47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1785 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1785  sodium/glutamate symporter  100 
 
 
471 aa  918    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1560  sodium/glutamate symporter  54.56 
 
 
472 aa  546  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000409416 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2908  sodium/glutamate symporter  54.68 
 
 
470 aa  493  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200333  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1728  sodium/glutamate symporter  52.89 
 
 
471 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2269  sodium/glutamate symporter  49.66 
 
 
479 aa  430  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2615  sodium/glutamate symporter  48.58 
 
 
494 aa  423  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00493587  normal  0.013038 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0232  sodium/glutamate symporter  49.24 
 
 
489 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.413045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0776  sodium/glutamate symporter  48.59 
 
 
462 aa  403  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.278749  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1610  sodium/glutamate symporter  37.22 
 
 
443 aa  293  6e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663624  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02230  Na+/glutamate symporter  34.88 
 
 
459 aa  276  6e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2370  sodium/glutamate symporter  32.8 
 
 
458 aa  217  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03801  putative sodium:solute symporter, ESS family  32.91 
 
 
461 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0067  putative sodium:solute symporter, ESS family  34.33 
 
 
461 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06891  sodium/solute symporter family protein  33.58 
 
 
461 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07361  sodium/solute symporter family protein  33.24 
 
 
456 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06941  sodium/solute symporter family protein  30.5 
 
 
459 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0628  sodium/solute symporter family protein  31.96 
 
 
461 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06551  sodium/solute symporter family protein  32.05 
 
 
462 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.40603  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06841  sodium/solute symporter family protein  32.69 
 
 
462 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.195837  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2214  sodium/glutamate symporter  31.36 
 
 
474 aa  155  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003562  sodium/glutamate symporter  27.19 
 
 
456 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0701  sodium/glutamate symporter  29.98 
 
 
448 aa  140  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14970  Na+/glutamate symporter  28.15 
 
 
466 aa  107  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0610514  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000964  sodium/glutamate symporter  24.44 
 
 
408 aa  57.8  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.187707  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1935  sodium:glutamate symporter  23.81 
 
 
402 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07004  hypothetical protein  23.88 
 
 
417 aa  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0040  sodium/glutamate symport carrier protein  27.19 
 
 
404 aa  50.4  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2948  sodium/glutamate symporter  23.84 
 
 
409 aa  50.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0036  sodium/glutamate symporter  27.19 
 
 
404 aa  50.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1451  sodium/glutamate symporter  23.53 
 
 
414 aa  50.1  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4181  sodium/glutamate symporter  26.75 
 
 
404 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5033  sodium/glutamate symporter  26.21 
 
 
409 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130355  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5026  sodium/glutamate symporter  23.51 
 
 
401 aa  44.3  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3988  sodium/glutamate symporter  23.51 
 
 
401 aa  44.3  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4157  sodium/glutamate symporter  23.51 
 
 
401 aa  44.3  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3864  sodium/glutamate symporter  23.51 
 
 
401 aa  44.3  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2080  sodium/glutamate symporter  25.15 
 
 
424 aa  44.3  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17221  hypothetical protein  26.35 
 
 
414 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4104  sodium/glutamate symporter  23.51 
 
 
401 aa  43.5  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0058  sodium/glutamate symporter  23.51 
 
 
401 aa  43.5  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03463  hypothetical protein  23.51 
 
 
401 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03511  glutamate transporter  23.51 
 
 
401 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.891245  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0197  sodium/glutamate symporter (glutamate permease)  26.97 
 
 
402 aa  43.9  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000567531  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0052  sodium/glutamate symporter  23.51 
 
 
401 aa  43.5  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3953  sodium/glutamate symporter  22.88 
 
 
401 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0524542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4026  sodium/glutamate symporter  22.88 
 
 
401 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4132  sodium/glutamate symporter  22.88 
 
 
401 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0214352  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>