More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0050 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0050  amidohydrolase  100 
 
 
366 aa  731    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352004  normal  0.512598 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1376  amidohydrolase  41.71 
 
 
379 aa  286  5e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.364402  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1613  amidohydrolase  27.66 
 
 
396 aa  116  5e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0625  chlorohydrolase  29.5 
 
 
372 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0611  amidohydrolase  32.78 
 
 
326 aa  110  5e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1048  chlorohydrolase  27.17 
 
 
392 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.883586  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2578  amidohydrolase  29.26 
 
 
345 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.786376  normal  0.942138 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0690  chlorohydrolase  29.47 
 
 
376 aa  107  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0849  amidohydrolase  28.7 
 
 
343 aa  107  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1083  amidohydrolase  30.34 
 
 
345 aa  105  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.946901  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0198  chlorohydrolase  30.84 
 
 
372 aa  105  9e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1568  amidohydrolase  28.73 
 
 
354 aa  103  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0781  amidohydrolase  28.91 
 
 
347 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0322523  normal  0.0439555 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2667  amidohydrolase  30.11 
 
 
343 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1293  chlorohydrolase  30.22 
 
 
372 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1195  amidohydrolase  26.09 
 
 
348 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.216023  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2349  amidohydrolase  28.66 
 
 
389 aa  98.6  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00034804  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0755  amidohydrolase  31.25 
 
 
339 aa  98.2  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219334  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0929  amidohydrolase  26.01 
 
 
338 aa  95.5  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10942  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0603  amidohydrolase  28.62 
 
 
382 aa  92.8  9e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1381  amidohydrolase  29.6 
 
 
348 aa  89  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.344968 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0308  hypothetical protein  25.44 
 
 
347 aa  89  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1050  amidohydrolase  27.24 
 
 
351 aa  84  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.794357 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0486  chlorohydrolase family protein  25.68 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0218  amidohydrolase  27.46 
 
 
349 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0688094 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2000  amidohydrolase  25.24 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  24.93 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1827  cytosine deaminase/metal-dependent hydrolase  25.07 
 
 
428 aa  69.3  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0600638  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1577  N-ethylammeline chlorohydrolase  35.71 
 
 
455 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0236916  unclonable  0.000000239085 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  39.81 
 
 
484 aa  68.9  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  39.81 
 
 
451 aa  68.9  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  24.58 
 
 
428 aa  67  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2304  Hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  39.78 
 
 
459 aa  65.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000537223  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  24.67 
 
 
432 aa  65.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  22.35 
 
 
436 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2158  amidohydrolase  24.41 
 
 
351 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.74 
 
 
445 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1844  amidohydrolase  24.68 
 
 
405 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  37.86 
 
 
432 aa  64.3  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.14 
 
 
447 aa  64.3  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  30.43 
 
 
656 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  31.16 
 
 
439 aa  63.9  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7024  amidohydrolase  24.41 
 
 
434 aa  63.5  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15770  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.86 
 
 
445 aa  63.5  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  23.03 
 
 
434 aa  63.2  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0947  N-ethylammeline chlorohydrolase  33.98 
 
 
441 aa  62.4  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1906  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.93 
 
 
446 aa  62.4  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0252  amidohydrolase  32.67 
 
 
368 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00951952  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1034  amidohydrolase  33.03 
 
 
424 aa  61.6  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  30.43 
 
 
663 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4866  amidohydrolase  28.37 
 
 
660 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1736  amidohydrolase  36.54 
 
 
455 aa  60.8  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0236  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  23.91 
 
 
451 aa  61.2  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2299  guanine deaminase  28.36 
 
 
443 aa  60.8  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255928  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39210  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  25.52 
 
 
437 aa  60.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.769589  normal  0.540692 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  29.91 
 
 
435 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4281  guanine deaminase  32.67 
 
 
434 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523934  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  30.77 
 
 
441 aa  60.1  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3918  amidohydrolase  23.05 
 
 
442 aa  60.1  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2834  amidohydrolase  28.43 
 
 
451 aa  59.7  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1515  amidohydrolase  27.76 
 
 
429 aa  60.1  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  30.25 
 
 
435 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3649  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.97 
 
 
443 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.53 
 
 
444 aa  59.7  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0841  amidohydrolase  24.12 
 
 
470 aa  59.7  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  30.77 
 
 
435 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3663  guanine aminohydrolase  24.56 
 
 
437 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0042  amidohydrolase  31.15 
 
 
426 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  35.45 
 
 
442 aa  58.9  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  30.77 
 
 
435 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  29.91 
 
 
435 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1743  hydrolase, Atz/Trz family  25.82 
 
 
443 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  29.91 
 
 
435 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1681  chlorohydrolase  29.91 
 
 
435 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00472799  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  32.38 
 
 
428 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1851  amidohydrolase  36.71 
 
 
432 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  29.91 
 
 
435 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  29.91 
 
 
435 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1812  guanine deaminase  23.21 
 
 
444 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00974317  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  29.91 
 
 
435 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3513  amidohydrolase  37.23 
 
 
449 aa  57.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.245268  normal  0.477319 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  24.53 
 
 
431 aa  57.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  32.71 
 
 
434 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1707  amidohydrolase  27.67 
 
 
431 aa  57.4  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000668627  normal  0.0323622 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  32.67 
 
 
439 aa  57.4  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1806  amidohydrolase  23.93 
 
 
406 aa  57.4  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  30.97 
 
 
464 aa  57  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  23.75 
 
 
470 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  23.75 
 
 
470 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  23.75 
 
 
470 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1593  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.41 
 
 
211 aa  57  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  33.72 
 
 
444 aa  56.2  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1794  guanine deaminase  22.4 
 
 
434 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.868706  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6263  formiminoglutamate deiminase  21.74 
 
 
429 aa  56.2  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1427  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  22.74 
 
 
439 aa  56.2  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0458985  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.06 
 
 
476 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.55 
 
 
432 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4181  amidohydrolase  30.77 
 
 
663 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.748776  unclonable  0.000000000471707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3845  guanine deaminase  30.69 
 
 
434 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.397164 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01530  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  31.4 
 
 
452 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.904881  normal  0.929171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>