84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2284 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2284  sodium/glutamate symporter  100 
 
 		 404 aa  796    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0465087  normal  0.066844 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1590  sodium/glutamate symporter  100 
 
 		 404 aa  796    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5033  sodium/glutamate symporter  71.99 
 
 		 409 aa  541  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0319  sodium/glutamate symporter  57.72 
 
 		 424 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.321863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2080  sodium/glutamate symporter  58.67 
 
 		 424 aa  444  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2020  sodium/glutamate symporter  61.17 
 
 		 412 aa  428  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.733127  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0197  sodium/glutamate symporter (glutamate permease)  55.86 
 
 		 402 aa  420  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000567531  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4718  sodium/glutamate symporter  48.73 
 
 		 401 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.193762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4181  sodium/glutamate symporter  51.39 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0036  sodium/glutamate symporter  51.39 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0040  sodium/glutamate symport carrier protein  51.39 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0996  sodium/glutamate symporter  57.22 
 
 		 401 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0534  sodium/glutamate symporter  47.77 
 
 		 404 aa  362  5.0000000000000005e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0995  sodium/glutamate symporter  57.22 
 
 		 401 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1033  sodium/glutamate symporter  56.95 
 
 		 401 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4228  sodium/glutamate symporter  55.29 
 
 		 401 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0724268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3988  sodium/glutamate symporter  52.11 
 
 		 401 aa  342  5e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4872  sodium/glutamate symporter  53.72 
 
 		 403 aa  342  5.999999999999999e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854487  normal  0.0119787 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03511  glutamate transporter  52.11 
 
 		 401 aa  342  8e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.891245  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03463  hypothetical protein  52.11 
 
 		 401 aa  342  8e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4104  sodium/glutamate symporter  52.11 
 
 		 401 aa  342  8e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0058  sodium/glutamate symporter  52.11 
 
 		 401 aa  342  8e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0052  sodium/glutamate symporter  52.11 
 
 		 401 aa  342  8e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4157  sodium/glutamate symporter  52.11 
 
 		 401 aa  342  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3864  sodium/glutamate symporter  52.11 
 
 		 401 aa  342  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5026  sodium/glutamate symporter  52.11 
 
 		 401 aa  342  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0916  sodium/glutamate symport carrier protein  51 
 
 		 402 aa  341  1e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.920005  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000964  sodium/glutamate symporter  45.45 
 
 		 408 aa  339  5e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.187707  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07004  hypothetical protein  44.61 
 
 		 417 aa  335  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4026  sodium/glutamate symporter  53.16 
 
 		 401 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4072  sodium/glutamate symporter  53.16 
 
 		 401 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3953  sodium/glutamate symporter  53.16 
 
 		 401 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0524542 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3963  sodium/glutamate symporter  53.16 
 
 		 401 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4132  sodium/glutamate symporter  53.16 
 
 		 401 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2923  sodium/glutamate symporter  45.71 
 
 		 407 aa  326  5e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2389  sodium/glutamate symporter  44.53 
 
 		 407 aa  323  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.657227  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0674  sodium/glutamate symport carrier protein (glutamate permease)  43.61 
 
 		 407 aa  323  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00660523  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0103  sodium/glutamate symporter  44.53 
 
 		 407 aa  322  5e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.406513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4386  sodium/glutamate symporter  45.14 
 
 		 407 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492063 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0673  sodium/glutamate symport carrier protein (glutamate permease)  43.89 
 
 		 407 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4778  sodium/glutamate symporter  44.14 
 
 		 407 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07017  hypothetical protein  43.63 
 
 		 420 aa  313  3.9999999999999997e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3251  sodium/glutamate symporter  44.86 
 
 		 407 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1541  sodium/glutamate symporter  46.21 
 
 		 407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.097367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1482  sodium/glutamate symporter  46.25 
 
 		 407 aa  310  4e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.485218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1547  sodium/glutamate symporter  46.1 
 
 		 407 aa  309  5e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0830864 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4777  sodium/glutamate symporter  43.39 
 
 		 407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131093 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0118  sodium/glutamate symporter  43.58 
 
 		 407 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2781  sodium/glutamate symporter  44.09 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.689609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2684  sodium/glutamate symporter  44.09 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2705  sodium/glutamate symporter  44.09 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1682  sodium/glutamate symporter  44.09 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00781316  normal  0.0287357 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1375  sodium/glutamate symporter  42.54 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2697  sodium/glutamate symporter  40.45 
 
 		 407 aa  295  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0092  sodium/glutamate symporter  43.64 
 
 		 408 aa  286  4e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000111115  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2643  sodium/glutamate symporter  42.36 
 
 		 402 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000968  sodium/glutamate symporter  43.85 
 
 		 361 aa  280  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1028  sodium/glutamate symporter  38.07 
 
 		 400 aa  270  4e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.697633  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2948  sodium/glutamate symporter  37.65 
 
 		 409 aa  264  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0496  sodium/glutamate symporter  38.86 
 
 		 392 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1355  sodium-glutamate symporter  36.74 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0361  transporter, putative  33.7 
 
 		 457 aa  246  4e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000537763  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1935  sodium:glutamate symporter  35.89 
 
 		 402 aa  246  4e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1451  sodium/glutamate symporter  36.25 
 
 		 414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0244  sodium/glutamate symporter  33.83 
 
 		 392 aa  243  5e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2369  sodium/glutamate symporter  40.25 
 
 		 402 aa  241  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.77466  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2415  sodium/glutamate symporter  40.25 
 
 		 402 aa  241  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1261  sodium/glutamate symporter  38.46 
 
 		 402 aa  236  6e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2504  sodium/glutamate symporter  35.89 
 
 		 398 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0831  sodium/glutamate symporter  38.13 
 
 		 402 aa  219  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3454  sodium/glutamate symporter  34.81 
 
 		 401 aa  219  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890755  normal  0.830149 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4118  hypothetical protein  35.77 
 
 		 401 aa  215  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.601595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1050  sodium/glutamate symporter  37.78 
 
 		 398 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0733546 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1953  sodium/glutamate symporter  39.64 
 
 		 404 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00992782  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4810  sodium/glutamate symporter  35.22 
 
 		 399 aa  203  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23160  sodium/glutamate symporter  39.74 
 
 		 404 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000099413 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17221  hypothetical protein  30.43 
 
 		 414 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03801  putative sodium:solute symporter, ESS family  30.3 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06891  sodium/solute symporter family protein  29.76 
 
 		 461 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2908  sodium/glutamate symporter  24.85 
 
 		 470 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06841  sodium/solute symporter family protein  25.13 
 
 		 462 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.195837  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06551  sodium/solute symporter family protein  25.59 
 
 		 462 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.40603  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0067  putative sodium:solute symporter, ESS family  28.64 
 
 		 461 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0776  sodium/glutamate symporter  28.85 
 
 		 462 aa  43.1  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.278749  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>