25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003562 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003562  sodium/glutamate symporter  100 
 
 		 456 aa  910    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0701  sodium/glutamate symporter  32.13 
 
 		 448 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14970  Na+/glutamate symporter  32.15 
 
 		 466 aa  200  3.9999999999999996e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0610514  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1560  sodium/glutamate symporter  26.28 
 
 		 472 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000409416 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2908  sodium/glutamate symporter  26.57 
 
 		 470 aa  154  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0232  sodium/glutamate symporter  26.9 
 
 		 489 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.413045 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1785  sodium/glutamate symporter  27.29 
 
 		 471 aa  151  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2370  sodium/glutamate symporter  27.13 
 
 		 458 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0776  sodium/glutamate symporter  25.6 
 
 		 462 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.278749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2615  sodium/glutamate symporter  26.95 
 
 		 494 aa  143  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00493587  normal  0.013038 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2269  sodium/glutamate symporter  26.68 
 
 		 479 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2214  sodium/glutamate symporter  24.64 
 
 		 474 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1610  sodium/glutamate symporter  24.5 
 
 		 443 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663624  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06891  sodium/solute symporter family protein  28.12 
 
 		 461 aa  128  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0628  sodium/solute symporter family protein  28.07 
 
 		 461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06551  sodium/solute symporter family protein  28.07 
 
 		 462 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.40603  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06841  sodium/solute symporter family protein  28.34 
 
 		 462 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.195837  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0067  putative sodium:solute symporter, ESS family  28.12 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06941  sodium/solute symporter family protein  29.04 
 
 		 459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1728  sodium/glutamate symporter  24.37 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07361  sodium/solute symporter family protein  28.62 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03801  putative sodium:solute symporter, ESS family  26.18 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02230  Na+/glutamate symporter  24.3 
 
 		 459 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1348  hypothetical protein  29.27 
 
 		 235 aa  52.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.318729  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1935  sodium:glutamate symporter  20.9 
 
 		 402 aa  47  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>