67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0308 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0308  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  707    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1195  amidohydrolase  46.11 
 
 
348 aa  296  3e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.216023  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0781  amidohydrolase  48.06 
 
 
347 aa  295  7e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0322523  normal  0.0439555 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1381  amidohydrolase  47.76 
 
 
348 aa  288  1e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.344968 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0849  amidohydrolase  42.9 
 
 
343 aa  277  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2578  amidohydrolase  40.23 
 
 
345 aa  227  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.786376  normal  0.942138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0486  chlorohydrolase family protein  38.35 
 
 
369 aa  216  7e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1568  amidohydrolase  38 
 
 
354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0929  amidohydrolase  39.31 
 
 
338 aa  211  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10942  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0755  amidohydrolase  38.53 
 
 
339 aa  210  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219334  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2349  amidohydrolase  37.5 
 
 
389 aa  206  3e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00034804  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2667  amidohydrolase  37.21 
 
 
343 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1083  amidohydrolase  38.24 
 
 
345 aa  193  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.946901  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0603  amidohydrolase  37.1 
 
 
382 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0690  chlorohydrolase  31.49 
 
 
376 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0198  chlorohydrolase  30.72 
 
 
372 aa  159  5e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1293  chlorohydrolase  31.35 
 
 
372 aa  159  8e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0625  chlorohydrolase  30.41 
 
 
372 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1048  chlorohydrolase  30.15 
 
 
392 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.883586  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0611  amidohydrolase  34.12 
 
 
326 aa  135  7.000000000000001e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1613  amidohydrolase  28.49 
 
 
396 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1376  amidohydrolase  28.82 
 
 
379 aa  108  9.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.364402  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0050  amidohydrolase  25.44 
 
 
366 aa  89  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352004  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1050  amidohydrolase  24.71 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.794357 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  26.51 
 
 
444 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1844  amidohydrolase  26.84 
 
 
405 aa  53.5  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0188  adenosine deaminase  28.28 
 
 
299 aa  53.1  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2158  amidohydrolase  25.73 
 
 
351 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2834  amidohydrolase  27.63 
 
 
451 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  26.46 
 
 
432 aa  50.1  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29960  adenosine deaminase  29.08 
 
 
384 aa  50.1  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.540626 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11770  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  28.48 
 
 
449 aa  49.3  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  26.15 
 
 
428 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2000  amidohydrolase  24.22 
 
 
351 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  33.33 
 
 
451 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0873  cytosine deaminase  30.11 
 
 
457 aa  48.1  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.291965  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6263  formiminoglutamate deiminase  35.48 
 
 
429 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1874  amidohydrolase  30.83 
 
 
432 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  23.64 
 
 
432 aa  47.8  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1827  cytosine deaminase/metal-dependent hydrolase  32.63 
 
 
428 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0600638  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1806  amidohydrolase  25.14 
 
 
406 aa  47.8  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2686  adenosine deaminase  35.29 
 
 
342 aa  47.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.806346  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  33.33 
 
 
484 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5106  adenosine deaminase  29.08 
 
 
349 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582125  normal  0.494241 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0145  amidohydrolase  30.14 
 
 
432 aa  47  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2098  adenosine deaminase  30.51 
 
 
345 aa  46.6  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1515  amidohydrolase  34.88 
 
 
429 aa  46.6  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0534  adenosine deaminase  23.3 
 
 
398 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479876  hitchhiker  0.00666941 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3173  adenosine deaminase  29.79 
 
 
378 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0278183 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  27.61 
 
 
440 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2662  adenosine deaminase  24.18 
 
 
342 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  22.6 
 
 
426 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1064  Adenosine deaminase  29.93 
 
 
350 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.718861  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3185  adenosine deaminase  26.92 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175868  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1198  adenine deaminase  48.48 
 
 
545 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0024  amidohydrolase  33.98 
 
 
299 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1851  amidohydrolase  28.57 
 
 
432 aa  43.5  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0218  amidohydrolase  24.53 
 
 
349 aa  43.5  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0688094 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0184  hypothetical protein  33.61 
 
 
630 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.372497  normal  0.380648 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0572  adenosine deaminase  25.16 
 
 
355 aa  43.1  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00357349 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.32 
 
 
434 aa  43.1  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3037  amidohydrolase  34.04 
 
 
499 aa  43.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1925  adenosine deaminase  30.51 
 
 
345 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10145  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2249  adenosine deaminase  30.51 
 
 
345 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  33.77 
 
 
439 aa  43.1  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3659  adenosine deaminase  30.85 
 
 
325 aa  42.7  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3143  adenosine deaminase  28.7 
 
 
315 aa  42.7  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>