More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3608 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3608  amidohydrolase  100 
 
 
491 aa  937    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0839286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5153  amidohydrolase  31.81 
 
 
513 aa  193  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5277  cytosine deaminase  34.64 
 
 
535 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3497  amidohydrolase  32.53 
 
 
513 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.377886  normal  0.816035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1577  amidohydrolase  30.82 
 
 
466 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4622  amidohydrolase  34.18 
 
 
490 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4342  amidohydrolase  33.33 
 
 
483 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.295649  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  27.91 
 
 
431 aa  126  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2226  amidohydrolase  29.72 
 
 
433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.306812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0863  amidohydrolase  29.7 
 
 
509 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal  0.0227657 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3037  amidohydrolase  28.33 
 
 
499 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.32 
 
 
432 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.78 
 
 
434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1707  amidohydrolase  31.18 
 
 
431 aa  113  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000668627  normal  0.0323622 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  24.28 
 
 
428 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  24.53 
 
 
436 aa  111  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1055  amidohydrolase  33.05 
 
 
503 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  27.75 
 
 
428 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  26.08 
 
 
426 aa  108  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3705  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.64 
 
 
451 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  29.95 
 
 
440 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  26.02 
 
 
431 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3205  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.34 
 
 
461 aa  106  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  26.32 
 
 
431 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  24.4 
 
 
431 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3055  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.3 
 
 
452 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1806  amidohydrolase  26.77 
 
 
406 aa  103  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1915  amidohydrolase  28.81 
 
 
421 aa  103  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232567  normal  0.102109 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  27.35 
 
 
434 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  24.24 
 
 
434 aa  103  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2144  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.64 
 
 
455 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0767906  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  31.12 
 
 
449 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  31.92 
 
 
449 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2584  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.8 
 
 
465 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934679  normal  0.607445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3262  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.8 
 
 
457 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3425  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.36 
 
 
454 aa  100  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.507053  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3132  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.8 
 
 
465 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  31.14 
 
 
451 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  28.67 
 
 
447 aa  99.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1906  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.45 
 
 
446 aa  99  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  28.89 
 
 
439 aa  98.2  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.46 
 
 
441 aa  97.4  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1780  N-formimino-L-glutamate deiminase  29.55 
 
 
452 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1262  amidohydrolase  28.29 
 
 
453 aa  96.7  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  25.9 
 
 
433 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.86 
 
 
452 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2016  amidohydrolase  30.21 
 
 
481 aa  95.9  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4918  amidohydrolase  29.5 
 
 
441 aa  95.5  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0118051  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0782  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.95 
 
 
460 aa  95.5  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.026744  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1087  amidohydrolase  27.92 
 
 
435 aa  95.5  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.61 
 
 
442 aa  94.7  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  27.88 
 
 
440 aa  94  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.33 
 
 
444 aa  94  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  26.58 
 
 
445 aa  93.6  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1591  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.38 
 
 
461 aa  93.6  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1645  amidohydrolase  28.57 
 
 
438 aa  93.6  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1844  amidohydrolase  26.65 
 
 
405 aa  92.8  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1111  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.33 
 
 
458 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.74 
 
 
444 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  29.63 
 
 
458 aa  93.2  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.51 
 
 
454 aa  92  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.3 
 
 
451 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1140  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.22 
 
 
454 aa  92  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  27.56 
 
 
656 aa  92.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0569  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.48 
 
 
465 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172488  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  30.28 
 
 
444 aa  91.7  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0632  amidohydrolase  35.37 
 
 
460 aa  91.3  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979891  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1294  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.98 
 
 
493 aa  91.3  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  28.1 
 
 
442 aa  90.9  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.21 
 
 
441 aa  90.9  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7024  amidohydrolase  29.19 
 
 
434 aa  90.5  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  23.6 
 
 
431 aa  90.1  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4071  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.09 
 
 
455 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00785709  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0765  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.19 
 
 
451 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0596  N-formimino-L-glutamate deiminase  32.89 
 
 
465 aa  90.1  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4101  amidohydrolase  27.71 
 
 
452 aa  89.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104689 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7136  amidohydrolase  28.92 
 
 
461 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3605  amidohydrolase  29.3 
 
 
460 aa  89.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361242  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39210  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  35.77 
 
 
437 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.769589  normal  0.540692 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3081  amidohydrolase  32.69 
 
 
464 aa  89  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1234  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.78 
 
 
446 aa  89  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.324176 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2838  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  31.58 
 
 
458 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0042  amidohydrolase  25.54 
 
 
426 aa  87.8  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1688  amidohydrolase  30.56 
 
 
440 aa  87.8  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.126758 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3150  amidohydrolase  30.74 
 
 
492 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0917954  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2773  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.4 
 
 
446 aa  87.8  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  26.67 
 
 
435 aa  87  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  26.67 
 
 
435 aa  87  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2224  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.94 
 
 
459 aa  86.7  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.890081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  26.25 
 
 
441 aa  86.7  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  20.96 
 
 
420 aa  86.7  9e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  28.96 
 
 
663 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0549  amidohydrolase  26.79 
 
 
425 aa  86.3  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000560695  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3616  formiminoglutamate deiminase  29.45 
 
 
452 aa  85.9  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0953492  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  26.63 
 
 
432 aa  86.3  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  26.42 
 
 
435 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.24 
 
 
451 aa  85.5  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1786  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.91 
 
 
450 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  26.42 
 
 
435 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0604  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.03 
 
 
465 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>