More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2435 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2435  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 248 aa  481  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.157155  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1523  response regulator receiver protein  96.77 
 
 		 248 aa  434  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.154695  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1428  response regulator receiver protein  96.77 
 
 		 248 aa  434  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.871413  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0025  response regulator receiver protein  53.85 
 
 		 241 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.543826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3940  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.43 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000637809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4024  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.43 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42797e-16 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4418  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 466 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  33.64 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1832  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 		 543 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  33.64 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3263  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 464 aa  56.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000257125 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0768  two component signal transduction response regulator  40 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000566504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  33.64 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  33.64 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  33.64 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  33.64 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  33.64 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  35.2 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  33.64 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2373  two component transcriptional regulator  40.28 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0367191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  32.71 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 		 642 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0298  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator, interruption-C  31.53 
 
 		 332 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1891  response regulator  25.91 
 
 		 379 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.750204  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  35.14 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  33 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  32.76 
 
 		 837 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 647 aa  53.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3453  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 445 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2539  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 487 aa  53.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.846517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2764  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 466 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2428  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 		 656 aa  53.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00399652  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0746  response regulator receiver  21.3 
 
 		 228 aa  52.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4779  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.91 
 
 		 494 aa  52.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0730  two component transcriptional regulator  21.3 
 
 		 228 aa  52.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  39.6 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 228 aa  52.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0440  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 230 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2741  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 474 aa  52.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0363909  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  32.45 
 
 		 230 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0439  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 		 230 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0259  two component signal transduction response regulator  31.65 
 
 		 513 aa  52  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2298  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.69 
 
 		 452 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2245  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.08 
 
 		 460 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2835  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.24 
 
 		 475 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019348  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.03 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2366  DNA-binding response regulator  29.31 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.13 
 
 		 664 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1833  putative PAS/PAC sensor protein  30.28 
 
 		 560 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2666  two component transcriptional regulator  29.31 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.800154  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  34.86 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2685  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 		 660 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41147  normal  0.190122 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  31.4 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1320  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  35.11 
 
 		 460 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2893  response regulator  29.31 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000624978  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1046  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0213528  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2398  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.71 
 
 		 469 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.313034  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 1344 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 467 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2310  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.71 
 
 		 469 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294968  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 657 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2740  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.76 
 
 		 475 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2867  DNA-binding response regulator  28.45 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000859212 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2621  two-component response regulator  28.45 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000897138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2590  response regulator  27.59 
 
 		 215 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0044189  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 		 642 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0149  sensor histidine kinase/response regulator  32 
 
 		 371 aa  50.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 		 334 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 374 aa  49.7  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2877  DNA-binding response regulator  28.45 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2959  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.96 
 
 		 513 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  30 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3356  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 484 aa  49.7  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1035  two component transcriptional regulator  30.7 
 
 		 246 aa  49.7  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2258  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 468 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428008  normal  0.0222917 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  41.89 
 
 		 228 aa  50.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 		 1108 aa  49.3  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.85 
 
 		 224 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.07 
 
 		 317 aa  49.7  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1649  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 550 aa  49.7  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.181327  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 663 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0791  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.38 
 
 		 1118 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0018  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.77 
 
 		 461 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.709029  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0488  DNA-binding response regulator  26.4 
 
 		 228 aa  49.7  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3334  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.58 
 
 		 331 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0058  two component transcriptional regulator  33.78 
 
 		 221 aa  49.3  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551146  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  32 
 
 		 334 aa  49.3  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 1341 aa  49.3  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3111  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 458 aa  49.3  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4102  DNA-binding response regulator  27.27 
 
 		 239 aa  48.9  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0365  DNA-binding response regulator SaeR  20.37 
 
 		 229 aa  48.9  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  31.11 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0762  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 368 aa  48.9  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.218112  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 		 1977 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  27.59 
 
 		 239 aa  48.9  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>