More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5153 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5153  amidohydrolase  100 
 
 
513 aa  1055    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3497  amidohydrolase  53.02 
 
 
513 aa  552  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.377886  normal  0.816035 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5277  cytosine deaminase  38.57 
 
 
535 aa  319  6e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1577  amidohydrolase  32.69 
 
 
466 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0863  amidohydrolase  30.19 
 
 
509 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal  0.0227657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3608  amidohydrolase  32.39 
 
 
491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0839286 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4622  amidohydrolase  31.04 
 
 
490 aa  168  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3037  amidohydrolase  29.16 
 
 
499 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  30.87 
 
 
442 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  27.9 
 
 
440 aa  160  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  27.73 
 
 
439 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  27.89 
 
 
447 aa  155  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4342  amidohydrolase  31.1 
 
 
483 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.295649  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.77 
 
 
445 aa  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  31.09 
 
 
449 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  26.25 
 
 
431 aa  148  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  24.7 
 
 
431 aa  147  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  27.66 
 
 
430 aa  147  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  27.96 
 
 
431 aa  147  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.87 
 
 
449 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.89 
 
 
432 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  28.57 
 
 
428 aa  145  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  25.21 
 
 
434 aa  143  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  25.67 
 
 
436 aa  143  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2304  Hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.49 
 
 
459 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000537223  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  27.27 
 
 
432 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01530  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  26.96 
 
 
452 aa  142  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.904881  normal  0.929171 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0702  chlorohydrolase family protein  27.98 
 
 
455 aa  141  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  27.43 
 
 
440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3705  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.24 
 
 
451 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.12 
 
 
451 aa  140  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  26.97 
 
 
458 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.12 
 
 
484 aa  140  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1475  amidohydrolase domain-containing protein  25.16 
 
 
444 aa  140  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0938308  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3139  amidohydrolase  26.27 
 
 
461 aa  140  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.48 
 
 
451 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2283  amidohydrolase  29.91 
 
 
473 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0042  amidohydrolase  27.74 
 
 
426 aa  139  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0765  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.39 
 
 
451 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.95 
 
 
439 aa  138  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2259  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.7 
 
 
472 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283196  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.07 
 
 
452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1140  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.93 
 
 
454 aa  138  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30 
 
 
472 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561971  normal  0.0500608 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  27.05 
 
 
656 aa  137  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5431  chlorohydrolase  25.94 
 
 
466 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225763  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0556  amidohydrolase  24.48 
 
 
428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  26.55 
 
 
440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  25.11 
 
 
433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2404  amidohydrolase  26.07 
 
 
432 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0260  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.35 
 
 
453 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3425  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.89 
 
 
454 aa  135  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.507053  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.3 
 
 
454 aa  134  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.9 
 
 
441 aa  133  6.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00380  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.4 
 
 
449 aa  133  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280018  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.26 
 
 
441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1728  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.17 
 
 
452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3918  amidohydrolase  28.67 
 
 
442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3205  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.85 
 
 
461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0800  amidohydrolase  23.85 
 
 
422 aa  131  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  24.76 
 
 
431 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1707  amidohydrolase  28.5 
 
 
431 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000668627  normal  0.0323622 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2080  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.48 
 
 
436 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  23.39 
 
 
422 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1736  amidohydrolase  24.9 
 
 
455 aa  130  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  25.06 
 
 
434 aa  130  8.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  27.79 
 
 
464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1826  amidohydrolase family protein  30.22 
 
 
441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.559084  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1688  amidohydrolase  27.52 
 
 
440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.126758 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1502  amidohydrolase  30.22 
 
 
441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199734  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0086  amidohydrolase  23.39 
 
 
422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  22.84 
 
 
420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0482  amidohydrolase  27.03 
 
 
416 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.06 
 
 
444 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1055  amidohydrolase  31.56 
 
 
503 aa  127  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3248  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.65 
 
 
452 aa  127  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  23.39 
 
 
422 aa  127  7e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3055  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.07 
 
 
452 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3262  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.8 
 
 
457 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1260  amidohydrolase  22.35 
 
 
427 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1577  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.59 
 
 
455 aa  125  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0236916  unclonable  0.000000239085 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.78 
 
 
469 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  26.22 
 
 
663 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  23.77 
 
 
431 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  27.07 
 
 
462 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1326  putative amidohydrolase  25.44 
 
 
469 aa  124  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183481  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  23.54 
 
 
434 aa  124  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1247  amidohydrolase  27.78 
 
 
464 aa  124  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.092171 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1376  amidohydrolase  23 
 
 
427 aa  124  5e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000571224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3649  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.64 
 
 
443 aa  123  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3129  amidohydrolase  27.56 
 
 
434 aa  123  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.611034  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.88 
 
 
448 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0896  amidohydrolase  25.94 
 
 
468 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2080  amidohydrolase  27.78 
 
 
464 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.785158  hitchhiker  0.00336103 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  23.26 
 
 
428 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  24.61 
 
 
435 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  24.21 
 
 
426 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1743  hydrolase, Atz/Trz family  27.58 
 
 
443 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  27.88 
 
 
444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1575  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.13 
 
 
447 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>