26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_06941 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0628  sodium/solute symporter family protein  82.74 
 
 
461 aa  725    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06841  sodium/solute symporter family protein  82.57 
 
 
462 aa  720    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.195837  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06941  sodium/solute symporter family protein  100 
 
 
459 aa  894    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06551  sodium/solute symporter family protein  82.57 
 
 
462 aa  724    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.40603  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07361  sodium/solute symporter family protein  52.39 
 
 
456 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06891  sodium/solute symporter family protein  50.82 
 
 
461 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0067  putative sodium:solute symporter, ESS family  50.82 
 
 
461 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03801  putative sodium:solute symporter, ESS family  51.64 
 
 
461 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0232  sodium/glutamate symporter  30.92 
 
 
489 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.413045 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1560  sodium/glutamate symporter  29.16 
 
 
472 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000409416 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2908  sodium/glutamate symporter  29.58 
 
 
470 aa  192  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200333  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2269  sodium/glutamate symporter  30.5 
 
 
479 aa  190  5e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2615  sodium/glutamate symporter  31.69 
 
 
494 aa  189  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00493587  normal  0.013038 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1785  sodium/glutamate symporter  30.71 
 
 
471 aa  186  7e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1728  sodium/glutamate symporter  32.97 
 
 
471 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0776  sodium/glutamate symporter  31.22 
 
 
462 aa  180  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.278749  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1610  sodium/glutamate symporter  27.21 
 
 
443 aa  176  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663624  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02230  Na+/glutamate symporter  26.3 
 
 
459 aa  147  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2370  sodium/glutamate symporter  31.86 
 
 
458 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003562  sodium/glutamate symporter  29.04 
 
 
456 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0701  sodium/glutamate symporter  26.68 
 
 
448 aa  106  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2214  sodium/glutamate symporter  26.14 
 
 
474 aa  81.3  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14970  Na+/glutamate symporter  26.01 
 
 
466 aa  72.8  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0610514  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0673  sodium/glutamate symport carrier protein (glutamate permease)  26.75 
 
 
407 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5033  sodium/glutamate symporter  27.5 
 
 
409 aa  44.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130355  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17221  hypothetical protein  27.44 
 
 
414 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>