More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4622 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4622  amidohydrolase  100 
 
 		 490 aa  969    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5153  amidohydrolase  31.85 
 
 		 513 aa  190  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3497  amidohydrolase  33.03 
 
 		 513 aa  179  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.377886  normal  0.816035 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5277  cytosine deaminase  28.7 
 
 		 535 aa  151  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3608  amidohydrolase  34.46 
 
 		 491 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0839286 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3037  amidohydrolase  26.92 
 
 		 499 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  28.06 
 
 		 431 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4342  amidohydrolase  31.68 
 
 		 483 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.295649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1055  amidohydrolase  32.93 
 
 		 503 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  30.18 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2404  amidohydrolase  30.62 
 
 		 432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.35 
 
 		 432 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  27.1 
 
 		 440 aa  122  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  25.59 
 
 		 431 aa  121  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.87 
 
 		 451 aa  120  6e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3055  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.21 
 
 		 452 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.87 
 
 		 484 aa  120  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0758  amidohydrolase  26.93 
 
 		 442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1688  amidohydrolase  29.04 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.126758 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.17 
 
 		 476 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1577  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.18 
 
 		 455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0236916  unclonable  0.000000239085 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.17 
 
 		 500 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.17 
 
 		 476 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2584  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.98 
 
 		 465 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934679  normal  0.607445 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  27.54 
 
 		 439 aa  117  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  27.07 
 
 		 447 aa  117  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  24.58 
 
 		 434 aa  116  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  27.48 
 
 		 440 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3132  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.98 
 
 		 465 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1577  amidohydrolase  29.77 
 
 		 466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  27.92 
 
 		 656 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  27.14 
 
 		 431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2038  amidohydrolase  25.67 
 
 		 422 aa  114  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984083  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1591  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.33 
 
 		 461 aa  114  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0947  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.52 
 
 		 441 aa  113  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.63 
 
 		 470 aa  114  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00380  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.38 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280018  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1486  amidohydrolase  28.35 
 
 		 435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3262  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.3 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  27.57 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.24 
 
 		 434 aa  110  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  23.22 
 
 		 431 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1707  amidohydrolase  29.88 
 
 		 431 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000668627  normal  0.0323622 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.11 
 
 		 465 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  27.27 
 
 		 663 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1575  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.69 
 
 		 447 aa  109  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  26.23 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11770  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  27.77 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  27.05 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2304  Hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  23.21 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000537223  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01530  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  27.25 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.904881  normal  0.929171 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  24.87 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  26 
 
 		 433 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.64 
 
 		 470 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.95 
 
 		 470 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.95 
 
 		 470 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0042  amidohydrolase  27.99 
 
 		 426 aa  107  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1632  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.7 
 
 		 447 aa  107  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1140  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.99 
 
 		 454 aa  107  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  24.19 
 
 		 428 aa  106  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0559  chlorohydrolase family protein  26.57 
 
 		 381 aa  106  9e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1054  hypothetical protein  26.68 
 
 		 434 aa  106  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.587451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.68 
 
 		 465 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1566  amidohydrolase  25.06 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.41 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  24.26 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.12 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.95 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4866  amidohydrolase  25.65 
 
 		 660 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.88 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1294  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.81 
 
 		 493 aa  104  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1870  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.95 
 
 		 470 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0172647 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  26.23 
 
 		 430 aa  103  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.85 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4181  amidohydrolase  26.68 
 
 		 663 aa  103  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.748776  unclonable  0.000000000471707 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0863  amidohydrolase  29.62 
 
 		 509 aa  103  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal  0.0227657 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3150  amidohydrolase  32.14 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0917954  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.11 
 
 		 470 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1743  hydrolase, Atz/Trz family  29.52 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0556  amidohydrolase  22.75 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2119  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.72 
 
 		 474 aa  101  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2259  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.94 
 
 		 472 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1186  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.66 
 
 		 467 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000010565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3649  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.18 
 
 		 443 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  23.58 
 
 		 435 aa  100  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1087  amidohydrolase  27.19 
 
 		 435 aa  100  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  22.63 
 
 		 420 aa  100  8e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  24.07 
 
 		 432 aa  99.8  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1957  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  27.27 
 
 		 441 aa  99.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.157555 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1915  amidohydrolase  25 
 
 		 421 aa  99.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232567  normal  0.102109 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.85 
 
 		 444 aa  98.2  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2741  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.61 
 
 		 447 aa  97.8  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0482  amidohydrolase  25.64 
 
 		 416 aa  97.8  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3147  amidohydrolase  28.68 
 
 		 474 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171456  normal  0.0352292 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  27.17 
 
 		 442 aa  97.8  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  28 
 
 		 442 aa  97.4  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1806  amidohydrolase  24.74 
 
 		 406 aa  97.4  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2445  amidohydrolase  26.01 
 
 		 449 aa  97.1  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7586  hypothetical protein  29.24 
 
 		 456 aa  96.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2226  amidohydrolase  27.62 
 
 		 433 aa  96.7  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.306812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>