271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29960 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_29960  adenosine deaminase  100 
 
 
384 aa  751    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.540626 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2686  adenosine deaminase  77.01 
 
 
342 aa  488  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.806346  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3173  adenosine deaminase  74.04 
 
 
378 aa  478  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0278183 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0605  adenosine deaminase  72.27 
 
 
340 aa  456  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.624245  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0572  adenosine deaminase  70.75 
 
 
355 aa  441  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00357349 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21160  adenosine deaminase  68.93 
 
 
349 aa  434  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0670  adenosine deaminase  68.04 
 
 
358 aa  426  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000235929  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24030  adenosine deaminase  65.31 
 
 
343 aa  414  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0534  adenosine deaminase  61.01 
 
 
398 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479876  hitchhiker  0.00666941 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5106  adenosine deaminase  61.88 
 
 
349 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582125  normal  0.494241 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2662  adenosine deaminase  59.3 
 
 
342 aa  382  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4359  adenosine deaminase  62.83 
 
 
357 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0674  adenosine deaminase  60.42 
 
 
343 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0226748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1064  Adenosine deaminase  57.48 
 
 
350 aa  358  7e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.718861  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4085  adenosine deaminase  46.71 
 
 
330 aa  252  6e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0629  adenosine deaminase  42.99 
 
 
328 aa  229  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1299  adenosine deaminase  40.65 
 
 
325 aa  212  9e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4458  adenosine deaminase  38.69 
 
 
333 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4180  adenosine deaminase  34.53 
 
 
322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4468  adenosine deaminase  33.43 
 
 
322 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0771279  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0230  adenosine deaminase  33.74 
 
 
332 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.278502  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1355  adenosine deaminase  33.43 
 
 
348 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630896  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6019  adenosine deaminase  34.58 
 
 
342 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3344  adenosine deaminase  33.84 
 
 
324 aa  149  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  27.84 
 
 
326 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  32.55 
 
 
378 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  27.25 
 
 
326 aa  140  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2098  adenosine deaminase  32.65 
 
 
345 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  31.47 
 
 
341 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0278  adenosine deaminase  31.6 
 
 
327 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  31.75 
 
 
341 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  31.47 
 
 
341 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  31.47 
 
 
341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  31.47 
 
 
341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2984  adenosine deaminase  31.78 
 
 
325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208704  normal  0.261493 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3659  adenosine deaminase  33.73 
 
 
325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  31.47 
 
 
341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  31.47 
 
 
341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  31.16 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  29.15 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1925  adenosine deaminase  31.18 
 
 
345 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10145  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3645  adenosine deaminase  35.67 
 
 
336 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  31.29 
 
 
354 aa  133  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0830  adenosine deaminase  32.12 
 
 
331 aa  133  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945663  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2220  adenosine deaminase  32.32 
 
 
322 aa  133  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.679535  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4607  adenosine deaminase  33.14 
 
 
360 aa  133  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.482782 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  30.45 
 
 
341 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2249  adenosine deaminase  30.88 
 
 
345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  31.5 
 
 
340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  33.64 
 
 
366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  32.52 
 
 
353 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  30.77 
 
 
346 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  28.31 
 
 
353 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3706  adenosine deaminase  30.77 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0100  adenosine deaminase  28.7 
 
 
374 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151274 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  30.36 
 
 
350 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  29.12 
 
 
346 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1597  adenosine deaminase  29.85 
 
 
327 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  29.79 
 
 
341 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  31.61 
 
 
343 aa  126  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  29.79 
 
 
341 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0250  adenosine deaminase  29.85 
 
 
327 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  30.38 
 
 
350 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  30.79 
 
 
315 aa  126  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  29.03 
 
 
351 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  32.71 
 
 
334 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  29.94 
 
 
337 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  29.73 
 
 
339 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0661  adenosine deaminase  30.79 
 
 
317 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  30.15 
 
 
316 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3627  adenosine deaminase  29.08 
 
 
331 aa  123  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0456  adenosine deaminase  25.6 
 
 
332 aa  124  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1916  adenosine deaminase  28.45 
 
 
361 aa  123  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  29.23 
 
 
682 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  29.23 
 
 
682 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1983  adenosine deaminase  28.61 
 
 
341 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  29.39 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  30.15 
 
 
315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000497344  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  29.54 
 
 
316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  28.53 
 
 
341 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  30.95 
 
 
340 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4117  adenosine deaminase  28.4 
 
 
331 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4731  adenosine deaminase  28.49 
 
 
331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  30.46 
 
 
317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  29.61 
 
 
349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  27.25 
 
 
335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  27.09 
 
 
341 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0591  adenosine deaminase  30.75 
 
 
315 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0631  adenosine deaminase  30.75 
 
 
318 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218139  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4004  adenosine deaminase  28.4 
 
 
331 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0105  adenosine deaminase  28.14 
 
 
376 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1083  adenosine deaminase  29.36 
 
 
350 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906329  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0116  adenosine deaminase  28.01 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0098  adenosine deaminase  28.31 
 
 
376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  27.11 
 
 
335 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  27.19 
 
 
366 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3912  adenosine deaminase  28.11 
 
 
331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0265646 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0041  adenosine deaminase  28.99 
 
 
332 aa  116  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0085  adenosine deaminase  29.59 
 
 
332 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.18641 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0636  adenosine deaminase  30.22 
 
 
315 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  hitchhiker  0.0000731257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>