More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4154 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007490  RSP_4154  putative transposase  100 
 
 
176 aa  356  8e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  57.02 
 
 
510 aa  154  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4165  transposase IS66  59.02 
 
 
523 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.699531  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0171  transposase IS66  58.54 
 
 
523 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0431  transposase IS66  58.54 
 
 
523 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0146215 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0915  transposase IS66  58.54 
 
 
523 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.137432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1419  transposase IS66  58.54 
 
 
523 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3715  IS66 Orf2 family protein  58.54 
 
 
523 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3722  hypothetical protein  58.54 
 
 
523 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3763  hypothetical protein  58.54 
 
 
523 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.727828  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4305  hypothetical protein  58.54 
 
 
523 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4308  hypothetical protein  58.54 
 
 
523 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1812  hypothetical protein  58.54 
 
 
238 aa  147  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00550856  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3516  IS66 Orf2 family protein  58.54 
 
 
513 aa  147  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.578775  normal  0.957908 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  54.55 
 
 
505 aa  144  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  54.55 
 
 
505 aa  144  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  54.55 
 
 
505 aa  144  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3306  hypothetical protein  51.2 
 
 
143 aa  140  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657369 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3724  hypothetical protein  48.84 
 
 
527 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0693  transposase  51.61 
 
 
537 aa  139  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  52.5 
 
 
529 aa  137  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0185  IS66 family transposase  45.83 
 
 
520 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1223  IS66 family transposase  45.83 
 
 
520 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3508  hypothetical protein  40.26 
 
 
275 aa  117  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332325  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8231  transposase  43.7 
 
 
553 aa  117  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8249  transposase  43.7 
 
 
553 aa  117  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9623  transposase  45.69 
 
 
539 aa  115  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264971  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3331  transposase IS66  49.14 
 
 
514 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3926  transposase IS66  49.14 
 
 
514 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3964  transposase IS66  49.14 
 
 
514 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4782  transposase IS66  45.24 
 
 
530 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0711  transposase IS66  37.75 
 
 
545 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2728  transposase IS66  41.94 
 
 
545 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0274249  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0898  transposase IS66  41.94 
 
 
545 aa  107  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.888311  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4788  transposase IS66  41.94 
 
 
545 aa  107  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0728  transposase IS66  42.62 
 
 
540 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340756  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4328  transposase IS66  47.17 
 
 
524 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4686  transposase IS66  47.17 
 
 
524 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0556  IS66 family orf3  43.86 
 
 
523 aa  106  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.433641  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5512  transposase IS66  43.8 
 
 
290 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499564  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6094  transposase IS66  43.8 
 
 
290 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1224  transposase IS66  43.8 
 
 
290 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0108232  normal  0.0928681 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  42.02 
 
 
508 aa  105  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2744  transposase IS66  46.23 
 
 
524 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0805  putative transposase IS66  40 
 
 
378 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248518  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6364  transposase IS66  42.98 
 
 
524 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39651  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0522  IS66 family element, orf3  42.98 
 
 
523 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.615968  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1812  IS66 family element, transposase  39.83 
 
 
512 aa  101  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.438062  hitchhiker  0.000000148464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  41.18 
 
 
491 aa  101  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2224  IS66 family element, transposase  39.83 
 
 
512 aa  101  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101822  hitchhiker  0.0000000000417229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2841  IS66 family element, transposase  39.83 
 
 
512 aa  101  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0678669  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0344  IS66 family element, transposase  39.83 
 
 
512 aa  101  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1183  IS66 family element, transposase  39.83 
 
 
512 aa  101  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1308  IS66 family element, transposase  39.83 
 
 
512 aa  101  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.796856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4292  IS66 family element, transposase  39.83 
 
 
512 aa  101  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1651  IS66 family element, transposase  39.83 
 
 
512 aa  100  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0118  IS66 family element, transposase  39.83 
 
 
512 aa  100  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.960295  normal  0.698521 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  39.68 
 
 
545 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  39.68 
 
 
545 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  41.03 
 
 
520 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  39.68 
 
 
545 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3678  transposase IS66  43.97 
 
 
515 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  39.68 
 
 
545 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  38.1 
 
 
545 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0068  transposase IS66  42.02 
 
 
542 aa  99.8  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5043  IS66 family element, transposase  39.83 
 
 
512 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0259  transposase  38.46 
 
 
522 aa  99  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0154331 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  38.1 
 
 
545 aa  99  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0784  transposase IS66  41.74 
 
 
553 aa  98.2  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6486  transposase IS66  38.79 
 
 
522 aa  96.7  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212807  normal  0.436333 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0659  transposase IS66  49.45 
 
 
514 aa  97.1  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4273  ISSfl4 ORF3  38.98 
 
 
206 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53324  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  38.79 
 
 
521 aa  96.7  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0611457 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0026  transposase IS66  43.97 
 
 
487 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2538  transposase IS66  43.97 
 
 
487 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5535  transposase IS66  39.02 
 
 
537 aa  95.9  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1585  transposase  38.46 
 
 
226 aa  95.9  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  39.83 
 
 
512 aa  95.1  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  39.83 
 
 
512 aa  95.1  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  39.83 
 
 
512 aa  95.1  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  39.83 
 
 
512 aa  95.1  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  39.83 
 
 
512 aa  95.1  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  39.83 
 
 
512 aa  95.1  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  39.83 
 
 
512 aa  95.1  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  39.83 
 
 
512 aa  95.1  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  39.83 
 
 
512 aa  95.1  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  39.83 
 
 
512 aa  95.1  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  39.83 
 
 
512 aa  95.1  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0038  IS66 family transposase  39.83 
 
 
512 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  39.83 
 
 
512 aa  95.1  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1407  IS66 family transposase  39.83 
 
 
512 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0815  IS66 family transposase  39.83 
 
 
512 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  39.83 
 
 
512 aa  95.1  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  39.83 
 
 
512 aa  95.1  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  39.83 
 
 
512 aa  95.1  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0068  IS66 family transposase  39.83 
 
 
512 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  39.83 
 
 
512 aa  95.1  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4860  IS66 family transposase  39.83 
 
 
512 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3384  IS66 family transposase  39.83 
 
 
512 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  39.83 
 
 
512 aa  95.1  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>