108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0611 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0611  amidohydrolase  100 
 
 
326 aa  652    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0603  amidohydrolase  37.38 
 
 
382 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2667  amidohydrolase  38.1 
 
 
343 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1568  amidohydrolase  36.96 
 
 
354 aa  176  6e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0690  chlorohydrolase  35.37 
 
 
376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0755  amidohydrolase  35.99 
 
 
339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219334  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2349  amidohydrolase  33.53 
 
 
389 aa  168  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00034804  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0625  chlorohydrolase  35.1 
 
 
372 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2578  amidohydrolase  35.99 
 
 
345 aa  166  4e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.786376  normal  0.942138 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0929  amidohydrolase  33.91 
 
 
338 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10942  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1195  amidohydrolase  37.36 
 
 
348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.216023  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0486  chlorohydrolase family protein  31.25 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1293  chlorohydrolase  34.9 
 
 
372 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1083  amidohydrolase  36.79 
 
 
345 aa  159  7e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.946901  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0198  chlorohydrolase  34.71 
 
 
372 aa  159  8e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0781  amidohydrolase  39.3 
 
 
347 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0322523  normal  0.0439555 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1048  chlorohydrolase  34.86 
 
 
392 aa  154  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.883586  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1381  amidohydrolase  36.61 
 
 
348 aa  150  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.344968 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0849  amidohydrolase  33.69 
 
 
343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0308  hypothetical protein  34.12 
 
 
347 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1613  amidohydrolase  31.51 
 
 
396 aa  126  6e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0050  amidohydrolase  32.78 
 
 
366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352004  normal  0.512598 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1376  amidohydrolase  27.92 
 
 
379 aa  94.4  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.364402  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0218  amidohydrolase  28.52 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0688094 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1050  amidohydrolase  26.95 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.794357 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  25.85 
 
 
420 aa  75.9  0.0000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2158  amidohydrolase  25.99 
 
 
351 aa  69.3  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2000  amidohydrolase  25.78 
 
 
351 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1812  guanine deaminase  27.47 
 
 
444 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00974317  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3663  guanine aminohydrolase  27.61 
 
 
437 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1275  amidohydrolase  34.96 
 
 
399 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  22.47 
 
 
432 aa  58.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4281  guanine deaminase  26.38 
 
 
434 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523934  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02716  guanine deaminase  21.66 
 
 
439 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712282  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3845  guanine deaminase  26.38 
 
 
434 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.397164 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02678  hypothetical protein  21.66 
 
 
439 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.600174  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1794  guanine deaminase  25.77 
 
 
434 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.868706  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0809  amidohydrolase  23.34 
 
 
398 aa  56.2  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1587  guanine deaminase  25.77 
 
 
434 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3607  guanine deaminase  26.38 
 
 
434 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0809  guanine deaminase  21.39 
 
 
438 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3209  guanine deaminase  25 
 
 
438 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0825  guanine deaminase  25 
 
 
438 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4173  guanine deaminase  21.39 
 
 
438 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1708  Atz/Trz family chlorohydrolase  36.44 
 
 
420 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0266273  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3016  guanine deaminase  21.39 
 
 
438 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1896  guanine deaminase  27.88 
 
 
433 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0545  guanine deaminase  27.27 
 
 
428 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3043  guanine deaminase  21.12 
 
 
438 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3717  guanine deaminase  25 
 
 
429 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2299  guanine deaminase  23.78 
 
 
443 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255928  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0293  guanine deaminase  27.27 
 
 
426 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0081  amidohydrolase  24.62 
 
 
513 aa  50.4  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  24.44 
 
 
447 aa  50.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4208  amidohydrolase  31.82 
 
 
416 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00909299  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2250  guanine deaminase  26.82 
 
 
444 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2283  amidohydrolase  28.79 
 
 
473 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44770  guanine deaminase  23.17 
 
 
434 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.828703  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0821  imidazolonepropionase  21.03 
 
 
401 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.3638  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2724  guanine deaminase  29.14 
 
 
425 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0242  imidazolonepropionase  29.31 
 
 
428 aa  48.9  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.61005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22260  guanine deaminase  25.77 
 
 
432 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.119985  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1926  guanine deaminase  26.82 
 
 
444 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0907648  normal  0.0757179 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1241  amidohydrolase  33.33 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29686e-19 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  29.38 
 
 
431 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  29.52 
 
 
440 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1905  guanine deaminase  24.7 
 
 
429 aa  47.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3812  guanine deaminase  23.78 
 
 
434 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  27.15 
 
 
431 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0441  amidohydrolase  22.93 
 
 
384 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2038  amidohydrolase  26.34 
 
 
422 aa  46.6  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984083  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  22.03 
 
 
436 aa  46.6  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1141  imidazolonepropionase  28.04 
 
 
401 aa  46.6  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.775839 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2771  guanine deaminase  25.15 
 
 
428 aa  46.6  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.888774  normal  0.860518 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.67 
 
 
451 aa  46.2  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3326  guanine deaminase  25.98 
 
 
435 aa  46.2  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1645  Atz/Trz family chlorohydrolase  32.77 
 
 
421 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1566  amidohydrolase  27.01 
 
 
411 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1677  guanine deaminase  25.57 
 
 
433 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.67 
 
 
484 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3009  amidohydrolase  33.05 
 
 
414 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  22.35 
 
 
431 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.85 
 
 
442 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4625  guanine deaminase  25.13 
 
 
447 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1688  amidohydrolase  26.42 
 
 
440 aa  44.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.126758 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0399  amidohydrolase  37.18 
 
 
412 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.408969  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  24.47 
 
 
428 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  24.45 
 
 
434 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4872  guanine deaminase  26.22 
 
 
449 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.673098  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1934  imidazolonepropionase  26.06 
 
 
445 aa  44.7  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.754156  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2754  guanine deaminase  23.93 
 
 
433 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.481519 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  22.56 
 
 
444 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1807  guanine deaminase  23.94 
 
 
446 aa  44.3  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0252  amidohydrolase  27.73 
 
 
368 aa  44.3  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00951952  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0047  imidazolonepropionase  26.67 
 
 
413 aa  43.5  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2429  guanine deaminase  28.07 
 
 
431 aa  43.9  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0758  amidohydrolase  25.47 
 
 
442 aa  43.9  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0961  amidohydrolase  34.78 
 
 
413 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0977  guanine deaminase  25.52 
 
 
439 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0414452 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1018  guanine deaminase  25.52 
 
 
439 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>