More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6364 on replicon NC_009622
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009622  Smed_6364  transposase IS66  100 
 
 		 524 aa  1066    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2744  transposase IS66  90.08 
 
 		 524 aa  972    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4328  transposase IS66  87.98 
 
 		 524 aa  957    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4686  transposase IS66  87.98 
 
 		 524 aa  957    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6094  transposase IS66  99.64 
 
 		 290 aa  565  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5512  transposase IS66  99.29 
 
 		 290 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1224  transposase IS66  99.29 
 
 		 290 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0108232  normal  0.0928681 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0556  IS66 family orf3  50.38 
 
 		 523 aa  513  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.433641  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0522  IS66 family element, orf3  50.19 
 
 		 523 aa  510  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.615968  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5514  transposase IS66  98.38 
 
 		 253 aa  502  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.90828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6097  transposase IS66  98.79 
 
 		 253 aa  504  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1222  transposase IS66  98.38 
 
 		 253 aa  502  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  46.43 
 
 		 505 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  46.43 
 
 		 505 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  46.43 
 
 		 505 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  44.81 
 
 		 510 aa  422  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0693  transposase  46.04 
 
 		 537 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  45.55 
 
 		 529 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0185  IS66 family transposase  43.33 
 
 		 520 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1223  IS66 family transposase  43.33 
 
 		 520 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3724  hypothetical protein  42.28 
 
 		 527 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9623  transposase  39.6 
 
 		 539 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264971  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  39.88 
 
 		 516 aa  329  9e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  39.96 
 
 		 491 aa  321  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0659  transposase IS66  40.09 
 
 		 514 aa  320  6e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  39.29 
 
 		 532 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0171  transposase IS66  38.31 
 
 		 523 aa  319  9e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0431  transposase IS66  38.31 
 
 		 523 aa  319  9e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0146215 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0915  transposase IS66  38.31 
 
 		 523 aa  319  9e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.137432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1419  transposase IS66  38.31 
 
 		 523 aa  319  9e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3715  IS66 Orf2 family protein  38.31 
 
 		 523 aa  319  9e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3722  hypothetical protein  38.31 
 
 		 523 aa  319  9e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3763  hypothetical protein  38.31 
 
 		 523 aa  319  9e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.727828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4305  hypothetical protein  38.31 
 
 		 523 aa  319  9e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4308  hypothetical protein  38.31 
 
 		 523 aa  319  9e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4165  transposase IS66  37.55 
 
 		 523 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.699531  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3516  IS66 Orf2 family protein  38.31 
 
 		 513 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.578775  normal  0.957908 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4782  transposase IS66  38.46 
 
 		 530 aa  318  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  38.91 
 
 		 531 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8249  transposase  37.55 
 
 		 553 aa  314  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8231  transposase  37.55 
 
 		 553 aa  314  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  38.08 
 
 		 523 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  38.08 
 
 		 523 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  38.08 
 
 		 523 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  38.08 
 
 		 523 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  38.08 
 
 		 523 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  38.08 
 
 		 523 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  37.88 
 
 		 523 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5535  transposase IS66  37.5 
 
 		 537 aa  304  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  37.25 
 
 		 508 aa  300  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0711  transposase IS66  36.35 
 
 		 545 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0078  transposase family  35.23 
 
 		 533 aa  294  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  7.38697e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  35.35 
 
 		 545 aa  293  8e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  35.35 
 
 		 545 aa  293  8e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  35.35 
 
 		 545 aa  293  8e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  35.35 
 
 		 545 aa  293  8e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1339  IS66 family element, transposase  34.99 
 
 		 537 aa  292  9e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  36.26 
 
 		 537 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2728  transposase IS66  35.4 
 
 		 545 aa  291  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0274249  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0898  transposase IS66  35.4 
 
 		 545 aa  291  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.888311  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4788  transposase IS66  35.4 
 
 		 545 aa  291  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  37.58 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  34.77 
 
 		 545 aa  290  4e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  35.17 
 
 		 545 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6199  transposase IS66  38.97 
 
 		 549 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.07824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1284  IS66 family element, transposase  35.82 
 
 		 530 aa  288  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3126  IS66 family transposase orfB  35.69 
 
 		 524 aa  288  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4652  IS66 family element, transposase  36.29 
 
 		 512 aa  288  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  37.37 
 
 		 512 aa  288  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>