42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2908 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2908  sodium/glutamate symporter  100 
 
 
470 aa  917    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200333  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1560  sodium/glutamate symporter  54.7 
 
 
472 aa  496  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000409416 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1785  sodium/glutamate symporter  54.68 
 
 
471 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2615  sodium/glutamate symporter  48.58 
 
 
494 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00493587  normal  0.013038 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2269  sodium/glutamate symporter  49.78 
 
 
479 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1728  sodium/glutamate symporter  50.78 
 
 
471 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0232  sodium/glutamate symporter  48.04 
 
 
489 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.413045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0776  sodium/glutamate symporter  44.78 
 
 
462 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.278749  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1610  sodium/glutamate symporter  37.55 
 
 
443 aa  297  3e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663624  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02230  Na+/glutamate symporter  34.75 
 
 
459 aa  266  8.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2370  sodium/glutamate symporter  35.51 
 
 
458 aa  229  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0067  putative sodium:solute symporter, ESS family  33.02 
 
 
461 aa  219  6e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06891  sodium/solute symporter family protein  34.87 
 
 
461 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03801  putative sodium:solute symporter, ESS family  33.51 
 
 
461 aa  213  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07361  sodium/solute symporter family protein  31.19 
 
 
456 aa  199  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0628  sodium/solute symporter family protein  29.73 
 
 
461 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06551  sodium/solute symporter family protein  29.52 
 
 
462 aa  194  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.40603  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06941  sodium/solute symporter family protein  29.03 
 
 
459 aa  193  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06841  sodium/solute symporter family protein  29.89 
 
 
462 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.195837  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003562  sodium/glutamate symporter  26.85 
 
 
456 aa  159  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2214  sodium/glutamate symporter  27.85 
 
 
474 aa  143  8e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0701  sodium/glutamate symporter  27.78 
 
 
448 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14970  Na+/glutamate symporter  29.51 
 
 
466 aa  129  8.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0610514  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1935  sodium:glutamate symporter  23.1 
 
 
402 aa  64.3  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000964  sodium/glutamate symporter  27.31 
 
 
408 aa  55.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.187707  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07004  hypothetical protein  25 
 
 
417 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2369  sodium/glutamate symporter  22.6 
 
 
402 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.77466  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0674  sodium/glutamate symport carrier protein (glutamate permease)  24.59 
 
 
407 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00660523  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2415  sodium/glutamate symporter  22.6 
 
 
402 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0673  sodium/glutamate symport carrier protein (glutamate permease)  23.14 
 
 
407 aa  48.9  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1590  sodium/glutamate symporter  24.68 
 
 
404 aa  46.2  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2284  sodium/glutamate symporter  24.68 
 
 
404 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0465087  normal  0.066844 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17221  hypothetical protein  25.08 
 
 
414 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0534  sodium/glutamate symporter  24.63 
 
 
404 aa  45.8  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1375  sodium/glutamate symporter  24.37 
 
 
428 aa  45.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2948  sodium/glutamate symporter  22.84 
 
 
409 aa  44.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0197  sodium/glutamate symporter (glutamate permease)  21.36 
 
 
402 aa  44.7  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000567531  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0036  sodium/glutamate symporter  25.1 
 
 
404 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0040  sodium/glutamate symport carrier protein  25.1 
 
 
404 aa  44.3  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4181  sodium/glutamate symporter  25.1 
 
 
404 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2080  sodium/glutamate symporter  24.88 
 
 
424 aa  43.9  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1028  sodium/glutamate symporter  25.66 
 
 
400 aa  43.5  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.697633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>