More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1608 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1608  transposase family  100 
 
 		 143 aa  297  4e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.61911e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0078  transposase family  96.97 
 
 		 533 aa  275  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  7.38697e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3126  IS66 family transposase orfB  68.33 
 
 		 524 aa  187  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4879  IS66 family transposase  67.5 
 
 		 523 aa  184  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0005  IS66 family transposase  67.5 
 
 		 523 aa  184  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1757  IS66 family transposase  67.5 
 
 		 523 aa  184  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0047  IS66 family transposase  67.5 
 
 		 523 aa  184  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.637398  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0063  IS66 family transposase  67.5 
 
 		 523 aa  184  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.394688  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3368  IS66 family transposase  67.5 
 
 		 523 aa  184  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4656  Aec53  68.6 
 
 		 303 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204904  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0290  transposase family  87.1 
 
 		 124 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  5.19364e-43  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1308  IS66 family element, transposase  59.35 
 
 		 512 aa  167  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.796856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0344  IS66 family element, transposase  59.35 
 
 		 512 aa  167  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2224  IS66 family element, transposase  59.35 
 
 		 512 aa  167  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101822  hitchhiker  0.0000000000417229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2841  IS66 family element, transposase  59.35 
 
 		 512 aa  167  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0678669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4292  IS66 family element, transposase  59.35 
 
 		 512 aa  167  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1812  IS66 family element, transposase  59.35 
 
 		 512 aa  167  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.438062  hitchhiker  0.000000148464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1183  IS66 family element, transposase  59.35 
 
 		 512 aa  167  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5043  IS66 family element, transposase  59.35 
 
 		 512 aa  165  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0118  IS66 family element, transposase  58.54 
 
 		 512 aa  164  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.960295  normal  0.698521 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1651  IS66 family element, transposase  58.54 
 
 		 512 aa  164  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4652  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0146  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0815  IS66 family transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0038  IS66 family transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1760  IS66 family transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0839939  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1407  IS66 family transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0068  IS66 family transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0019  IS66 family transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3343  IS66 family transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4273  ISSfl4 ORF3  58.54 
 
 		 206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4860  IS66 family transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3384  IS66 family transposase  60.83 
 
 		 512 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2123  IS66 family transposase  49.23 
 
 		 537 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2143  IS66 family element, transposase  50.41 
 
 		 517 aa  137  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1339  IS66 family element, transposase  48.46 
 
 		 537 aa  138  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1847  IS66 family element, transposase  50.41 
 
 		 530 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1284  IS66 family element, transposase  50.41 
 
 		 530 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0065  IS66 family element, transposase  50.41 
 
 		 530 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.116785  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2961  IS66 family element, transposase  50.41 
 
 		 530 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.834706  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0906  IS66 family element, transposase  50.41 
 
 		 530 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3899  IS66 family element, transposase  50.41 
 
 		 530 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0255  IS66 family element, transposase  50.41 
 
 		 530 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0023  IS66 family element, transposase  50.41 
 
 		 530 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0847  IS66 family element, transposase  50.41 
 
 		 530 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  44.29 
 
 		 562 aa  136  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4623  IS66 family element, transposase  49.59 
 
 		 530 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0259  transposase  48.33 
 
 		 522 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0154331 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  47.69 
 
 		 491 aa  130  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  50 
 
 		 531 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  47.15 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  47.29 
 
 		 516 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  44.93 
 
 		 545 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  45.93 
 
 		 545 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  45.93 
 
 		 545 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0609  transposase  47.58 
 
 		 527 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  45.93 
 
 		 545 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  45.93 
 
 		 545 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6361  transposase  47.58 
 
 		 527 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  45.19 
 
 		 545 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0784  transposase IS66  45.45 
 
 		 553 aa  128  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4607  transposase and inactivated derivative  44 
 
 		 149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0215693  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  47.69 
 
 		 508 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  45.97 
 
 		 537 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4976  transposase IS66  49.59 
 
 		 531 aa  127  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000420547  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  48.33 
 
 		 523 aa  127  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5535  transposase IS66  45.83 
 
 		 537 aa  127  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>