More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3497 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3497  amidohydrolase  100 
 
 
513 aa  1046    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.377886  normal  0.816035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5153  amidohydrolase  53.02 
 
 
513 aa  552  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5277  cytosine deaminase  40.91 
 
 
535 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0863  amidohydrolase  30.37 
 
 
509 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal  0.0227657 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4622  amidohydrolase  32.56 
 
 
490 aa  161  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4342  amidohydrolase  31.55 
 
 
483 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.295649  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  27.7 
 
 
447 aa  150  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.9 
 
 
432 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1577  amidohydrolase  29.45 
 
 
466 aa  147  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.58 
 
 
484 aa  146  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  28.03 
 
 
440 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.58 
 
 
451 aa  145  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  28.06 
 
 
431 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  26.43 
 
 
434 aa  143  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2404  amidohydrolase  27.93 
 
 
432 aa  143  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  28.25 
 
 
439 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1826  amidohydrolase family protein  29.31 
 
 
441 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.559084  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1502  amidohydrolase  29.31 
 
 
441 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199734  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3608  amidohydrolase  33.12 
 
 
491 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0839286 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0702  chlorohydrolase family protein  29.4 
 
 
455 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  26.15 
 
 
431 aa  136  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3037  amidohydrolase  25.34 
 
 
499 aa  136  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  26.85 
 
 
433 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  28.99 
 
 
440 aa  134  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  25 
 
 
432 aa  133  6.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2080  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.54 
 
 
436 aa  131  4.0000000000000003e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  27.6 
 
 
442 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  27.23 
 
 
440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  27.23 
 
 
428 aa  129  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  26.33 
 
 
434 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1577  N-ethylammeline chlorohydrolase  26 
 
 
455 aa  127  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0236916  unclonable  0.000000239085 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  24.45 
 
 
431 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  27.05 
 
 
431 aa  125  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  28.71 
 
 
444 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0042  amidohydrolase  26.64 
 
 
426 aa  124  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.62 
 
 
448 aa  124  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1055  amidohydrolase  28.61 
 
 
503 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3055  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.15 
 
 
452 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.43 
 
 
441 aa  123  6e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.51 
 
 
439 aa  123  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0260  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.17 
 
 
453 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  27.54 
 
 
458 aa  123  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.81 
 
 
442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.95 
 
 
444 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2259  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.7 
 
 
472 aa  120  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283196  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0947  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.08 
 
 
441 aa  120  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  23.79 
 
 
445 aa  120  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4253  amidohydrolase  26.77 
 
 
478 aa  120  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0761182  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  28.2 
 
 
656 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.95 
 
 
469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.37 
 
 
472 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561971  normal  0.0500608 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.07 
 
 
449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3147  amidohydrolase  28.41 
 
 
474 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171456  normal  0.0352292 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.52 
 
 
434 aa  118  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  23.27 
 
 
436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.51 
 
 
441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1743  hydrolase, Atz/Trz family  26.73 
 
 
443 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3132  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.73 
 
 
465 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.73 
 
 
444 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2584  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.73 
 
 
465 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934679  normal  0.607445 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  25 
 
 
444 aa  117  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3262  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.73 
 
 
457 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1262  amidohydrolase  29.44 
 
 
453 aa  116  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0914748 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  26.34 
 
 
464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.6 
 
 
465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0556  amidohydrolase  22.88 
 
 
428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  23.65 
 
 
422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.64 
 
 
452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.76 
 
 
465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3139  amidohydrolase  26.59 
 
 
461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3649  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.56 
 
 
443 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2080  amidohydrolase  27.72 
 
 
464 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.785158  hitchhiker  0.00336103 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  23.91 
 
 
431 aa  114  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  26.7 
 
 
430 aa  114  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1475  amidohydrolase domain-containing protein  22.08 
 
 
444 aa  114  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0938308  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf580  cytosine deaminase  21.93 
 
 
435 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.239245  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.16 
 
 
449 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1273  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.4 
 
 
438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1034  amidohydrolase  28.04 
 
 
424 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7024  amidohydrolase  28.48 
 
 
434 aa  113  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  23.04 
 
 
426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01530  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  25.47 
 
 
452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.904881  normal  0.929171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  27.95 
 
 
663 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  26.29 
 
 
445 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.06 
 
 
470 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.06 
 
 
470 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.06 
 
 
470 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28 
 
 
470 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  25.39 
 
 
440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4181  amidohydrolase  29.04 
 
 
663 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.748776  unclonable  0.000000000471707 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3425  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.68 
 
 
454 aa  110  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.507053  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0086  amidohydrolase  23.42 
 
 
422 aa  110  6e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.67 
 
 
470 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3205  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.09 
 
 
461 aa  110  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0145  amidohydrolase  28.61 
 
 
432 aa  110  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3159  amidohydrolase  26.88 
 
 
447 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0462314 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1234  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.2 
 
 
446 aa  110  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.324176 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3705  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.25 
 
 
451 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0765  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.48 
 
 
451 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1906  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.09 
 
 
446 aa  109  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>