178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1984 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1984  potassium-transporting ATPase subunit C  100 
 
 
186 aa  377  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0143266  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0379  potassium-transporting ATPase subunit C  66.67 
 
 
186 aa  262  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00405632  normal  0.0357921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0065  potassium-transporting ATPase, C subunit  61.83 
 
 
202 aa  236  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3614  potassium-transporting ATPase, C subunit  53.48 
 
 
187 aa  207  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  hitchhiker  0.000228688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2506  potassium-transporting ATPase, C subunit  52.94 
 
 
188 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.318419  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1973  potassium-transporting ATPase subunit C  53.8 
 
 
183 aa  189  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1153  potassium-transporting ATPase subunit C  48.91 
 
 
194 aa  177  5.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0117976 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0649  potassium-transporting ATPase subunit C  47.87 
 
 
193 aa  156  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0896  potassium-transporting ATPase subunit C  48.4 
 
 
193 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.217239  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0811  potassium-transporting ATPase subunit C  48.4 
 
 
193 aa  155  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.700672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0817  potassium-transporting ATPase subunit C  47.34 
 
 
193 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.75663e-53 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0705  potassium-transporting ATPase subunit C  47.34 
 
 
193 aa  154  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0741  potassium-transporting ATPase subunit C  47.34 
 
 
193 aa  154  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367102  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0648  potassium-transporting ATPase subunit C  46.81 
 
 
193 aa  153  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.109219  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0894  potassium-transporting ATPase, A subunit  50.3 
 
 
811 aa  153  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00635984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3602  potassium-transporting ATPase, C subunit  50.3 
 
 
196 aa  153  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0799  potassium-transporting ATPase subunit C  48.4 
 
 
193 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4532  potassium-transporting ATPase subunit C  47.87 
 
 
193 aa  152  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.366461  normal  0.330435 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0656  potassium-transporting ATPase subunit C  45.74 
 
 
193 aa  150  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2435  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  46.28 
 
 
189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324583  normal  0.873018 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1887  Potassium-transporting ATPase  45.51 
 
 
218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1481  potassium-transporting ATPase, C subunit  45.12 
 
 
205 aa  144  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2482  potassium-transporting ATPase, C subunit  46.49 
 
 
189 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0357  potassium-transporting ATPase, C subunit  43.39 
 
 
220 aa  142  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.029609 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1085  potassium-transporting ATPase subunit C  43.16 
 
 
191 aa  142  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2278  potassium-transporting ATPase, C subunit  45.03 
 
 
193 aa  140  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2575  potassium-transporting ATPase, C subunit  44.12 
 
 
197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1225  potassium-transporting ATPase, C subunit  42.55 
 
 
189 aa  138  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11049  potassium-transporting ATPase subunit C  42.33 
 
 
189 aa  137  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2606  potassium-transporting ATPase, C subunit  42.19 
 
 
190 aa  136  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3778  potassium-transporting ATPase, C subunit  43.62 
 
 
190 aa  135  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.962819  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0196  potassium-transporting ATPase subunit C  40.59 
 
 
201 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.054482  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5838  potassium-transporting ATPase, C subunit  41.18 
 
 
189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.217383  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3237  potassium-transporting ATPase subunit C  40.93 
 
 
201 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433479  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2234  K+-transporting ATPase, C subunit  46.11 
 
 
206 aa  132  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1887  potassium-transporting ATPase, C subunit  46.11 
 
 
206 aa  132  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.201201 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0626  potassium-transporting ATPase subunit C  40.76 
 
 
192 aa  132  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130795  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0040  potassium-transporting ATPase subunit C  43.78 
 
 
203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6750  potassium-transporting ATPase, C subunit  41.18 
 
 
189 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.726202  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0992  potassium-transporting ATPase subunit C  44.74 
 
 
193 aa  131  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2291  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  42.46 
 
 
206 aa  131  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0738481  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2824  potassium-transporting ATPase subunit C  38 
 
 
200 aa  131  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0235  potassium-transporting ATPase subunit C  41.58 
 
 
201 aa  131  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.738564  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2992  potassium-transporting ATPase subunit C  41.58 
 
 
205 aa  131  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.575111  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4993  potassium-transporting ATPase, C subunit  41.8 
 
 
193 aa  130  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0253  Potassium-transporting ATPase  37.16 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2309  potassium-transporting ATPase subunit C  43.68 
 
 
193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4647  potassium-transporting ATPase subunit C  39.41 
 
 
206 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0512  potassium-transporting ATPase, C subunit  39.04 
 
 
193 aa  129  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00499959  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2473  K+-transporting ATPase, C subunit  48.21 
 
 
207 aa  129  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.469372  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2100  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.21 
 
 
207 aa  129  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3228  potassium-transporting ATPase, C subunit  42.55 
 
 
189 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1674  potassium-transporting ATPase subunit C  44.21 
 
 
193 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2286  potassium-transporting ATPase subunit C  44.21 
 
 
193 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104465  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1668  potassium-transporting ATPase subunit C  42.02 
 
 
189 aa  127  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1098  potassium-transporting ATPase, C subunit  42.02 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3269  potassium-transporting ATPase subunit C  40.96 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.24892  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0180  potassium-transporting ATPase subunit C  40.1 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.923955 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3080  potassium-transporting ATPase, C subunit  40 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1310  potassium-transporting ATPase subunit C  42.78 
 
 
192 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.116474 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1873  potassium-transporting ATPase, C subunit  42.7 
 
 
191 aa  125  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3411  potassium-transporting ATPase subunit C  38.5 
 
 
201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3250  potassium-transporting ATPase subunit C  42.49 
 
 
192 aa  124  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0206  potassium-transporting ATPase subunit C  39.11 
 
 
201 aa  124  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3384  potassium-transporting ATPase subunit C  40.96 
 
 
204 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1933  potassium-transporting ATPase subunit C  42.05 
 
 
191 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5613  potassium-transporting ATPase subunit C  42.11 
 
 
193 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0011063  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1960  potassium-transporting ATPase subunit C  42.05 
 
 
191 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.449884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0664  potassium-transporting ATPase subunit C  41.81 
 
 
201 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0862  potassium-transporting ATPase subunit C  38.92 
 
 
194 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1023  potassium-transporting ATPase subunit C  42.11 
 
 
193 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2202  potassium-transporting ATPase subunit C  44.79 
 
 
193 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29676  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1466  potassium-transporting ATPase, C subunit  38.38 
 
 
196 aa  122  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101256  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3591  potassium-transporting ATPase subunit C  40.43 
 
 
207 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.018979  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2324  potassium-transporting ATPase subunit C  41.36 
 
 
193 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0826  potassium-transporting ATPase subunit C  38.38 
 
 
194 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0159409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0752  potassium-transporting ATPase subunit C  38.38 
 
 
194 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.369229  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0701  potassium-transporting ATPase, C subunit, putative  38.17 
 
 
202 aa  121  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0765  potassium-transporting ATPase subunit C  38.38 
 
 
194 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2215  potassium-transporting ATPase subunit C  40.31 
 
 
190 aa  120  8e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482183  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3493  hypothetical protein  34.78 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0789  potassium-transporting ATPase subunit C  40.76 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1246  potassium-transporting ATPase subunit C  41.05 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0812  potassium-transporting ATPase subunit C  37.84 
 
 
194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112771  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6072  K+-transporting ATPase C subunit  37.5 
 
 
191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1874  potassium-transporting ATPase subunit C  43.56 
 
 
193 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1395  potassium-transporting ATPase subunit C  43.56 
 
 
193 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.297713  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0718  potassium-transporting ATPase subunit C  40.43 
 
 
190 aa  119  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.818737 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1085  potassium-transporting ATPase subunit C  43.56 
 
 
193 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.165884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0782  potassium-transporting ATPase subunit C  43.56 
 
 
193 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.489303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1243  potassium-transporting ATPase subunit C  43.56 
 
 
193 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1251  potassium-transporting ATPase subunit C  43.56 
 
 
193 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.521244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0368  potassium-transporting ATPase subunit C  43.56 
 
 
193 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3714  K+-transporting ATPase subunit C  39.66 
 
 
220 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389695  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04385  potassium-transporting ATPase subunit C  37.36 
 
 
220 aa  118  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.748158  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0743  potassium-transporting ATPase subunit C  39.89 
 
 
190 aa  118  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3846  potassium-transporting ATPase subunit C  37.44 
 
 
202 aa  117  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2505  K+ transporting ATPase C chain  41.42 
 
 
191 aa  117  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2055  potassium-transporting ATPase subunit C  41.84 
 
 
193 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.792846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2960  potassium-transporting ATPase subunit C  39.89 
 
 
190 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>