76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0781 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0781  amidohydrolase  100 
 
 
347 aa  712    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0322523  normal  0.0439555 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1381  amidohydrolase  56.69 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.344968 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1195  amidohydrolase  55.29 
 
 
348 aa  387  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.216023  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0849  amidohydrolase  48.66 
 
 
343 aa  323  2e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0308  hypothetical protein  48.06 
 
 
347 aa  295  7e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1568  amidohydrolase  39.88 
 
 
354 aa  227  3e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0486  chlorohydrolase family protein  37.71 
 
 
369 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0755  amidohydrolase  39.88 
 
 
339 aa  211  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219334  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2578  amidohydrolase  38.82 
 
 
345 aa  207  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.786376  normal  0.942138 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2349  amidohydrolase  35.65 
 
 
389 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00034804  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0929  amidohydrolase  39.46 
 
 
338 aa  191  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10942  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2667  amidohydrolase  36.75 
 
 
343 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1083  amidohydrolase  37.62 
 
 
345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.946901  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0603  amidohydrolase  36.6 
 
 
382 aa  172  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1293  chlorohydrolase  31.58 
 
 
372 aa  163  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1048  chlorohydrolase  28.15 
 
 
392 aa  161  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.883586  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0198  chlorohydrolase  30.08 
 
 
372 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0611  amidohydrolase  39.3 
 
 
326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0690  chlorohydrolase  30.45 
 
 
376 aa  153  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0625  chlorohydrolase  28.97 
 
 
372 aa  153  5e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1613  amidohydrolase  30.14 
 
 
396 aa  147  3e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0050  amidohydrolase  28.91 
 
 
366 aa  102  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352004  normal  0.512598 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1376  amidohydrolase  25.21 
 
 
379 aa  100  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.364402  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  27.5 
 
 
440 aa  64.3  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0576  amidohydrolase  37.23 
 
 
388 aa  56.6  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0188  adenosine deaminase  40.58 
 
 
299 aa  53.5  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2158  amidohydrolase  26.51 
 
 
351 aa  53.1  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2662  adenosine deaminase  32 
 
 
342 aa  53.1  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5106  adenosine deaminase  34.19 
 
 
349 aa  52.8  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582125  normal  0.494241 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3659  adenosine deaminase  27.98 
 
 
325 aa  52.8  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1050  amidohydrolase  25.4 
 
 
351 aa  52.4  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.794357 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0230  adenosine deaminase  27.66 
 
 
332 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.278502  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3344  adenosine deaminase  32.4 
 
 
324 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.5 
 
 
451 aa  49.7  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  27.85 
 
 
434 aa  49.7  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0572  adenosine deaminase  29.82 
 
 
355 aa  49.7  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00357349 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.5 
 
 
484 aa  49.7  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  25.63 
 
 
432 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  20.94 
 
 
426 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1806  amidohydrolase  23.54 
 
 
406 aa  47.8  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29960  adenosine deaminase  35.9 
 
 
384 aa  47.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.540626 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3003  adenosine deaminase  32.56 
 
 
330 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0257915 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2686  adenosine deaminase  35.53 
 
 
342 aa  47  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.806346  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1064  Adenosine deaminase  32.39 
 
 
350 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.718861  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11770  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  36.71 
 
 
449 aa  46.2  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  31.03 
 
 
464 aa  46.2  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  26.6 
 
 
444 aa  46.2  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1827  cytosine deaminase/metal-dependent hydrolase  29.85 
 
 
428 aa  46.2  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0600638  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4468  adenosine deaminase  27.66 
 
 
322 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0771279  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21160  adenosine deaminase  38.57 
 
 
349 aa  46.2  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3597  adenosine deaminase  35.35 
 
 
336 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0591  Guanine deaminase  32.79 
 
 
427 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0264  adenosine deaminase  37.97 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0534  adenosine deaminase  32.84 
 
 
398 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479876  hitchhiker  0.00666941 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  22.92 
 
 
420 aa  45.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  20.17 
 
 
434 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  40.38 
 
 
335 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4180  adenosine deaminase  33.33 
 
 
322 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24030  adenosine deaminase  33.9 
 
 
343 aa  44.7  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3143  adenosine deaminase  36 
 
 
315 aa  44.3  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.44 
 
 
444 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3173  adenosine deaminase  40.3 
 
 
378 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0278183 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  22.49 
 
 
432 aa  43.5  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.22 
 
 
448 aa  43.9  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0042  amidohydrolase  24.05 
 
 
426 aa  43.5  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  32.26 
 
 
326 aa  43.1  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4524  Adenosine deaminase  37.76 
 
 
345 aa  43.5  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.437392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.44 
 
 
444 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0048  adenosine deaminase  31.34 
 
 
393 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2000  amidohydrolase  25.3 
 
 
351 aa  43.1  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0670  adenosine deaminase  32.89 
 
 
358 aa  43.1  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000235929  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2834  amidohydrolase  32.88 
 
 
451 aa  43.1  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2606  guanine deaminase  35.04 
 
 
444 aa  42.7  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1042  hypothetical protein  23.46 
 
 
451 aa  42.7  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289988  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1034  amidohydrolase  25.3 
 
 
424 aa  42.7  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  32.26 
 
 
326 aa  42.7  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>