24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0628 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0628  sodium/solute symporter family protein  100 
 
 
461 aa  896    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06841  sodium/solute symporter family protein  91.96 
 
 
462 aa  802    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.195837  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06941  sodium/solute symporter family protein  82.74 
 
 
459 aa  740    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06551  sodium/solute symporter family protein  91.74 
 
 
462 aa  805    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.40603  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0067  putative sodium:solute symporter, ESS family  52.42 
 
 
461 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06891  sodium/solute symporter family protein  50.83 
 
 
461 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03801  putative sodium:solute symporter, ESS family  50.12 
 
 
461 aa  408  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07361  sodium/solute symporter family protein  51.95 
 
 
456 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1560  sodium/glutamate symporter  30.82 
 
 
472 aa  211  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000409416 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0232  sodium/glutamate symporter  31.93 
 
 
489 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.413045 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2908  sodium/glutamate symporter  30.48 
 
 
470 aa  197  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200333  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1728  sodium/glutamate symporter  31.45 
 
 
471 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1785  sodium/glutamate symporter  32.78 
 
 
471 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2615  sodium/glutamate symporter  31.23 
 
 
494 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00493587  normal  0.013038 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0776  sodium/glutamate symporter  30.09 
 
 
462 aa  179  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.278749  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2269  sodium/glutamate symporter  30.15 
 
 
479 aa  177  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1610  sodium/glutamate symporter  28.19 
 
 
443 aa  175  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663624  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02230  Na+/glutamate symporter  26.85 
 
 
459 aa  156  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2370  sodium/glutamate symporter  31.93 
 
 
458 aa  147  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003562  sodium/glutamate symporter  28.07 
 
 
456 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0701  sodium/glutamate symporter  25.9 
 
 
448 aa  98.6  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2214  sodium/glutamate symporter  26.72 
 
 
474 aa  78.2  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14970  Na+/glutamate symporter  24.4 
 
 
466 aa  69.7  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0610514  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5033  sodium/glutamate symporter  28.5 
 
 
409 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130355  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>