28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0232 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0232  sodium/glutamate symporter  100 
 
 		 489 aa  956    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.413045 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1785  sodium/glutamate symporter  49.24 
 
 		 471 aa  432  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2269  sodium/glutamate symporter  50.77 
 
 		 479 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2908  sodium/glutamate symporter  48.03 
 
 		 470 aa  417  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1728  sodium/glutamate symporter  50.65 
 
 		 471 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1560  sodium/glutamate symporter  44.16 
 
 		 472 aa  405  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000409416 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0776  sodium/glutamate symporter  45.73 
 
 		 462 aa  392  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.278749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2615  sodium/glutamate symporter  43.27 
 
 		 494 aa  341  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00493587  normal  0.013038 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1610  sodium/glutamate symporter  37.81 
 
 		 443 aa  277  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663624  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02230  Na+/glutamate symporter  36.04 
 
 		 459 aa  259  7e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03801  putative sodium:solute symporter, ESS family  36.17 
 
 		 461 aa  226  9e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2370  sodium/glutamate symporter  36.43 
 
 		 458 aa  224  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0067  putative sodium:solute symporter, ESS family  33.49 
 
 		 461 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07361  sodium/solute symporter family protein  33.33 
 
 		 456 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06891  sodium/solute symporter family protein  33.73 
 
 		 461 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06941  sodium/solute symporter family protein  30.8 
 
 		 459 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0628  sodium/solute symporter family protein  31.93 
 
 		 461 aa  210  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06551  sodium/solute symporter family protein  31.1 
 
 		 462 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.40603  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06841  sodium/solute symporter family protein  31.1 
 
 		 462 aa  203  6e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.195837  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003562  sodium/glutamate symporter  27.14 
 
 		 456 aa  164  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2214  sodium/glutamate symporter  25.18 
 
 		 474 aa  121  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0701  sodium/glutamate symporter  27.49 
 
 		 448 aa  119  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14970  Na+/glutamate symporter  25.81 
 
 		 466 aa  94.4  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0610514  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07004  hypothetical protein  22.38 
 
 		 417 aa  47  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1028  sodium/glutamate symporter  23.08 
 
 		 400 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.697633  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000964  sodium/glutamate symporter  24.91 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.187707  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5033  sodium/glutamate symporter  25.4 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130355  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1935  sodium:glutamate symporter  25.11 
 
 		 402 aa  45.1  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>