31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2370 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2370  sodium/glutamate symporter  100 
 
 
458 aa  864    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2908  sodium/glutamate symporter  35.35 
 
 
470 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200333  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1785  sodium/glutamate symporter  32.47 
 
 
471 aa  231  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1560  sodium/glutamate symporter  33.18 
 
 
472 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000409416 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0232  sodium/glutamate symporter  35.45 
 
 
489 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.413045 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2615  sodium/glutamate symporter  34.89 
 
 
494 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00493587  normal  0.013038 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0776  sodium/glutamate symporter  34.57 
 
 
462 aa  209  6e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.278749  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2269  sodium/glutamate symporter  35.32 
 
 
479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1728  sodium/glutamate symporter  33.89 
 
 
471 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1610  sodium/glutamate symporter  34.11 
 
 
443 aa  196  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663624  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02230  Na+/glutamate symporter  34.21 
 
 
459 aa  180  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06891  sodium/solute symporter family protein  33.5 
 
 
461 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0067  putative sodium:solute symporter, ESS family  33.58 
 
 
461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06551  sodium/solute symporter family protein  30.97 
 
 
462 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.40603  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003562  sodium/glutamate symporter  27.27 
 
 
456 aa  171  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0628  sodium/solute symporter family protein  31.93 
 
 
461 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06841  sodium/solute symporter family protein  31.34 
 
 
462 aa  167  5e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.195837  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06941  sodium/solute symporter family protein  31.43 
 
 
459 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07361  sodium/solute symporter family protein  29.86 
 
 
456 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03801  putative sodium:solute symporter, ESS family  32.69 
 
 
461 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0701  sodium/glutamate symporter  28.14 
 
 
448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2214  sodium/glutamate symporter  26.37 
 
 
474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14970  Na+/glutamate symporter  31.28 
 
 
466 aa  131  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0610514  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07004  hypothetical protein  25.7 
 
 
417 aa  50.8  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000964  sodium/glutamate symporter  25 
 
 
408 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.187707  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1348  hypothetical protein  26.6 
 
 
235 aa  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.318729  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17221  hypothetical protein  23.03 
 
 
414 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1028  sodium/glutamate symporter  23.87 
 
 
400 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.697633  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0673  sodium/glutamate symport carrier protein (glutamate permease)  23.04 
 
 
407 aa  45.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4386  sodium/glutamate symporter  25.59 
 
 
407 aa  43.9  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492063 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0103  sodium/glutamate symporter  25.95 
 
 
407 aa  43.9  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.406513  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>