More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3041 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3041  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  144  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3306  hypothetical protein  75.36 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657369 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  71.01 
 
 		 529 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3724  hypothetical protein  67.69 
 
 		 527 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0693  transposase  66.67 
 
 		 537 aa  100  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3508  hypothetical protein  60.29 
 
 		 275 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332325  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3310  hypothetical protein  58.21 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.435551 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8249  transposase  62.5 
 
 		 553 aa  89.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8231  transposase  62.5 
 
 		 553 aa  89.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4154  putative transposase  55.07 
 
 		 176 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  61.54 
 
 		 510 aa  88.6  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  61.54 
 
 		 505 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  61.54 
 
 		 505 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  61.54 
 
 		 505 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4165  transposase IS66  57.58 
 
 		 523 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.699531  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9623  transposase  60.66 
 
 		 539 aa  82.4  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264971  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0171  transposase IS66  57.58 
 
 		 523 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0431  transposase IS66  57.58 
 
 		 523 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0146215 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0915  transposase IS66  57.58 
 
 		 523 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.137432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1419  transposase IS66  57.58 
 
 		 523 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3516  IS66 Orf2 family protein  57.58 
 
 		 513 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.578775  normal  0.957908 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3715  IS66 Orf2 family protein  57.58 
 
 		 523 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3722  hypothetical protein  57.58 
 
 		 523 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3763  hypothetical protein  57.58 
 
 		 523 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.727828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4305  hypothetical protein  57.58 
 
 		 523 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4308  hypothetical protein  57.58 
 
 		 523 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1812  hypothetical protein  57.58 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00550856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4782  transposase IS66  52.31 
 
 		 530 aa  77  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2591  putative transposase, TnpC  55.38 
 
 		 524 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0185  IS66 family transposase  49.21 
 
 		 520 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1223  IS66 family transposase  49.21 
 
 		 520 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4919  hypothetical protein  50.75 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.759352 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  57.14 
 
 		 520 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  54.69 
 
 		 491 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  46.38 
 
 		 545 aa  67.4  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4976  transposase IS66  52.31 
 
 		 531 aa  67  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000420547  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  46.38 
 
 		 545 aa  67.4  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  46.38 
 
 		 545 aa  67.4  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  46.38 
 
 		 545 aa  67.4  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  46.38 
 
 		 545 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  46.38 
 
 		 545 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0805  putative transposase IS66  53.85 
 
 		 378 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  50 
 
 		 516 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7754  transposase  50.72 
 
 		 540 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4978  IS66 family insertion sequence transposase protein  51.47 
 
 		 549 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3398  hypothetical protein  46.15 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0659  transposase IS66  75 
 
 		 514 aa  64.7  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3964  transposase IS66  50 
 
 		 514 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3331  transposase IS66  50 
 
 		 514 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3926  transposase IS66  50 
 
 		 514 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  50.77 
 
 		 508 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6486  transposase IS66  45.59 
 
 		 522 aa  62.8  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212807  normal  0.436333 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  45.59 
 
 		 521 aa  62.8  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0611457 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2893  TnpC protein  50.79 
 
 		 75 aa  62  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.285732  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0259  transposase  50.77 
 
 		 522 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0154331 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2538  transposase IS66  50 
 
 		 487 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0026  transposase IS66  50 
 
 		 487 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  47.69 
 
 		 556 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2728  transposase IS66  46.27 
 
 		 545 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0274249  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2042  TnpC protein  50.79 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0089202  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  50.79 
 
 		 523 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0068  transposase IS66  44.78 
 
 		 542 aa  61.6  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4788  transposase IS66  46.27 
 
 		 545 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0898  transposase IS66  46.27 
 
 		 545 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.888311  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0711  transposase IS66  46.27 
 
 		 545 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  47.62 
 
 		 531 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4328  transposase IS66  41.79 
 
 		 524 aa  61.2  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1104  TnpC protein  50.79 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  50.79 
 
 		 523 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  50.79 
 
 		 523 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  50.79 
 
 		 523 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  50.79 
 
 		 523 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  50.79 
 
 		 523 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0290  transposase family  44.62 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  5.19364e-43  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4686  transposase IS66  41.79 
 
 		 524 aa  61.2  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  49.21 
 
 		 512 aa  60.8  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1339  IS66 family element, transposase  43.75 
 
 		 537 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0847  IS66 family element, transposase  43.75 
 
 		 530 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  50.79 
 
 		 523 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1760  IS66 family transposase  47.69 
 
 		 512 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0839939  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3899  IS66 family element, transposase  43.75 
 
 		 530 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1847  IS66 family element, transposase  43.75 
 
 		 530 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4652  IS66 family element, transposase  49.21 
 
 		 512 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2961  IS66 family element, transposase  43.75 
 
 		 530 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.834706  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0019  IS66 family transposase  47.69 
 
 		 512 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0065  IS66 family element, transposase  43.75 
 
 		 530 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.116785  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0038  IS66 family transposase  47.69 
 
 		 512 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0068  IS66 family transposase  47.69 
 
 		 512 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3678  transposase IS66  46.97 
 
 		 515 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0906  IS66 family element, transposase  43.75 
 
 		 530 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2123  IS66 family transposase  43.75 
 
 		 537 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3384  IS66 family transposase  47.69 
 
 		 512 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3343  IS66 family transposase  47.69 
 
 		 512 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1407  IS66 family transposase  47.69 
 
 		 512 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0023  IS66 family element, transposase  43.75 
 
 		 530 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4860  IS66 family transposase  47.69 
 
 		 512 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0815  IS66 family transposase  47.69 
 
 		 512 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0255  IS66 family element, transposase  43.75 
 
 		 530 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1284  IS66 family element, transposase  43.75 
 
 		 530 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0146  IS66 family element, transposase  49.21 
 
 		 512 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>