More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3037 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3037  amidohydrolase  100 
 
 
499 aa  1014    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2764  amidohydrolase  37.02 
 
 
481 aa  212  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28262  normal  0.0108865 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5153  amidohydrolase  29.2 
 
 
513 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5277  cytosine deaminase  27.36 
 
 
535 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3497  amidohydrolase  25.34 
 
 
513 aa  136  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.377886  normal  0.816035 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  28.51 
 
 
458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4622  amidohydrolase  26.92 
 
 
490 aa  128  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1577  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.77 
 
 
455 aa  127  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0236916  unclonable  0.000000239085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0260  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.11 
 
 
453 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  27.02 
 
 
432 aa  125  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  38.6 
 
 
428 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  25.56 
 
 
420 aa  125  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  36.84 
 
 
484 aa  124  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  36.84 
 
 
451 aa  124  4e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2080  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.91 
 
 
436 aa  124  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4342  amidohydrolase  29.9 
 
 
483 aa  124  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.295649  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  28.26 
 
 
439 aa  123  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01530  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  28.93 
 
 
452 aa  123  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.904881  normal  0.929171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.38 
 
 
432 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  27.82 
 
 
434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3139  amidohydrolase  27.06 
 
 
461 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5431  chlorohydrolase  25.74 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225763  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  27.16 
 
 
431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2304  Hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.33 
 
 
459 aa  113  7.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000537223  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3425  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.56 
 
 
454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.507053  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.42 
 
 
441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  26.01 
 
 
431 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  28.72 
 
 
444 aa  111  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  28 
 
 
442 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1577  amidohydrolase  26.3 
 
 
466 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  29.3 
 
 
440 aa  110  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3147  amidohydrolase  28.22 
 
 
474 aa  110  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171456  normal  0.0352292 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.11 
 
 
444 aa  110  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3918  amidohydrolase  29.36 
 
 
442 aa  110  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.02 
 
 
439 aa  110  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1262  amidohydrolase  28.73 
 
 
453 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1810  amidohydrolase  26.98 
 
 
473 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3205  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.56 
 
 
461 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1234  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.12 
 
 
446 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.324176 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  27.16 
 
 
430 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.05 
 
 
434 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2224  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.51 
 
 
459 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.890081  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2283  amidohydrolase  28.19 
 
 
473 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2541  amidohydrolase  27.75 
 
 
457 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0448318  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2050  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.85 
 
 
448 aa  107  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  27.68 
 
 
440 aa  107  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  28.18 
 
 
428 aa  107  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.53 
 
 
452 aa  107  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  33.85 
 
 
448 aa  106  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1034  amidohydrolase  36 
 
 
424 aa  105  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1591  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.18 
 
 
461 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3608  amidohydrolase  29.57 
 
 
491 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0839286 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  32.37 
 
 
431 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  27.53 
 
 
432 aa  105  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1707  amidohydrolase  28.75 
 
 
431 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000668627  normal  0.0323622 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1728  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.78 
 
 
452 aa  104  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2404  amidohydrolase  27.85 
 
 
432 aa  104  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4100  amidohydrolase  29.75 
 
 
483 aa  103  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3159  amidohydrolase  25.75 
 
 
447 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0462314 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  26.12 
 
 
435 aa  103  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.86 
 
 
465 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2259  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.2 
 
 
472 aa  103  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283196  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2776  amidohydrolase  28.51 
 
 
457 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0301314  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0197  amidohydrolase  29.02 
 
 
457 aa  103  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00380  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.43 
 
 
449 aa  103  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280018  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2144  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.46 
 
 
455 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0767906  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2226  amidohydrolase  29.24 
 
 
453 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330623 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0765  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.93 
 
 
451 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  25.99 
 
 
433 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.99 
 
 
472 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561971  normal  0.0500608 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  24.94 
 
 
426 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1846  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.43 
 
 
439 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190979  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2445  amidohydrolase  33.2 
 
 
449 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.69 
 
 
470 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  36 
 
 
447 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  28.03 
 
 
435 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  28.03 
 
 
435 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.61 
 
 
451 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3262  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.81 
 
 
457 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  28.03 
 
 
435 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  32.11 
 
 
444 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  28.03 
 
 
435 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3705  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.3 
 
 
451 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2201  N-ethylammeline chlorohydrolase  35.06 
 
 
441 aa  101  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.419012  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.5 
 
 
470 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1486  amidohydrolase  26.21 
 
 
435 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4253  amidohydrolase  25.97 
 
 
478 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0761182  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.09 
 
 
470 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1786  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  32.47 
 
 
450 aa  100  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  25.4 
 
 
462 aa  100  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.5 
 
 
470 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.71 
 
 
444 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.5 
 
 
470 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4071  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.42 
 
 
455 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00785709  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2838  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.99 
 
 
458 aa  100  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  28.03 
 
 
441 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1743  hydrolase, Atz/Trz family  32.19 
 
 
443 aa  100  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  28.03 
 
 
435 aa  100  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1870  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.69 
 
 
470 aa  100  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0172647 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  28.03 
 
 
435 aa  100  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>