More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1812 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0171  transposase IS66  99.58 
 
 
523 aa  494  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0431  transposase IS66  99.58 
 
 
523 aa  494  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0146215 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0915  transposase IS66  99.58 
 
 
523 aa  494  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.137432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1419  transposase IS66  99.58 
 
 
523 aa  494  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1812  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00550856  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3715  IS66 Orf2 family protein  99.58 
 
 
523 aa  494  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3722  hypothetical protein  99.58 
 
 
523 aa  494  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3763  hypothetical protein  99.58 
 
 
523 aa  494  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.727828  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4305  hypothetical protein  99.58 
 
 
523 aa  494  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4308  hypothetical protein  99.58 
 
 
523 aa  494  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3516  IS66 Orf2 family protein  99.58 
 
 
513 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.578775  normal  0.957908 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4165  transposase IS66  97.87 
 
 
523 aa  481  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.699531  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3724  hypothetical protein  50.64 
 
 
527 aa  228  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3508  hypothetical protein  48.72 
 
 
275 aa  228  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332325  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  48.72 
 
 
510 aa  225  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  47.01 
 
 
529 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0693  transposase  45.11 
 
 
537 aa  218  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8249  transposase  44.87 
 
 
553 aa  213  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8231  transposase  44.87 
 
 
553 aa  213  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  49.15 
 
 
505 aa  211  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  49.15 
 
 
505 aa  211  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  49.15 
 
 
505 aa  211  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9623  transposase  46.32 
 
 
539 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264971  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0659  transposase IS66  47.57 
 
 
514 aa  192  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0185  IS66 family transposase  41.1 
 
 
520 aa  187  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1223  IS66 family transposase  41.1 
 
 
520 aa  187  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4782  transposase IS66  41.63 
 
 
530 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6094  transposase IS66  38.4 
 
 
290 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1224  transposase IS66  38.4 
 
 
290 aa  175  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0108232  normal  0.0928681 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  40.6 
 
 
508 aa  175  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5512  transposase IS66  38.4 
 
 
290 aa  175  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499564  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3983  transposase IS66  49.11 
 
 
461 aa  174  9e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6364  transposase IS66  37.97 
 
 
524 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39651  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0898  transposase IS66  43.4 
 
 
545 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.888311  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2728  transposase IS66  43.4 
 
 
545 aa  171  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0274249  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4788  transposase IS66  43.4 
 
 
545 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0728  transposase IS66  40 
 
 
540 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340756  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0711  transposase IS66  42.65 
 
 
545 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4328  transposase IS66  36.71 
 
 
524 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4686  transposase IS66  36.71 
 
 
524 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  38.79 
 
 
523 aa  169  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  38.79 
 
 
523 aa  169  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  38.79 
 
 
523 aa  169  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  38.79 
 
 
523 aa  169  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  38.79 
 
 
523 aa  169  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  38.79 
 
 
523 aa  169  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0609  transposase  36.44 
 
 
527 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6361  transposase  36.44 
 
 
527 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422327  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  38.36 
 
 
523 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2744  transposase IS66  36.29 
 
 
524 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  39.15 
 
 
520 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0522  IS66 family element, orf3  37.45 
 
 
523 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.615968  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4976  transposase IS66  39.32 
 
 
531 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000420547  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0556  IS66 family orf3  37.45 
 
 
523 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.433641  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  38.03 
 
 
545 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  38.4 
 
 
491 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  36.69 
 
 
562 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  38.03 
 
 
545 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4984  transposase  38.03 
 
 
535 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0805  putative transposase IS66  38.79 
 
 
378 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248518  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  37.61 
 
 
545 aa  159  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  37.61 
 
 
545 aa  159  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  37.61 
 
 
545 aa  159  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  37.61 
 
 
545 aa  159  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0784  transposase IS66  37.25 
 
 
553 aa  158  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4652  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0146  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  39.57 
 
 
512 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  37.77 
 
 
556 aa  156  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>