More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3306 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3306  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  295  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657369 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  58.74 
 
 		 529 aa  174  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0693  transposase  59.29 
 
 		 537 aa  171  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3724  hypothetical protein  59.7 
 
 		 527 aa  166  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3508  hypothetical protein  55.32 
 
 		 275 aa  155  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332325  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  53.33 
 
 		 505 aa  144  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8249  transposase  52.55 
 
 		 553 aa  143  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  53.33 
 
 		 505 aa  144  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8231  transposase  52.55 
 
 		 553 aa  143  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  53.33 
 
 		 505 aa  144  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4165  transposase IS66  48.55 
 
 		 523 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.699531  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  48.18 
 
 		 510 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0171  transposase IS66  48.55 
 
 		 523 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0431  transposase IS66  48.55 
 
 		 523 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0146215 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0915  transposase IS66  48.55 
 
 		 523 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.137432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1419  transposase IS66  48.55 
 
 		 523 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3516  IS66 Orf2 family protein  48.55 
 
 		 513 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.578775  normal  0.957908 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3715  IS66 Orf2 family protein  48.55 
 
 		 523 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3722  hypothetical protein  48.55 
 
 		 523 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3763  hypothetical protein  48.55 
 
 		 523 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.727828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4305  hypothetical protein  48.55 
 
 		 523 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4308  hypothetical protein  48.55 
 
 		 523 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1812  hypothetical protein  48.55 
 
 		 238 aa  141  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00550856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9623  transposase  54.48 
 
 		 539 aa  140  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264971  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4154  putative transposase  51.2 
 
 		 176 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4782  transposase IS66  49.64 
 
 		 530 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0659  transposase IS66  59.63 
 
 		 514 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0185  IS66 family transposase  45.52 
 
 		 520 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1223  IS66 family transposase  45.52 
 
 		 520 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  42.55 
 
 		 545 aa  120  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  42.55 
 
 		 545 aa  120  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  42.55 
 
 		 545 aa  120  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  42.55 
 
 		 545 aa  120  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0318  transposase IS66  41.84 
 
 		 156 aa  120  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000306018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  45.26 
 
 		 508 aa  120  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  41.13 
 
 		 545 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1982  transposase IS66  41.84 
 
 		 302 aa  119  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.583264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0321  transposase IS66  41.84 
 
 		 526 aa  118  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000571248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0474  transposase IS66  41.84 
 
 		 526 aa  118  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.330634 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0656  transposase IS66  41.84 
 
 		 526 aa  118  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.762551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0662  transposase IS66  41.84 
 
 		 526 aa  118  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0971394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0677  transposase IS66  41.84 
 
 		 526 aa  118  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1790  transposase IS66  41.84 
 
 		 526 aa  118  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0368561  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1976  transposase IS66  41.84 
 
 		 526 aa  118  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.212724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1984  transposase IS66  41.84 
 
 		 526 aa  118  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2184  transposase IS66  41.84 
 
 		 526 aa  118  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000882375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2190  transposase IS66  41.84 
 
 		 526 aa  118  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2596  transposase IS66  41.84 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0682749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3292  transposase IS66  41.84 
 
 		 526 aa  118  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.118311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1224  transposase IS66  44.12 
 
 		 290 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0108232  normal  0.0928681 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2630  transposase IS66  41.84 
 
 		 526 aa  118  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00176311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2663  transposase IS66  41.84 
 
 		 526 aa  118  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3041  hypothetical protein  75.36 
 
 		 69 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5512  transposase IS66  44.12 
 
 		 290 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6094  transposase IS66  44.12 
 
 		 290 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6364  transposase IS66  44.12 
 
 		 524 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4328  transposase IS66  44.12 
 
 		 524 aa  117  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4686  transposase IS66  44.12 
 
 		 524 aa  117  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  40.43 
 
 		 545 aa  117  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0078  transposase family  43.7 
 
 		 533 aa  116  9e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  7.38697e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  44.53 
 
 		 491 aa  115  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0728  transposase IS66  45.26 
 
 		 540 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0711  transposase IS66  44.12 
 
 		 545 aa  114  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4788  transposase IS66  44.12 
 
 		 545 aa  114  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0898  transposase IS66  44.12 
 
 		 545 aa  114  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.888311  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2728  transposase IS66  44.12 
 
 		 545 aa  114  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0274249  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7754  transposase  44.68 
 
 		 540 aa  114  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109481 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  43.07 
 
 		 520 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2591  putative transposase, TnpC  45.26 
 
 		 524 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4978  IS66 family insertion sequence transposase protein  43.57 
 
 		 549 aa  110  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2744  transposase IS66  41.18 
 
 		 524 aa  110  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4607  transposase and inactivated derivative  41.26 
 
 		 149 aa  110  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0215693  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  41.3 
 
 		 517 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0704  transposase IS66  41.13 
 
 		 523 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0762527  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  41.3 
 
 		 519 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  40 
 
 		 531 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  41.3 
 
 		 519 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  39.57 
 
 		 694 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1536  transposase IS66  39.57 
 
 		 530 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.881033  normal  0.856435 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0068  transposase IS66  43.38 
 
 		 542 aa  109  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2123  IS66 family transposase  40 
 
 		 537 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  42.14 
 
 		 516 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  41.61 
 
 		 562 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1339  IS66 family element, transposase  40 
 
 		 537 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0805  putative transposase IS66  43.28 
 
 		 378 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  41.48 
 
 		 532 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1293  transposase  37.41 
 
 		 495 aa  108  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185567  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  38.85 
 
 		 530 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0556  IS66 family orf3  40.88 
 
 		 523 aa  107  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.433641  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1608  transposase family  42.64 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.61911e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0080  transposase  37.41 
 
 		 495 aa  107  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2882  transposase  37.41 
 
 		 495 aa  107  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0046  transposase  37.41 
 
 		 495 aa  107  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539045  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0031  transposase  37.41 
 
 		 495 aa  107  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0069  transposase  37.41 
 
 		 495 aa  107  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2943  transposase  37.41 
 
 		 495 aa  107  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2684  transposase  37.41 
 
 		 495 aa  107  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0678358  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2953  transposase  37.41 
 
 		 495 aa  107  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2753  transposase  37.41 
 
 		 495 aa  107  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0522  IS66 family element, orf3  40.88 
 
 		 523 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.615968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>