More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3398 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009468  Acry_3398  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  147  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3121  hypothetical protein  76.19 
 
 
81 aa  100  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.10987  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2744  transposase IS66  50.75 
 
 
524 aa  87  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6364  transposase IS66  52.24 
 
 
524 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39651  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1224  transposase IS66  52.24 
 
 
290 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0108232  normal  0.0928681 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5512  transposase IS66  52.24 
 
 
290 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499564  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6094  transposase IS66  52.24 
 
 
290 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4328  transposase IS66  47.76 
 
 
524 aa  82.8  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4686  transposase IS66  47.76 
 
 
524 aa  82.8  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  50 
 
 
510 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0556  IS66 family orf3  49.28 
 
 
523 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.433641  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0693  transposase  60 
 
 
537 aa  80.1  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  51.43 
 
 
505 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  51.43 
 
 
505 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  51.43 
 
 
505 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3724  hypothetical protein  54.05 
 
 
527 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8231  transposase  50 
 
 
553 aa  77.8  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8249  transposase  50 
 
 
553 aa  77.8  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0522  IS66 family element, orf3  47.83 
 
 
523 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.615968  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3310  hypothetical protein  48.44 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.435551 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3508  hypothetical protein  50 
 
 
275 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332325  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  52.86 
 
 
529 aa  73.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3306  hypothetical protein  53.85 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657369 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4782  transposase IS66  53.23 
 
 
530 aa  70.5  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4154  putative transposase  42.03 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9623  transposase  47.54 
 
 
539 aa  68.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264971  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2728  transposase IS66  50 
 
 
545 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0274249  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4788  transposase IS66  50 
 
 
545 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0898  transposase IS66  50 
 
 
545 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.888311  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0711  transposase IS66  50 
 
 
545 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7754  transposase  48.65 
 
 
540 aa  67  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.109481 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4607  transposase and inactivated derivative  49.23 
 
 
149 aa  67  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0215693  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4976  transposase IS66  48.68 
 
 
531 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000420547  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  48.65 
 
 
516 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2893  TnpC protein  49.25 
 
 
75 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.285732  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  53.23 
 
 
520 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2254  transposase IS66  49.28 
 
 
538 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505913  normal  0.0115325 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0728  transposase IS66  45.95 
 
 
540 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340756  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4905  transposase IS66  49.23 
 
 
551 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2042  TnpC protein  49.25 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0089202  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  49.25 
 
 
523 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  49.25 
 
 
523 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  49.25 
 
 
523 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  49.25 
 
 
523 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  49.25 
 
 
523 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  49.25 
 
 
523 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  49.25 
 
 
523 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  48.65 
 
 
556 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1104  TnpC protein  49.25 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0068  transposase IS66  47.95 
 
 
542 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3041  hypothetical protein  46.15 
 
 
69 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5015  transposase IS66  50.77 
 
 
549 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4978  IS66 family insertion sequence transposase protein  45.95 
 
 
549 aa  65.1  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  46.48 
 
 
545 aa  63.9  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  46.48 
 
 
545 aa  63.9  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  46.48 
 
 
545 aa  63.9  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  46.48 
 
 
545 aa  63.9  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  47.69 
 
 
562 aa  63.5  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  44.12 
 
 
545 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0259  transposase  46.58 
 
 
522 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0154331 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  44.12 
 
 
545 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4984  transposase  48.65 
 
 
535 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0805  putative transposase IS66  53.23 
 
 
378 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248518  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5535  transposase IS66  52.38 
 
 
537 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2591  putative transposase, TnpC  51.61 
 
 
524 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4165  transposase IS66  43.08 
 
 
523 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.699531  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0171  transposase IS66  43.08 
 
 
523 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0431  transposase IS66  43.08 
 
 
523 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0146215 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0915  transposase IS66  43.08 
 
 
523 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.137432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1419  transposase IS66  43.08 
 
 
523 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3715  IS66 Orf2 family protein  43.08 
 
 
523 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3722  hypothetical protein  43.08 
 
 
523 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3763  hypothetical protein  43.08 
 
 
523 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.727828  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4305  hypothetical protein  43.08 
 
 
523 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4308  hypothetical protein  43.08 
 
 
523 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3516  IS66 Orf2 family protein  43.08 
 
 
513 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.578775  normal  0.957908 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1585  transposase  45.95 
 
 
226 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0688  transposase  39.73 
 
 
552 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  46.48 
 
 
508 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3593  transposase IS66  44.62 
 
 
404 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.324594  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4540  transposase IS66  44.62 
 
 
337 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1812  hypothetical protein  43.08 
 
 
238 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00550856  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7045  transposase  39.73 
 
 
552 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3126  IS66 family transposase orfB  46.77 
 
 
524 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3407  transposase  39.73 
 
 
552 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  45.07 
 
 
512 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  45.07 
 
 
512 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  45.07 
 
 
512 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0068  IS66 family transposase  45.07 
 
 
512 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  45.07 
 
 
512 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1407  IS66 family transposase  45.07 
 
 
512 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  45.07 
 
 
512 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1760  IS66 family transposase  45.07 
 
 
512 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0839939  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  45.07 
 
 
512 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  45.07 
 
 
512 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  45.07 
 
 
512 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  45.07 
 
 
512 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0609  transposase  44.62 
 
 
527 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1223  IS66 family transposase  50 
 
 
520 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6361  transposase  44.62 
 
 
527 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422327  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>