31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0776 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0776  sodium/glutamate symporter  100 
 
 		 462 aa  893    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.278749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1728  sodium/glutamate symporter  52.7 
 
 		 471 aa  415  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1785  sodium/glutamate symporter  48.79 
 
 		 471 aa  397  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2269  sodium/glutamate symporter  52.68 
 
 		 479 aa  396  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2908  sodium/glutamate symporter  46.14 
 
 		 470 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0232  sodium/glutamate symporter  46.29 
 
 		 489 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.413045 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1560  sodium/glutamate symporter  43.2 
 
 		 472 aa  376  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000409416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2615  sodium/glutamate symporter  45.41 
 
 		 494 aa  330  4e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00493587  normal  0.013038 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1610  sodium/glutamate symporter  37.91 
 
 		 443 aa  272  7e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663624  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02230  Na+/glutamate symporter  35.78 
 
 		 459 aa  252  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03801  putative sodium:solute symporter, ESS family  35.93 
 
 		 461 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07361  sodium/solute symporter family protein  34.34 
 
 		 456 aa  196  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0067  putative sodium:solute symporter, ESS family  34.56 
 
 		 461 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2370  sodium/glutamate symporter  34.55 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06891  sodium/solute symporter family protein  34.04 
 
 		 461 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06941  sodium/solute symporter family protein  31.22 
 
 		 459 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0628  sodium/solute symporter family protein  30 
 
 		 461 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06551  sodium/solute symporter family protein  30.24 
 
 		 462 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.40603  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06841  sodium/solute symporter family protein  29.51 
 
 		 462 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.195837  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003562  sodium/glutamate symporter  25.6 
 
 		 456 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0701  sodium/glutamate symporter  27.13 
 
 		 448 aa  113  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2214  sodium/glutamate symporter  23.04 
 
 		 474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14970  Na+/glutamate symporter  28.1 
 
 		 466 aa  103  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0610514  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1375  sodium/glutamate symporter  25.06 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1028  sodium/glutamate symporter  25.79 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.697633  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0319  sodium/glutamate symporter  24.81 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.321863  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1935  sodium:glutamate symporter  21.47 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07004  hypothetical protein  25.94 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2080  sodium/glutamate symporter  26.24 
 
 		 424 aa  44.7  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2415  sodium/glutamate symporter  23.83 
 
 		 402 aa  43.1  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2369  sodium/glutamate symporter  23.83 
 
 		 402 aa  43.1  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.77466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>