More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0887 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 276 aa  530  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.429644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 		 281 aa  106  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.32 
 
 		 271 aa  105  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.3 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal  0.608264 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.27 
 
 		 281 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.34 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.21 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.98 
 
 		 277 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0283642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 		 282 aa  99  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.901388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.79 
 
 		 271 aa  98.6  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4268  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.18 
 
 		 282 aa  96.7  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0113678 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3093  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.75 
 
 		 259 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.27 
 
 		 255 aa  96.3  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0817  ABC transporter related protein  34.32 
 
 		 492 aa  95.9  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 		 255 aa  95.9  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal  0.124912 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.03 
 
 		 246 aa  95.9  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2561  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 		 279 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.52 
 
 		 329 aa  95.5  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 		 279 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 		 279 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.06 
 
 		 251 aa  95.5  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.616361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  25.58 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.28 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.35 
 
 		 290 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.28 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  32.77 
 
 		 274 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.77 
 
 		 275 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.28 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 		 247 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  28.76 
 
 		 284 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7650  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  34.76 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  28.76 
 
 		 284 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  26.43 
 
 		 274 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 		 263 aa  94  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  28.76 
 
 		 284 aa  94  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.48 
 
 		 281 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5412  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.51 
 
 		 260 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210037  hitchhiker  0.00191971 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.49 
 
 		 238 aa  92.8  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.98825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  32.35 
 
 		 274 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0354  ABC transporter, permease  26.23 
 
 		 265 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.94 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  28.51 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.11 
 
 		 256 aa  91.3  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0491  ABC transporter, permease protein, putative  26.23 
 
 		 257 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4878  putative ABC transporter, permease protein  26.23 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0367  ABC transporter permease  26.23 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0357  ABC transporter, permease  26.23 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0493  putative ABC transporter, permease protein  26.23 
 
 		 257 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0381  ABC transporter permease  26.23 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0446  putative ABC transporter, permease protein  25.91 
 
 		 257 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0424  putative ABC transporter, permease protein  26.23 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 		 273 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.57 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  28.51 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.58 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.26 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1076  ABC transporter-like protein  33.33 
 
 		 488 aa  90.1  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.276573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  27.68 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.93 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5406  ABC transporter membrane spanning protein  30.51 
 
 		 251 aa  90.1  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.408693  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0467  taurine ABC transporter, permease protein, putative  27.36 
 
 		 272 aa  89.7  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1283  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  28.51 
 
 		 252 aa  90.1  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0507526 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.98 
 
 		 252 aa  90.1  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0406  putative taurine ABC transporter, permease protein  27.36 
 
 		 272 aa  89.7  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7221  ABC transporter membrane spanning protein (nitrate/sulfonates)  26.94 
 
 		 282 aa  90.1  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.81 
 
 		 273 aa  89.7  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  30.81 
 
 		 273 aa  89.7  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.09 
 
 		 265 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1975  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.01 
 
 		 267 aa  89.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.59364  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0644  ABC transporter, inner membrane subunit  34.18 
 
 		 238 aa  89.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.58 
 
 		 258 aa  89.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 		 238 aa  89.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0792355  normal  0.132671 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  27.42 
 
 		 263 aa  89  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.58 
 
 		 250 aa  89  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.08 
 
 		 259 aa  89  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318112 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.66 
 
 		 265 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.43 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0637  ABC transporter, permease  27.94 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.23 
 
 		 222 aa  88.6  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.51 
 
 		 256 aa  88.6  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.09 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0804  putative ABC transporter, permease protein  27.94 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22036e-46 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0797  ABC transporter, permease protein, putative  27.94 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  30.8 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0693  ABC transporter permease  27.94 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0637  ABC transporter, permease  27.94 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0727  ABC transporter permease  27.94 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363276  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.22 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.41 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.73 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.58 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.28 
 
 		 278 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0784  putative ABC transporter, permease protein  26.14 
 
 		 250 aa  87  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.11 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  30.71 
 
 		 293 aa  87  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  0.837307 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.5 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000457845  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0881  putative ABC transporter, permease protein  27.45 
 
 		 251 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00328051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>