77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2923 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2389  sodium/glutamate symporter  90.66 
 
 		 407 aa  744    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.657227  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0118  sodium/glutamate symporter  79.85 
 
 		 407 aa  661    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3251  sodium/glutamate symporter  76.85 
 
 		 407 aa  662    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4386  sodium/glutamate symporter  78.82 
 
 		 407 aa  655    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492063 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2781  sodium/glutamate symporter  90.89 
 
 		 407 aa  732    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.689609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2705  sodium/glutamate symporter  90.89 
 
 		 407 aa  732    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4777  sodium/glutamate symporter  78.33 
 
 		 407 aa  647    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131093 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4778  sodium/glutamate symporter  78.57 
 
 		 407 aa  654    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0103  sodium/glutamate symporter  77.83 
 
 		 407 aa  660    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.406513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2684  sodium/glutamate symporter  90.89 
 
 		 407 aa  732    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1682  sodium/glutamate symporter  90.89 
 
 		 407 aa  732    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00781316  normal  0.0287357 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1541  sodium/glutamate symporter  97.05 
 
 		 407 aa  758    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.097367 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1547  sodium/glutamate symporter  96.07 
 
 		 407 aa  754    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0830864 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1482  sodium/glutamate symporter  96.31 
 
 		 407 aa  755    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.485218  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2923  sodium/glutamate symporter  100 
 
 		 407 aa  813    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0674  sodium/glutamate symport carrier protein (glutamate permease)  70.44 
 
 		 407 aa  594  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00660523  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0673  sodium/glutamate symport carrier protein (glutamate permease)  71.43 
 
 		 407 aa  587  1e-167  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000964  sodium/glutamate symporter  67.32 
 
 		 408 aa  564  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.187707  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07004  hypothetical protein  67.08 
 
 		 417 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07017  hypothetical protein  67.07 
 
 		 420 aa  545  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0092  sodium/glutamate symporter  67.57 
 
 		 408 aa  530  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000111115  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000968  sodium/glutamate symporter  68.33 
 
 		 361 aa  485  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2697  sodium/glutamate symporter  48.02 
 
 		 407 aa  359  5e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0197  sodium/glutamate symporter (glutamate permease)  46.47 
 
 		 402 aa  345  1e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000567531  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2080  sodium/glutamate symporter  44.95 
 
 		 424 aa  323  4e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5033  sodium/glutamate symporter  44.69 
 
 		 409 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0319  sodium/glutamate symporter  44.36 
 
 		 424 aa  319  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.321863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2020  sodium/glutamate symporter  45.39 
 
 		 412 aa  312  4.999999999999999e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.733127  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0040  sodium/glutamate symport carrier protein  46.53 
 
 		 404 aa  312  9e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0036  sodium/glutamate symporter  46.53 
 
 		 404 aa  312  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4181  sodium/glutamate symporter  47.04 
 
 		 404 aa  311  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0534  sodium/glutamate symporter  42.27 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4228  sodium/glutamate symporter  50 
 
 		 401 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0724268  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0996  sodium/glutamate symporter  49.73 
 
 		 401 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3988  sodium/glutamate symporter  47.96 
 
 		 401 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0058  sodium/glutamate symporter  47.96 
 
 		 401 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4104  sodium/glutamate symporter  47.96 
 
 		 401 aa  302  8.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0052  sodium/glutamate symporter  47.96 
 
 		 401 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03463  hypothetical protein  47.96 
 
 		 401 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03511  glutamate transporter  47.96 
 
 		 401 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.891245  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5026  sodium/glutamate symporter  47.96 
 
 		 401 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4157  sodium/glutamate symporter  47.96 
 
 		 401 aa  301  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3864  sodium/glutamate symporter  47.96 
 
 		 401 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1375  sodium/glutamate symporter  40.95 
 
 		 428 aa  301  2e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1033  sodium/glutamate symporter  49.73 
 
 		 401 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4872  sodium/glutamate symporter  48.54 
 
 		 403 aa  297  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854487  normal  0.0119787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0995  sodium/glutamate symporter  48.43 
 
 		 401 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1590  sodium/glutamate symporter  45.71 
 
 		 404 aa  294  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2284  sodium/glutamate symporter  45.71 
 
 		 404 aa  294  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0465087  normal  0.066844 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4132  sodium/glutamate symporter  48.21 
 
 		 401 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3953  sodium/glutamate symporter  48.21 
 
 		 401 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0524542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4026  sodium/glutamate symporter  47.98 
 
 		 401 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3963  sodium/glutamate symporter  47.73 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4072  sodium/glutamate symporter  47.73 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4718  sodium/glutamate symporter  41.67 
 
 		 401 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.193762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0916  sodium/glutamate symport carrier protein  43.88 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.920005  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2643  sodium/glutamate symporter  40.24 
 
 		 402 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2948  sodium/glutamate symporter  37.5 
 
 		 409 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0361  transporter, putative  35.07 
 
 		 457 aa  250  4e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000537763  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0496  sodium/glutamate symporter  36.13 
 
 		 392 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1355  sodium-glutamate symporter  35.82 
 
 		 409 aa  246  6e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1028  sodium/glutamate symporter  36.83 
 
 		 400 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.697633  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1935  sodium:glutamate symporter  36.59 
 
 		 402 aa  245  9.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1451  sodium/glutamate symporter  35.1 
 
 		 414 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2369  sodium/glutamate symporter  38.02 
 
 		 402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.77466  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2415  sodium/glutamate symporter  38.02 
 
 		 402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2504  sodium/glutamate symporter  34.63 
 
 		 398 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4118  hypothetical protein  34.33 
 
 		 401 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.601595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0831  sodium/glutamate symporter  36.88 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1050  sodium/glutamate symporter  37.15 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0733546 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4810  sodium/glutamate symporter  34.91 
 
 		 399 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17221  hypothetical protein  34.48 
 
 		 414 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1261  sodium/glutamate symporter  34.5 
 
 		 402 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3454  sodium/glutamate symporter  32.84 
 
 		 401 aa  206  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890755  normal  0.830149 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0244  sodium/glutamate symporter  31.09 
 
 		 392 aa  201  3e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1953  sodium/glutamate symporter  35.4 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00992782  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23160  sodium/glutamate symporter  35.57 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000099413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>