39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2269 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2269  sodium/glutamate symporter  100 
 
 		 479 aa  926    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1728  sodium/glutamate symporter  56.14 
 
 		 471 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1785  sodium/glutamate symporter  49.66 
 
 		 471 aa  444  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2908  sodium/glutamate symporter  49.78 
 
 		 470 aa  434  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0776  sodium/glutamate symporter  50.77 
 
 		 462 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.278749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0232  sodium/glutamate symporter  50.77 
 
 		 489 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.413045 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1560  sodium/glutamate symporter  45.49 
 
 		 472 aa  413  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000409416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2615  sodium/glutamate symporter  51.01 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00493587  normal  0.013038 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1610  sodium/glutamate symporter  39.52 
 
 		 443 aa  299  9e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663624  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02230  Na+/glutamate symporter  37.65 
 
 		 459 aa  260  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03801  putative sodium:solute symporter, ESS family  36.84 
 
 		 461 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0067  putative sodium:solute symporter, ESS family  32.84 
 
 		 461 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06891  sodium/solute symporter family protein  33.09 
 
 		 461 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2370  sodium/glutamate symporter  35.99 
 
 		 458 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07361  sodium/solute symporter family protein  32.66 
 
 		 456 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06941  sodium/solute symporter family protein  30.5 
 
 		 459 aa  200  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06551  sodium/solute symporter family protein  29.77 
 
 		 462 aa  193  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.40603  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06841  sodium/solute symporter family protein  28.84 
 
 		 462 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.195837  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0628  sodium/solute symporter family protein  30.15 
 
 		 461 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003562  sodium/glutamate symporter  27.09 
 
 		 456 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2214  sodium/glutamate symporter  27.25 
 
 		 474 aa  145  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0701  sodium/glutamate symporter  29.02 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14970  Na+/glutamate symporter  30.65 
 
 		 466 aa  116  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0610514  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0673  sodium/glutamate symport carrier protein (glutamate permease)  26.16 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07004  hypothetical protein  27.3 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0674  sodium/glutamate symport carrier protein (glutamate permease)  25.11 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00660523  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2080  sodium/glutamate symporter  24.49 
 
 		 424 aa  50.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1375  sodium/glutamate symporter  26.88 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000964  sodium/glutamate symporter  25.75 
 
 		 408 aa  48.5  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.187707  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0103  sodium/glutamate symporter  25.11 
 
 		 407 aa  46.6  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.406513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4228  sodium/glutamate symporter  28.43 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0724268  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1935  sodium:glutamate symporter  23.2 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4777  sodium/glutamate symporter  25.37 
 
 		 407 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131093 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2415  sodium/glutamate symporter  23.45 
 
 		 402 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2369  sodium/glutamate symporter  23.45 
 
 		 402 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.77466  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0319  sodium/glutamate symporter  23.05 
 
 		 424 aa  43.9  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.321863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0995  sodium/glutamate symporter  27.24 
 
 		 401 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4386  sodium/glutamate symporter  24.91 
 
 		 407 aa  43.5  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492063 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4778  sodium/glutamate symporter  23.04 
 
 		 407 aa  43.1  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>