83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1195 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1195  amidohydrolase  100 
 
 
348 aa  704    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.216023  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0781  amidohydrolase  55.29 
 
 
347 aa  387  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0322523  normal  0.0439555 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0849  amidohydrolase  52.79 
 
 
343 aa  369  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1381  amidohydrolase  51.61 
 
 
348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.344968 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0308  hypothetical protein  46.11 
 
 
347 aa  296  3e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2578  amidohydrolase  41.99 
 
 
345 aa  228  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.786376  normal  0.942138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0486  chlorohydrolase family protein  37.46 
 
 
369 aa  219  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1568  amidohydrolase  39.94 
 
 
354 aa  218  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0755  amidohydrolase  39.51 
 
 
339 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219334  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2667  amidohydrolase  39 
 
 
343 aa  206  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0929  amidohydrolase  41.16 
 
 
338 aa  206  4e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10942  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2349  amidohydrolase  33.8 
 
 
389 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00034804  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1083  amidohydrolase  38.86 
 
 
345 aa  188  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.946901  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0603  amidohydrolase  36.42 
 
 
382 aa  181  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0690  chlorohydrolase  28.23 
 
 
376 aa  166  5e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0611  amidohydrolase  37.36 
 
 
326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1048  chlorohydrolase  28.76 
 
 
392 aa  162  6e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.883586  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0198  chlorohydrolase  29.49 
 
 
372 aa  162  6e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1293  chlorohydrolase  30.72 
 
 
372 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0625  chlorohydrolase  30.37 
 
 
372 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1613  amidohydrolase  28.16 
 
 
396 aa  143  5e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1376  amidohydrolase  25.42 
 
 
379 aa  106  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.364402  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0050  amidohydrolase  26.09 
 
 
366 aa  100  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352004  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4359  adenosine deaminase  31.58 
 
 
357 aa  62.8  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2834  amidohydrolase  39.33 
 
 
451 aa  57  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0809  amidohydrolase  22.8 
 
 
398 aa  52.4  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2081  amidohydrolase  35.48 
 
 
415 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515321  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  23.1 
 
 
426 aa  50.8  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4180  adenosine deaminase  33.33 
 
 
322 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11770  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  38.2 
 
 
449 aa  50.1  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29960  adenosine deaminase  33.93 
 
 
384 aa  50.1  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.540626 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  27.22 
 
 
434 aa  49.7  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1050  amidohydrolase  27.17 
 
 
351 aa  49.7  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.794357 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02716  guanine deaminase  23.21 
 
 
439 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712282  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02678  hypothetical protein  23.21 
 
 
439 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.600174  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01530  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  26.35 
 
 
452 aa  49.3  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.904881  normal  0.929171 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2220  adenosine deaminase  34.23 
 
 
322 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.679535  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3409  amidohydrolase  26.76 
 
 
428 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00196752  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  30 
 
 
440 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3043  guanine deaminase  23.21 
 
 
438 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  24.36 
 
 
432 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.86 
 
 
434 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7586  hypothetical protein  29.03 
 
 
456 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4173  guanine deaminase  23.21 
 
 
438 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4468  adenosine deaminase  32.18 
 
 
322 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0771279  normal  0.525687 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0809  guanine deaminase  23.21 
 
 
438 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0825  guanine deaminase  23.21 
 
 
438 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3209  guanine deaminase  23.21 
 
 
438 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  22.47 
 
 
431 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3016  guanine deaminase  23.21 
 
 
438 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  23.53 
 
 
428 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  23.01 
 
 
433 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  23.78 
 
 
436 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1708  Atz/Trz family chlorohydrolase  30 
 
 
420 aa  47  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0266273  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2984  adenosine deaminase  30.33 
 
 
325 aa  46.6  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208704  normal  0.261493 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0206  hypothetical protein  27.27 
 
 
466 aa  46.2  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3087  amidohydrolase  29.61 
 
 
424 aa  46.2  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000127453 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1827  cytosine deaminase/metal-dependent hydrolase  30.65 
 
 
428 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0600638  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_5107  predicted protein  29.17 
 
 
311 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.172841  normal  0.321448 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1645  Atz/Trz family chlorohydrolase  30.83 
 
 
421 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25670  adenosine deaminase  37.5 
 
 
358 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.362807  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1707  amidohydrolase  23.48 
 
 
431 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000668627  normal  0.0323622 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3659  adenosine deaminase  26.88 
 
 
325 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0465  amidohydrolase  29.58 
 
 
399 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.742317  normal  0.0452938 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2226  amidohydrolase  24.24 
 
 
433 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.306812 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2686  adenosine deaminase  29.86 
 
 
342 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.806346  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1844  amidohydrolase  23.8 
 
 
405 aa  44.7  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1302  N-formimino-L-glutamate deiminase  28.67 
 
 
455 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  30.48 
 
 
316 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0145  amidohydrolase  24.65 
 
 
432 aa  43.5  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0629  adenosine deaminase  31.76 
 
 
328 aa  43.5  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3344  adenosine deaminase  29.55 
 
 
324 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1698  amidohydrolase family protein  32.06 
 
 
477 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  31.31 
 
 
316 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21160  adenosine deaminase  35.42 
 
 
349 aa  43.1  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0661  adenosine deaminase  33.03 
 
 
317 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2936  adenosine deaminase  28.32 
 
 
372 aa  42.7  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000510583  hitchhiker  0.00313698 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  33.33 
 
 
315 aa  42.7  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  33.03 
 
 
317 aa  42.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2000  amidohydrolase  27.41 
 
 
351 aa  42.7  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6921  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.11 
 
 
448 aa  42.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772055  normal  0.983522 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  23.92 
 
 
431 aa  42.7  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0538  adenosine deaminase  24.19 
 
 
340 aa  42.7  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000801372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>