89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5033 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5033  sodium/glutamate symporter  100 
 
 		 409 aa  809    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2284  sodium/glutamate symporter  71.99 
 
 		 404 aa  521  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0465087  normal  0.066844 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1590  sodium/glutamate symporter  71.99 
 
 		 404 aa  521  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2080  sodium/glutamate symporter  62.09 
 
 		 424 aa  476  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0319  sodium/glutamate symporter  59.29 
 
 		 424 aa  464  1e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.321863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2020  sodium/glutamate symporter  57.88 
 
 		 412 aa  424  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.733127  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0197  sodium/glutamate symporter (glutamate permease)  53.22 
 
 		 402 aa  403  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000567531  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4181  sodium/glutamate symporter  53.77 
 
 		 404 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0036  sodium/glutamate symporter  53.77 
 
 		 404 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0040  sodium/glutamate symport carrier protein  53.77 
 
 		 404 aa  394  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4718  sodium/glutamate symporter  48.27 
 
 		 401 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.193762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4872  sodium/glutamate symporter  54.81 
 
 		 403 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854487  normal  0.0119787 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3988  sodium/glutamate symporter  53.77 
 
 		 401 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03511  glutamate transporter  54.03 
 
 		 401 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.891245  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4157  sodium/glutamate symporter  54.03 
 
 		 401 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0058  sodium/glutamate symporter  54.03 
 
 		 401 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4104  sodium/glutamate symporter  54.03 
 
 		 401 aa  365  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3864  sodium/glutamate symporter  54.03 
 
 		 401 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0052  sodium/glutamate symporter  54.03 
 
 		 401 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03463  hypothetical protein  54.03 
 
 		 401 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5026  sodium/glutamate symporter  54.03 
 
 		 401 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4132  sodium/glutamate symporter  55.06 
 
 		 401 aa  358  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4072  sodium/glutamate symporter  55.06 
 
 		 401 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4026  sodium/glutamate symporter  55.06 
 
 		 401 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3963  sodium/glutamate symporter  55.06 
 
 		 401 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3953  sodium/glutamate symporter  55.06 
 
 		 401 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0524542 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07004  hypothetical protein  46.48 
 
 		 417 aa  355  6.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0996  sodium/glutamate symporter  55.2 
 
 		 401 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4228  sodium/glutamate symporter  54.23 
 
 		 401 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0724268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0534  sodium/glutamate symporter  46.8 
 
 		 404 aa  349  5e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000964  sodium/glutamate symporter  45.73 
 
 		 408 aa  345  6e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.187707  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1033  sodium/glutamate symporter  55.2 
 
 		 401 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0674  sodium/glutamate symport carrier protein (glutamate permease)  44.01 
 
 		 407 aa  343  2e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00660523  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0995  sodium/glutamate symporter  54.19 
 
 		 401 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2923  sodium/glutamate symporter  44.69 
 
 		 407 aa  341  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3251  sodium/glutamate symporter  44.44 
 
 		 407 aa  339  4e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0103  sodium/glutamate symporter  45.05 
 
 		 407 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.406513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0916  sodium/glutamate symport carrier protein  49.88 
 
 		 402 aa  335  7e-91  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.920005  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2389  sodium/glutamate symporter  44.71 
 
 		 407 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.657227  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0673  sodium/glutamate symport carrier protein (glutamate permease)  43.66 
 
 		 407 aa  335  9e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4386  sodium/glutamate symporter  44.25 
 
 		 407 aa  330  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492063 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4778  sodium/glutamate symporter  44.83 
 
 		 407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1547  sodium/glutamate symporter  45.65 
 
 		 407 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0830864 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1482  sodium/glutamate symporter  45.65 
 
 		 407 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.485218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1541  sodium/glutamate symporter  45.41 
 
 		 407 aa  322  7e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.097367 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0118  sodium/glutamate symporter  43.98 
 
 		 407 aa  322  7e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07017  hypothetical protein  43.48 
 
 		 420 aa  320  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4777  sodium/glutamate symporter  44.15 
 
 		 407 aa  320  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131093 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2705  sodium/glutamate symporter  44.2 
 
 		 407 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1682  sodium/glutamate symporter  44.2 
 
 		 407 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00781316  normal  0.0287357 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2684  sodium/glutamate symporter  44.2 
 
 		 407 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2781  sodium/glutamate symporter  44.2 
 
 		 407 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.689609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0092  sodium/glutamate symporter  44.25 
 
 		 408 aa  299  5e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000111115  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1375  sodium/glutamate symporter  42.57 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2697  sodium/glutamate symporter  41.52 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000968  sodium/glutamate symporter  45.13 
 
 		 361 aa  291  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1028  sodium/glutamate symporter  37.07 
 
 		 400 aa  275  8e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.697633  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2643  sodium/glutamate symporter  40.45 
 
 		 402 aa  259  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0244  sodium/glutamate symporter  35.29 
 
 		 392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2948  sodium/glutamate symporter  36.89 
 
 		 409 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0361  transporter, putative  33.26 
 
 		 457 aa  248  9e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000537763  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1355  sodium-glutamate symporter  37.17 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2415  sodium/glutamate symporter  37.99 
 
 		 402 aa  243  6e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2369  sodium/glutamate symporter  37.99 
 
 		 402 aa  243  6e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.77466  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0496  sodium/glutamate symporter  37.31 
 
 		 392 aa  242  7e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1935  sodium:glutamate symporter  34.4 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1451  sodium/glutamate symporter  34.31 
 
 		 414 aa  232  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2504  sodium/glutamate symporter  35.12 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1261  sodium/glutamate symporter  39.8 
 
 		 402 aa  228  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1050  sodium/glutamate symporter  37.13 
 
 		 398 aa  224  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0733546 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4118  hypothetical protein  37.47 
 
 		 401 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.601595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0831  sodium/glutamate symporter  39.86 
 
 		 402 aa  220  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3454  sodium/glutamate symporter  35.04 
 
 		 401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890755  normal  0.830149 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4810  sodium/glutamate symporter  35.25 
 
 		 399 aa  208  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17221  hypothetical protein  30.87 
 
 		 414 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1953  sodium/glutamate symporter  38.21 
 
 		 404 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00992782  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23160  sodium/glutamate symporter  38.66 
 
 		 404 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000099413 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03801  putative sodium:solute symporter, ESS family  31.22 
 
 		 461 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06941  sodium/solute symporter family protein  27.5 
 
 		 459 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0628  sodium/solute symporter family protein  28.5 
 
 		 461 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06551  sodium/solute symporter family protein  27.98 
 
 		 462 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.40603  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07361  sodium/solute symporter family protein  30.24 
 
 		 456 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2908  sodium/glutamate symporter  23.61 
 
 		 470 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1785  sodium/glutamate symporter  26.11 
 
 		 471 aa  47.8  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06841  sodium/solute symporter family protein  26.94 
 
 		 462 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.195837  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1610  sodium/glutamate symporter  24 
 
 		 443 aa  47  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663624  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06891  sodium/solute symporter family protein  28.26 
 
 		 461 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1560  sodium/glutamate symporter  23.62 
 
 		 472 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000409416 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0067  putative sodium:solute symporter, ESS family  28.26 
 
 		 461 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>