28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_03801 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_03801  putative sodium:solute symporter, ESS family  100 
 
 
461 aa  876    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07361  sodium/solute symporter family protein  61.57 
 
 
456 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06891  sodium/solute symporter family protein  60.05 
 
 
461 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0067  putative sodium:solute symporter, ESS family  60.51 
 
 
461 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06941  sodium/solute symporter family protein  50.11 
 
 
459 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0628  sodium/solute symporter family protein  50.12 
 
 
461 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06551  sodium/solute symporter family protein  50 
 
 
462 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.40603  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06841  sodium/solute symporter family protein  49.52 
 
 
462 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.195837  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2269  sodium/glutamate symporter  37.06 
 
 
479 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0232  sodium/glutamate symporter  35.02 
 
 
489 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.413045 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2908  sodium/glutamate symporter  32.86 
 
 
470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200333  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1560  sodium/glutamate symporter  31.25 
 
 
472 aa  221  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000409416 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1785  sodium/glutamate symporter  31.18 
 
 
471 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2615  sodium/glutamate symporter  34.57 
 
 
494 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00493587  normal  0.013038 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0776  sodium/glutamate symporter  34.62 
 
 
462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.278749  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1728  sodium/glutamate symporter  36.75 
 
 
471 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1610  sodium/glutamate symporter  31.75 
 
 
443 aa  197  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663624  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02230  Na+/glutamate symporter  31.19 
 
 
459 aa  169  9e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2370  sodium/glutamate symporter  33.89 
 
 
458 aa  147  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003562  sodium/glutamate symporter  27.69 
 
 
456 aa  127  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0701  sodium/glutamate symporter  29.15 
 
 
448 aa  95.9  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14970  Na+/glutamate symporter  27.53 
 
 
466 aa  80.9  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0610514  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2214  sodium/glutamate symporter  23.82 
 
 
474 aa  76.3  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1935  sodium:glutamate symporter  23.61 
 
 
402 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5033  sodium/glutamate symporter  31.22 
 
 
409 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130355  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1590  sodium/glutamate symporter  29.95 
 
 
404 aa  45.8  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2284  sodium/glutamate symporter  29.95 
 
 
404 aa  45.8  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0465087  normal  0.066844 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  33.68 
 
 
748 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>