27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0218 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0218  amidohydrolase  100 
 
 
349 aa  700    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0688094 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2000  amidohydrolase  79.31 
 
 
351 aa  531  1e-150  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1050  amidohydrolase  79.6 
 
 
351 aa  519  1e-146  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.794357 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2158  amidohydrolase  78.16 
 
 
351 aa  501  1e-141  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0050  amidohydrolase  28.4 
 
 
366 aa  96.7  6e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352004  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0611  amidohydrolase  29.24 
 
 
326 aa  91.7  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1568  amidohydrolase  31.43 
 
 
354 aa  78.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0755  amidohydrolase  27.69 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219334  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2667  amidohydrolase  28.71 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0603  amidohydrolase  25.17 
 
 
382 aa  63.5  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1376  amidohydrolase  22.07 
 
 
379 aa  62.8  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.364402  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0929  amidohydrolase  29.48 
 
 
338 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10942  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2349  amidohydrolase  23.78 
 
 
389 aa  62  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00034804  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0625  chlorohydrolase  21.75 
 
 
372 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0486  chlorohydrolase family protein  23.24 
 
 
369 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1381  amidohydrolase  26.35 
 
 
348 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.344968 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1083  amidohydrolase  23.86 
 
 
345 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.946901  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2578  amidohydrolase  28.47 
 
 
345 aa  56.6  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.786376  normal  0.942138 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0690  chlorohydrolase  21.84 
 
 
376 aa  52.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0849  amidohydrolase  26.07 
 
 
343 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1613  amidohydrolase  22 
 
 
396 aa  51.6  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1048  chlorohydrolase  21.7 
 
 
392 aa  50.1  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.883586  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0308  hypothetical protein  24.84 
 
 
347 aa  49.7  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0198  chlorohydrolase  34.69 
 
 
372 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1293  chlorohydrolase  32.04 
 
 
372 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1195  amidohydrolase  26.86 
 
 
348 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.216023  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  25.74 
 
 
439 aa  43.1  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>