More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3310 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3310  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  226  6e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.435551 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8231  transposase  83.91 
 
 		 553 aa  159  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8249  transposase  83.91 
 
 		 553 aa  159  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3508  hypothetical protein  86.05 
 
 		 275 aa  158  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332325  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9623  transposase  88.16 
 
 		 539 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264971  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3724  hypothetical protein  58.54 
 
 		 527 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0659  transposase IS66  92 
 
 		 514 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3306  hypothetical protein  58.23 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657369 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0171  transposase IS66  54.43 
 
 		 523 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0431  transposase IS66  54.43 
 
 		 523 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0146215 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0915  transposase IS66  54.43 
 
 		 523 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.137432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1419  transposase IS66  54.43 
 
 		 523 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3715  IS66 Orf2 family protein  54.43 
 
 		 523 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3722  hypothetical protein  54.43 
 
 		 523 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3763  hypothetical protein  54.43 
 
 		 523 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.727828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4305  hypothetical protein  54.43 
 
 		 523 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4308  hypothetical protein  54.43 
 
 		 523 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1812  hypothetical protein  54.43 
 
 		 238 aa  97.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00550856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  53.75 
 
 		 510 aa  97.1  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3516  IS66 Orf2 family protein  54.43 
 
 		 513 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.578775  normal  0.957908 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4165  transposase IS66  53.16 
 
 		 523 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.699531  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4782  transposase IS66  53.75 
 
 		 530 aa  94.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0693  transposase  53.85 
 
 		 537 aa  95.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  53.66 
 
 		 505 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  53.66 
 
 		 505 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  53.66 
 
 		 505 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  52.44 
 
 		 529 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3041  hypothetical protein  58.21 
 
 		 69 aa  91.3  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4154  putative transposase  48.1 
 
 		 176 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0929  transposase IS66  53.42 
 
 		 516 aa  82  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0524356  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0642  transposase IS66  53.42 
 
 		 516 aa  82  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153379  normal  0.0230063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1223  IS66 family transposase  45.88 
 
 		 520 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0185  IS66 family transposase  45.88 
 
 		 520 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2744  transposase IS66  40.74 
 
 		 524 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4328  transposase IS66  40.74 
 
 		 524 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4686  transposase IS66  40.74 
 
 		 524 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6094  transposase IS66  40.24 
 
 		 290 aa  77.4  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  48.75 
 
 		 523 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5512  transposase IS66  40.24 
 
 		 290 aa  77  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1224  transposase IS66  40.24 
 
 		 290 aa  77  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0108232  normal  0.0928681 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  47.5 
 
 		 523 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  47.5 
 
 		 523 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  47.5 
 
 		 523 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  47.5 
 
 		 523 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  47.5 
 
 		 523 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  47.5 
 
 		 523 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6364  transposase IS66  40.24 
 
 		 524 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2042  TnpC protein  47.5 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0089202  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1104  TnpC protein  47.5 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0259  transposase  41.18 
 
 		 522 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0154331 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0290  transposase family  45.68 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  5.19364e-43  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  45.57 
 
 		 545 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  46.84 
 
 		 545 aa  74.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  46.84 
 
 		 545 aa  74.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  46.84 
 
 		 545 aa  74.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  46.84 
 
 		 545 aa  74.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3398  hypothetical protein  48.44 
 
 		 74 aa  74.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  45.57 
 
 		 545 aa  74.3  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0146  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4652  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  46.75 
 
 		 520 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3384  IS66 family transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1407  IS66 family transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1760  IS66 family transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0839939  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3343  IS66 family transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0038  IS66 family transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0068  IS66 family transposase  44.3 
 
 		 512 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>