 
 
 
196 aa  90.1  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.54573  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2992  potassium-transporting ATPase subunit C  56.79 
 
 
205 aa  89.7  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.575111  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2482  potassium-transporting ATPase, C subunit  53.33 
 
 
189 aa  89  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1225  potassium-transporting ATPase, C subunit  50.56 
 
 
189 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3237  potassium-transporting ATPase subunit C  58.82 
 
 
201 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433479  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0196  potassium-transporting ATPase subunit C  55.95 
 
 
201 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.054482  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4090  Potassium-transporting ATPase  60 
 
 
210 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4647  potassium-transporting ATPase subunit C  58.11 
 
 
206 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0664  potassium-transporting ATPase subunit C  64.38 
 
 
201 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0065  potassium-transporting ATPase, C subunit  57.33 
 
 
202 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1212  potassium-transporting ATPase subunit C  45.98 
 
 
198 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.152456  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2089  potassium-transporting ATPase, C subunit  60.81 
 
 
195 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1098  potassium-transporting ATPase, C subunit  61.33 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3229  Potassium-transporting ATPase  61.64 
 
 
183 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0235  potassium-transporting ATPase subunit C  52.81 
 
 
201 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.738564  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1023  potassium-transporting ATPase subunit C  61.11 
 
 
193 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3602  potassium-transporting ATPase, C subunit  62.03 
 
 
196 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11049  potassium-transporting ATPase subunit C  51.61 
 
 
189 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0951  potassium-transporting ATPase subunit C  52.22 
 
 
201 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0206  potassium-transporting ATPase subunit C  53.57 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3780  potassium-transporting ATPase, C subunit  58.44 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3246  potassium-transporting ATPase, C subunit  57.69 
 
 
198 aa  82  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2435  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  51.69 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324583  normal  0.873018 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5924  potassium-transporting ATPase, C subunit  58.57 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3384  potassium-transporting ATPase subunit C  54.76 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2824  potassium-transporting ATPase subunit C  53.09 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0180  potassium-transporting ATPase subunit C  49.02 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.923955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1877  potassium-transporting ATPase, C subunit  37.76 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.571443  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4240  potassium-transporting ATPase, C subunit  53.57 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1310  potassium-transporting ATPase subunit C  57.53 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.116474 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1874  potassium-transporting ATPase subunit C  58.33 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1395  potassium-transporting ATPase subunit C  58.33 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.297713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1085  potassium-transporting ATPase subunit C  58.33 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.165884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0782  potassium-transporting ATPase subunit C  58.33 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.489303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1243  potassium-transporting ATPase subunit C  58.33 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1251  potassium-transporting ATPase subunit C  58.33 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.521244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0368  potassium-transporting ATPase subunit C  58.33 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0289  potassium-transporting ATPase, C subunit  53.95 
 
 
216 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.238341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0723  potassium-transporting ATPase, C subunit  56.34 
 
 
194 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3250  potassium-transporting ATPase subunit C  57.53 
 
 
192 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1466  potassium-transporting ATPase, C subunit  58.11 
 
 
196 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101256  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3591  potassium-transporting ATPase subunit C  52.17 
 
 
207 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.018979  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2606  potassium-transporting ATPase, C subunit  50.59 
 
 
190 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3269  potassium-transporting ATPase subunit C  51.09 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.24892  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2278  potassium-transporting ATPase, C subunit  53.42 
 
 
193 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2202  potassium-transporting ATPase subunit C  58.33 
 
 
193 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29676  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2324  potassium-transporting ATPase subunit C  58.33 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2291  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  58.9 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0738481  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1674  potassium-transporting ATPase subunit C  58.33 
 
 
193 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2575  potassium-transporting ATPase, C subunit  52.94 
 
 
197 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2286  potassium-transporting ATPase subunit C  58.33 
 
 
193 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104465  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1679  Potassium-transporting ATPase  50 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0894  potassium-transporting ATPase, A subunit  53.09 
 
 
811 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00635984 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4993  potassium-transporting ATPase, C subunit  58.02 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0992  potassium-transporting ATPase subunit C  59.72 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2055  potassium-transporting ATPase subunit C  54.43 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.792846 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2844  potassium-transporting ATPase subunit C  39.52 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3846  potassium-transporting ATPase subunit C  51.35 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3228  potassium-transporting ATPase, C subunit  45.98 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2309  potassium-transporting ATPase subunit C  56.94 
 
 
193 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5613  potassium-transporting ATPase subunit C  56.94 
 
 
193 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0011063  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5838  potassium-transporting ATPase, C subunit  55.56 
 
 
189 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.217383  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3778  potassium-transporting ATPase, C subunit  52.86 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.962819  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0832  potassium-transporting ATPase, C subunit  50 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6750  potassium-transporting ATPase, C subunit  56.94 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.726202  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0040  potassium-transporting ATPase subunit C  57.53 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1887  potassium-transporting ATPase, C subunit  47.83 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.201201 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2234  K+-transporting ATPase, C subunit  47.83 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3411  potassium-transporting ATPase subunit C  51.85 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0896  potassium-transporting ATPase subunit C  44.05 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.217239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0656  potassium-transporting ATPase subunit C  49.32 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1887  Potassium-transporting ATPase  50.67 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2505  K+ transporting ATPase C chain  51.22 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0811  potassium-transporting ATPase subunit C  44.05 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.700672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0648  potassium-transporting ATPase subunit C  44.05 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.109219  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2215  potassium-transporting ATPase subunit C  54.95 
 
 
190 aa  72  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482183  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1085  potassium-transporting ATPase subunit C  50 
 
 
191 aa  71.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0357  potassium-transporting ATPase, C subunit  49.46 
 
 
220 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.029609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0799  potassium-transporting ATPase subunit C  47.95 
 
 
193 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2929  potassium-transporting ATPase, C subunit  45.45 
 
 
191 aa  72  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.531992  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1706  potassium-transporting ATPase, C subunit  56.52 
 
 
193 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.341936 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0649  potassium-transporting ATPase subunit C  42.86 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2851  potassium-transporting ATPase, C subunit  52.05 
 
 
209 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.221351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0817  potassium-transporting ATPase subunit C  42.86 
 
 
193 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.75663e-53 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2382  potassium-transporting ATPase  56.79 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858368  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>