26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2615 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2615  sodium/glutamate symporter  100 
 
 
494 aa  954    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00493587  normal  0.013038 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1785  sodium/glutamate symporter  48.43 
 
 
471 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2908  sodium/glutamate symporter  48.64 
 
 
470 aa  432  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200333  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1560  sodium/glutamate symporter  44.28 
 
 
472 aa  424  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000409416 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2269  sodium/glutamate symporter  51.01 
 
 
479 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1728  sodium/glutamate symporter  50.62 
 
 
471 aa  355  1e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0776  sodium/glutamate symporter  44.91 
 
 
462 aa  350  3e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.278749  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0232  sodium/glutamate symporter  43.27 
 
 
489 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.413045 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1610  sodium/glutamate symporter  36.09 
 
 
443 aa  281  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663624  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02230  Na+/glutamate symporter  34.99 
 
 
459 aa  245  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03801  putative sodium:solute symporter, ESS family  34.99 
 
 
461 aa  210  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2370  sodium/glutamate symporter  35.83 
 
 
458 aa  204  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0067  putative sodium:solute symporter, ESS family  35.34 
 
 
461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06891  sodium/solute symporter family protein  34.89 
 
 
461 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06941  sodium/solute symporter family protein  31.69 
 
 
459 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07361  sodium/solute symporter family protein  35.18 
 
 
456 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06841  sodium/solute symporter family protein  31.36 
 
 
462 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.195837  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06551  sodium/solute symporter family protein  31.36 
 
 
462 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.40603  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0628  sodium/solute symporter family protein  31.23 
 
 
461 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0701  sodium/glutamate symporter  31.76 
 
 
448 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003562  sodium/glutamate symporter  27.94 
 
 
456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2214  sodium/glutamate symporter  29.67 
 
 
474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14970  Na+/glutamate symporter  26.6 
 
 
466 aa  101  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0610514  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0534  sodium/glutamate symporter  22.87 
 
 
404 aa  48.1  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1348  hypothetical protein  27.61 
 
 
235 aa  47.4  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.318729  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000964  sodium/glutamate symporter  27.82 
 
 
408 aa  43.5  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.187707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>