44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1381 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1381  amidohydrolase  100 
 
 
348 aa  707    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.344968 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0781  amidohydrolase  56.69 
 
 
347 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0322523  normal  0.0439555 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1195  amidohydrolase  51.61 
 
 
348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.216023  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0849  amidohydrolase  50.15 
 
 
343 aa  318  7e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0308  hypothetical protein  47.76 
 
 
347 aa  288  1e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2667  amidohydrolase  45.82 
 
 
343 aa  231  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0929  amidohydrolase  43.2 
 
 
338 aa  231  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10942  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2349  amidohydrolase  37.43 
 
 
389 aa  219  5e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00034804  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0486  chlorohydrolase family protein  38.84 
 
 
369 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1568  amidohydrolase  42.15 
 
 
354 aa  212  9e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2578  amidohydrolase  39.82 
 
 
345 aa  209  4e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.786376  normal  0.942138 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1083  amidohydrolase  42.34 
 
 
345 aa  206  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.946901  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0755  amidohydrolase  40.42 
 
 
339 aa  206  6e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219334  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0603  amidohydrolase  39.48 
 
 
382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0690  chlorohydrolase  29.82 
 
 
376 aa  165  9e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1293  chlorohydrolase  29.7 
 
 
372 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0198  chlorohydrolase  31.6 
 
 
372 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0625  chlorohydrolase  30.98 
 
 
372 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0611  amidohydrolase  36.61 
 
 
326 aa  150  3e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1048  chlorohydrolase  26.23 
 
 
392 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.883586  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1613  amidohydrolase  28.91 
 
 
396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1376  amidohydrolase  26.67 
 
 
379 aa  102  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.364402  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0050  amidohydrolase  29.6 
 
 
366 aa  89  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352004  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1050  amidohydrolase  26.71 
 
 
351 aa  64.7  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.794357 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2158  amidohydrolase  27.5 
 
 
351 aa  57.4  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2000  amidohydrolase  27.49 
 
 
351 aa  53.1  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0576  amidohydrolase  34.86 
 
 
388 aa  51.2  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0218  amidohydrolase  25.99 
 
 
349 aa  50.8  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0688094 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29960  adenosine deaminase  32.28 
 
 
384 aa  49.3  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.540626 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22117  predicted protein  26.43 
 
 
407 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.701766  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0991  amidohydrolase  24.58 
 
 
413 aa  47  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  25.58 
 
 
432 aa  47.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4607  adenosine deaminase  28.71 
 
 
360 aa  47  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.482782 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0188  adenosine deaminase  28.7 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  23.57 
 
 
420 aa  44.3  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21160  adenosine deaminase  26.92 
 
 
349 aa  44.3  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  26.72 
 
 
444 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3173  adenosine deaminase  31.96 
 
 
337 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523168  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3659  adenosine deaminase  29.45 
 
 
325 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  30.06 
 
 
343 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1827  cytosine deaminase/metal-dependent hydrolase  37.1 
 
 
428 aa  43.9  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0600638  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5106  adenosine deaminase  29.41 
 
 
349 aa  43.5  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582125  normal  0.494241 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0821  imidazolonepropionase  29.03 
 
 
401 aa  43.5  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.3638  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  20.97 
 
 
434 aa  43.1  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>