29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1397 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1397  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  130  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2744  transposase IS66  52.27 
 
 		 524 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4686  transposase IS66  50 
 
 		 524 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4328  transposase IS66  50 
 
 		 524 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1224  transposase IS66  52.5 
 
 		 290 aa  52.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0108232  normal  0.0928681 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5512  transposase IS66  52.5 
 
 		 290 aa  52.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6094  transposase IS66  52.5 
 
 		 290 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6364  transposase IS66  52.5 
 
 		 524 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0728  transposase IS66  62.16 
 
 		 540 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0711  transposase IS66  58.33 
 
 		 545 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4788  transposase IS66  58.33 
 
 		 545 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2728  transposase IS66  58.33 
 
 		 545 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0274249  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0898  transposase IS66  58.33 
 
 		 545 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.888311  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3121  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.10987  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  52.78 
 
 		 545 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  52.78 
 
 		 545 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  52.78 
 
 		 545 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  52.78 
 
 		 545 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  52.78 
 
 		 545 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  52.78 
 
 		 545 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0556  IS66 family orf3  52.78 
 
 		 523 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.433641  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0400  transposase and inactivated derivative  45.24 
 
 		 57 aa  41.6  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.215099  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0068  transposase IS66  54.29 
 
 		 542 aa  41.2  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4978  IS66 family insertion sequence transposase protein  45.45 
 
 		 549 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3398  hypothetical protein  41.67 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4607  transposase and inactivated derivative  50 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0215693  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7754  transposase  50 
 
 		 540 aa  40.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6361  transposase  40.43 
 
 		 527 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0609  transposase  40.43 
 
 		 527 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>