24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02230 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02230  Na+/glutamate symporter  100 
 
 		 459 aa  887    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1610  sodium/glutamate symporter  64.11 
 
 		 443 aa  537  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663624  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1785  sodium/glutamate symporter  34.88 
 
 		 471 aa  276  7e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1560  sodium/glutamate symporter  33.12 
 
 		 472 aa  268  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000409416 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2908  sodium/glutamate symporter  34.51 
 
 		 470 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0776  sodium/glutamate symporter  35.78 
 
 		 462 aa  256  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.278749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2269  sodium/glutamate symporter  37.65 
 
 		 479 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0232  sodium/glutamate symporter  36.14 
 
 		 489 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.413045 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1728  sodium/glutamate symporter  36.59 
 
 		 471 aa  252  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2615  sodium/glutamate symporter  35.68 
 
 		 494 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00493587  normal  0.013038 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06891  sodium/solute symporter family protein  30.53 
 
 		 461 aa  179  7e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0067  putative sodium:solute symporter, ESS family  30.53 
 
 		 461 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2370  sodium/glutamate symporter  34.29 
 
 		 458 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03801  putative sodium:solute symporter, ESS family  31.05 
 
 		 461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0628  sodium/solute symporter family protein  26.85 
 
 		 461 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06551  sodium/solute symporter family protein  27.25 
 
 		 462 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.40603  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06841  sodium/solute symporter family protein  27.25 
 
 		 462 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.195837  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06941  sodium/solute symporter family protein  26.3 
 
 		 459 aa  159  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07361  sodium/solute symporter family protein  27.81 
 
 		 456 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003562  sodium/glutamate symporter  25.05 
 
 		 456 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2214  sodium/glutamate symporter  24.81 
 
 		 474 aa  111  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0701  sodium/glutamate symporter  25.24 
 
 		 448 aa  92.4  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14970  Na+/glutamate symporter  25.74 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0610514  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1028  sodium/glutamate symporter  20.47 
 
 		 400 aa  43.1  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.697633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>