162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3121 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009467  Acry_3121  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  163  5.9999999999999996e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.10987  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3398  hypothetical protein  76.19 
 
 
74 aa  100  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5512  transposase IS66  43.28 
 
 
290 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499564  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6094  transposase IS66  43.28 
 
 
290 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6364  transposase IS66  43.28 
 
 
524 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39651  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1224  transposase IS66  43.28 
 
 
290 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0108232  normal  0.0928681 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2744  transposase IS66  38.81 
 
 
524 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4328  transposase IS66  38.81 
 
 
524 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4686  transposase IS66  38.81 
 
 
524 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0556  IS66 family orf3  42.37 
 
 
523 aa  57.4  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.433641  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4607  transposase and inactivated derivative  44.44 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0215693  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0522  IS66 family element, orf3  40.68 
 
 
523 aa  53.9  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.615968  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  41.03 
 
 
545 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  41.03 
 
 
545 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  41.03 
 
 
545 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  41.03 
 
 
545 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  38.67 
 
 
545 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5015  transposase IS66  45.83 
 
 
549 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  38.67 
 
 
545 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  43.33 
 
 
510 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  45.71 
 
 
516 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2254  transposase IS66  42.67 
 
 
538 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505913  normal  0.0115325 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0898  transposase IS66  41.67 
 
 
545 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.888311  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2728  transposase IS66  41.67 
 
 
545 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0274249  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4788  transposase IS66  41.67 
 
 
545 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0711  transposase IS66  41.67 
 
 
545 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4905  transposase IS66  43.06 
 
 
551 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  44.07 
 
 
529 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7754  transposase  41.94 
 
 
540 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.109481 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  40 
 
 
562 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4984  transposase  44.44 
 
 
535 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0400  transposase and inactivated derivative  47.83 
 
 
57 aa  47.8  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.215099  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4782  transposase IS66  46.3 
 
 
530 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  42.86 
 
 
556 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  41.43 
 
 
491 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  41.67 
 
 
505 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  41.67 
 
 
505 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  41.67 
 
 
505 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4978  IS66 family insertion sequence transposase protein  42.59 
 
 
549 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0728  transposase IS66  40.3 
 
 
540 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340756  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0068  transposase IS66  36.36 
 
 
542 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3724  hypothetical protein  45.16 
 
 
527 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8249  transposase  39.62 
 
 
553 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8231  transposase  39.62 
 
 
553 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3508  hypothetical protein  41.94 
 
 
275 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332325  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1397  hypothetical protein  50 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0693  transposase  44.44 
 
 
537 aa  45.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0609  transposase  37.04 
 
 
527 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1585  transposase  39.51 
 
 
226 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6361  transposase  37.04 
 
 
527 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422327  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  40.58 
 
 
523 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3310  hypothetical protein  39.62 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.435551 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1812  hypothetical protein  41.82 
 
 
238 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00550856  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  40.58 
 
 
520 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0171  transposase IS66  41.82 
 
 
523 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0431  transposase IS66  41.82 
 
 
523 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0146215 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0915  transposase IS66  41.82 
 
 
523 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.137432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1419  transposase IS66  41.82 
 
 
523 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3715  IS66 Orf2 family protein  41.82 
 
 
523 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3722  hypothetical protein  41.82 
 
 
523 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3763  hypothetical protein  41.82 
 
 
523 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.727828  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4305  hypothetical protein  41.82 
 
 
523 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4308  hypothetical protein  41.82 
 
 
523 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4165  transposase IS66  41.82 
 
 
523 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.699531  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3516  IS66 Orf2 family protein  41.82 
 
 
513 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.578775  normal  0.957908 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4919  hypothetical protein  38.18 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.759352 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0784  transposase IS66  43.4 
 
 
553 aa  43.5  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0014  hypothetical protein  43.4 
 
 
63 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.825989  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2042  TnpC protein  39.13 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0089202  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1104  TnpC protein  39.13 
 
 
191 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7045  transposase  37.5 
 
 
552 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3407  transposase  37.5 
 
 
552 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0688  transposase  37.5 
 
 
552 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  39.13 
 
 
523 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  39.13 
 
 
523 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  39.13 
 
 
523 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  39.13 
 
 
523 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  39.13 
 
 
523 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  39.13 
 
 
523 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3306  hypothetical protein  38.89 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657369 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3593  transposase IS66  35.38 
 
 
404 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.324594  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4540  transposase IS66  35.38 
 
 
337 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6486  transposase IS66  42.59 
 
 
522 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212807  normal  0.436333 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  42.59 
 
 
521 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0611457 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  37.7 
 
 
508 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2893  TnpC protein  35.38 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.285732  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2591  putative transposase, TnpC  40.62 
 
 
524 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6939  transposase IS66  42.86 
 
 
517 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1115  hypothetical protein  38.57 
 
 
92 aa  41.2  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.909664  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3501  ISPpu14, transposase Orf3  44.23 
 
 
511 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3964  ISPpu14, transposase Orf3  44.23 
 
 
511 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0893475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3981  ISPpu14, transposase Orf3  44.23 
 
 
511 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0385183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4439  ISPpu14, transposase Orf3  44.23 
 
 
511 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414491  hitchhiker  0.0000684735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  44.23 
 
 
511 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  44.23 
 
 
511 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4976  transposase IS66  42.86 
 
 
531 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000420547  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  41.3 
 
 
694 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1536  transposase IS66  39.22 
 
 
530 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.881033  normal  0.856435 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  36 
 
 
537 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0037  transposase IS66  44.23 
 
 
511 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.321823 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>